Zweifach markierte Sonden
Dual-Labeled Probes sind der häufigste Sondentyp für die qPCR. Es handelt sich um lineare Hydrolyse-Sonden, die im 5'-Nuklease-Assay mit 5'-Reporterfarbstoffen und Quenchern am 3'-Ende, an einer internen Position (zwischen den Basen 9 und 10), an einer internen Position (zwischen den Basen 9 und 10) und am 3'-Ende bzw. mit MGB, das mit EDQ am 3'-Ende verknüpft ist, verwendet werden.
Lesen Sie mehr über
Applications of Dual-Labeled Probes
- Microarray validation
- Multiplexing von Zielgenen / wenige Proben
- Pathogen detection
- Multiplexing
- Quantifizierung der Viruslast
- Genexpressionsanalyse
- Genkopiebestimmung
Perfekt für die Validierung von MISSION® siRNA und shRNA Knockdowns.
VORTEILE DES EINSATZES VON DUAL-LABELED PROBES
- Einfaches Design für Sequenzspezifität
- Umfangreiche Verfügbarkeit von Reporter/Löscherkombinationen
- Erhöhte Empfindlichkeit
ADD LOCKED NUCLEIC ACID OR MGB:EDQ TO YOUR PROBE
Vorteile von Locked Nucleic Acid mit BHQ™
- Erhöhte thermische Stabilität und Hybridisierungsspezifität
- Größere Genauigkeit bei der SNP-Detektion, Allel-Diskriminierung und in vitro Quantifizierung oder Detektion
- Einfachere und empfindlichere Sondendesigns für problematische Zielsequenzen
- Hat keine native Fluoreszenz (emittiert Wärme statt Licht), was zu einer geringeren Hintergrundfluoreszenz führt /li>
- Erhöhtes Signal-Rausch-Verhältnis und damit höhere Empfindlichkeit
- Ermöglicht eine größere Auswahl an Reportern für das Multiplexing
Vorteile von MGB:EDQ
- Erhöhte Spezifität der Sonden-Target-Hybridisierung, wodurch die Wahrscheinlichkeit unspezifischer Bindungen verringert wird
- Höhere Empfindlichkeit ermöglicht die Verwendung kürzerer Sonden, was die Empfindlichkeit von qPCR-Assays erhöht
- Die Einstellung der Schmelztemperatur ermöglicht eine Tm-Anpassung der Sonde, was für das Design von qPCR-Sonden mit optimalen Tm-Werten von Vorteil sein kann
- Das reduzierte Hintergrundsignal trägt zu einer Verringerung der Hintergrundfluoreszenz bei, was zu einem verbesserten S:N oder Signal-Rausch-Verhältnis
- Erhöhte Stabilität kann die Stabilität des Sonden-Target-Hybrids verbessern, wodurch die Wahrscheinlichkeit des Sondenabbaus verringert wird
- Die Designflexibilität erweitert die Optionen für das Sondendesign und erleichtert die Erstellung effizienter qPCR-Assays
- Verbesserte SNP-Erkennung durch Mismatch-Diskriminierung
Wie funktionieren Dual-Labeled Probes
Eine Dual-Labeled Probe ist ein einzelsträngiges Oligonukleotid, das mit zwei verschiedenen Farbstoffen markiert ist. Am 5'-Ende befindet sich ein Reporterfarbstoff und am 3'-Ende ein Quencher-Molekül. Das Quencher-Molekül hemmt die natürliche Fluoreszenzemission des Reporters durch Fluoreszenzresonanzenergietransfer (FRET). Die nachstehende Abbildung veranschaulicht den Mechanismus.

Der Primer wird von der Polymerase verlängert und die Sonde bindet an die spezifische DNA-Vorlage. Durch Hydrolyse wird der Reporter aus dem Sonden-Target-Hybrid freigesetzt, was zu einem Anstieg der Fluoreszenz führt. Das gemessene Fluoreszenzsignal ist direkt proportional zur Menge der Ziel-DNA.
Features of Dual-Labeled Probes
- Amounts: 1, 3, 5, und 10 OD
- Aufreinigung: HPLC
- Sequenzlängen: 15 - 40 Basen
- Qualitätskontrolle: 100% Massenspektrometrie
- Format: Trocken in Bernsteinröhrchen geliefert
- Benutzerdefinierte Formate verfügbar (Normalisierung, spezielle Platten usw.)
Unsere Sonden werden in einem Format geliefert, das Ihre Versuchsplanung vereinfacht.
Garantierte Renditen | |||
|---|---|---|---|
| Garantierte OD Ausbeute | Anzahl von nmol | Anzahl von nmol. Anzahl. von µg | ca. Anzahl. of Reactions* |
| 1 | 4 | 32 | 800 |
| 3 | 12 | 96 | 2.400 |
| 5 | 20 | 160 | 4.000 |
| 10 | 40 | 320 | 8.000 |
Tabelle der spektralen Eigenschaften | |||
|---|---|---|---|
| Farbstoff | Max. EX (nm) | Max. EM (nm) | Kompatibel Quencher |
| 6-FAM™ | 495 | 520 | BHQ™-1, TAMRA™, MGB:EDQ |
| JOE™ | 529 | 555 | BHQ™-1, TAMRA™ |
| TET™ | 521 | 536 | BHQ™-1, TAMRA™, MGB:EDQ |
| Cal Fluor® Gold 5401 | 522 | 544 | BHQ™-1 |
| HEX™2 | 535 | 556 | BHQ™-1, TAMRA™, MGB:EDQ |
| Cal Fluor® Orange 5602 | 538 | 559 | BHQ™-1 |
| TAMRA™ | 557 | 583 | BHQ™-2 |
| Cyanin 3 | 549 | 566 | BHQ™-2 |
| Quasar® 5703 | 548 | 566 | BHQ™-2 |
| Cal Fluor® Rot 5904 | 569 | 591 | BHQ™-2 |
| ROX™ | 586 | 610 | BHQ™-2 |
| TxRd (Sulforhodamine 101-X) | 597 | 616 | BHQ™-2 |
| Cyanin 5 | 646 | 669 | BHQ™-3 |
| Quasar® 6705 | 647 | 670 | BHQ™-3 |
| Cyanin 5.5 | 675 | 694 | BHQ™-3 |
1JOE/TET alternativ
2VIC® alternativ
3Cyanin 3 alternativ
4TAMRA™ alternativ
5Cyanin 5 alternativ
Zeitplan für den Versand | ||||
|---|---|---|---|---|
| Menge (OD) | 1 | 3 | 5 | 10 |
| Doppelt markierte Sonden mit Standardfarbstoffen | 3-5 Tage | 3-5 Tage | 3-5 Tage | 3-5 Tage |
| Dual-Labeled Locked Nucleic Acid Probes mit Standardfarbstoffen | 7 Tage | 7 Tage | 7 Tage | 7 Tage |
| Dual-Labeled MGB:EDQ-Sonden mit 6'-FAM™, HEX™ oder TET™ (andere Farbstoffe auf Anfrage) | N/A | 10-12 Tage | 10-12 Tage | 10-12 Tage |
| Doppelt markierte Sonden mit Post-Synthese-Farbstoffen, mit/ohne Locked Nucleic Acid | 7-10 Tage | 7-10 Tage | 7-10 Tage | 7-10 Tage |
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