Sigma-Aldrich中国

亚结构搜索

开始:
亚结构搜索功能让您可以通过化学品的结构式来查找产品。您只需在我们提供的编辑器中画出您所需要的化学品的化学结构式或者结构片段,然后点击Search按钮即可进行搜索。

对搜索结果排序:
默认情况下搜索结果是按照分子量来排序的, 但您也可以根据以下条件重新排序:


· 相关度 — 以tanimoto系数为依据的相关度系数
· 化学名 — 分子的常用化学名
· IUPAC — 根据International Union of Pure and Applied Chemistry(IUPAC)制定的命名原则所作的系统命名
· CAS # — 美国化学文摘社所指定的注册登记号
· MDL # — MDL Information Systems所指定的注册登记号

输出搜索结果:
点击亚结构搜索结果页面右上角的“Exprot(输出)”按钮可以将搜索结果列表及其化学名称、物理性质、注册登记号和产品货号根据MDL Information Systems的CTFile规格以标准的SDF(Structure Data File,可以用DS ViewerPro Trial软件打开)格式的文件输出。SDF文件可以被导入标准的结构式管理系统中以便您在自己的系统中作进一步搜索。

通过Sigma-Aldrich验证的客户可以在签订数据使用协议后得到我们完整的产品结构数据文件(SDF格式)。您可以写信至orderCN@sial.com提出您的请求。

支持的浏览器:
Microsoft Internet Explorer 5.0 以上
Netscape Navigator 4.5以上(6.0以上更佳)

支持的操作环境:
所有支持Java的操作系统。(Macintosh系统只支持Netscape Navigator 6.0 以上版本)。

搜索支持:
· 精确搜索 — 对所查询的结构式进行精确搜索
· 亚结构 — 搜索所有包含所查询的结构式的产品
· 立体异构体 — 搜索与所查询的结构式一致的立体异构体
· 同位素产品* — 搜索与所查询的结构式一致的同位素的同位素产品
· 片段 — 搜索含多种成份的结构式(例如盐)
· Markush** — 同Markush搜索仅于金属和卤族
· 互变异构体(Tautomer)— 互变异构体搜索目前尚不支持 

* JME目前尚不支持同位素搜索。欲搜索同位素产品可通过可产生SMILES的程序画出结构式,再复制与粘贴SMILES文本到SMILES搜索中进行。关于SMILES:SMILES是Simplified Molecular Input Line Entry System的简称,可将化学结构用文本框表示。
** Markush查询可使用非标准原子选项搜索,可以使用M来代表金属原子,X来代表卤族原子。.

复制与粘贴:
只有使用SMILES方能支持从您本地计算机的结构式绘制工具中进行复制与粘贴。您可在本地计算机上绘制好结构式,复制成SMILES字符串,然后将其粘贴进我们的结构式搜索工具中的SMILES搜索框中。您可访问Daylight Chemical Information Systems网站查询所有支持SMILES的结构式编辑器。

什么是SMILE?请点击这里

搜索类型
· 亚结桷(2D)— 所查询的结构式为分子结构的部分或片段,立体键将被忽略;
· 亚结构(立体)— 所查询的结构式为分子结构的部分或片段,所有立体键与所绘制的一致;
· 精确搜索(2D)— 所查询的结构式为完整的分子,但所有的立体键将被忽略;
· 精确搜索(立体)— 所查询的结构式为完整的分子,所有立体键与所绘制的一致。

结构式
使用Java Molecular Editor (JME)来绘制要查询的结构。JME是一个Java程序,您的浏览器必须支持Java方能运行此程序。Sigma-Aldrich使用JME得到了Novartis Pharma AG 的Peter Ertl的许可。

 


SMILES
SMILES为Simplified Molecular Input Line Entry Specification的缩写,简化分子线性输入规范,是一种用ASCII字符串明确描述分子结构的规范。由于SMILES用一串字符来描述一个三维化学结构,它LME必然要将化学结构转化成一个生成树,此系统采用纵向优先遍历树算法。转化时,先要去掉氢,还要把环打开。表示时,被拆掉的键端的原子要用数字标记,支链写在小括号里。需要学习更多关于SMILES的知识,请访问SMAILES指南网站:
http://www.daylight.com/dayhtml/doc/theory/theory.smiles.html

化学名称
可以用化学品的部分或完整的化学名称作为结构式的补充,以缩小搜索的范围,IUPAC化学名或者通用化学名都可以使用。

物理性质
物理性质可以作为结构式的补充,用以缩小搜索的范围,可以通过下拉列表选择物理性质种类并填写相关数据(默认界面只显示分子量,您可以通过点击more option来显示更多的物理性质指标)。
· MW — 分子量
· MP — 熔点
· BP — 沸点
· FP — 闪点
· d — 密度

每页显示搜索结果数量
默认情况下每页显示10条结果,但您可以重设为5,10,25或50。

搜索结果总数
默认情况下搜索结果上限为100条,但您可以重设为100,250,500,1000或2000。增加搜索结果总数会延长搜索时间。

保存搜索设置
您需要登录我们的网站方能保存搜索设置。在登录后,请点击亚结构搜索页面上方的“Save Search Criteria(保存搜索设置)”按钮,填写该搜索设置名称,最后点击“Save(保存)”完成对本次搜索设置的保存。

加载搜索设置
您需要登录我们的网站方能加载搜索设置。在登录后,请点击亚结构搜索页面上方的“Load From Save(从已保存的搜索设置中加载)”进入加载设置页面,此页面会显示以下信息:
· 搜索设置名称;
· 搜索设置备注;
· 搜索设置的保存日期;
· 可进行的操作:View(查看)、Load(加载)、Delete(删除)。

如需加载搜索设置,请点击“Load(加载)”。这将使您所需的搜索设置加载到亚结构搜索页面。一旦亚结构搜索页面出现,请点击“Submit(提交)”以提交结构式搜索。

关于氢原子
注意:在绘制结构式时请不要添加氢原子。如果您添加了,只是让氢原子可见,并无其他用处。添加氢原子并不能防止氢原子被其他原子替换。

如需添加氢原子,你必须增加一根单键再使用非标准原子添加氢原子。