NGS-Bibliotheksvorbereitung
Die Bibliotheksvorbereitung ist der erste Schritt der Next Generation Sequenzierung. Bevor DNA- oder RNA-Proben sequenziert werden können, müssen Nukleinsäuren isoliert, fragmentiert, am Ende repariert und mit Hilfe von Ligations- oder Tagmentierungsmethoden kovalent an Adapter gebunden werden.Die Komplexität einer gut vorbereiteten NGS-Bibliothek sollte vollständig und genau die Komplexität der Probe widerspiegeln, aber spiegelt auch alle während der Bibliotheksvorbereitung eingeführten Verzerrungen wider.Ein Hauptziel bei der Vorbereitung einer DNA- oder RNA Bibliothek für Next Generation Sequencing ist es, die Komplexität zu maximieren und gleichzeitig die durch PCR oder andere Amplifikationen verursachten Verzerrungen zu reduzieren, da die Qualität der resultierenden Bibliothek einen starken Einfluss auf NGS-Ergebnisse haben kann.
Wir bieten ein Portfolio von NGS-Bibliotheksvorbereitungstools an, die zur Vereinfachung von Arbeitsabläufen und zur Erleichterung der Vorbereitung von qualitativ hochwertigen DNA- oder RNA-Bibliotheken entwickelt wurden, die die Komplexität der Proben genau wiedergeben und gleichzeitig Verzerrungen für die Ganzgenomsequenzierung (WGS), die Ganztranskriptomanalyse (WTA), die Gesamt-RNA-Sequenzierung und die Sequenzierung von miRNA und kleinen RNAs reduzieren.
Produkte
Wasser
suitable for electrophoresis, PCR
KOD One™ PCR Master-Mix -BLAU-
Ready-to-use 2X hot-start PCR master mix with a modified KOD DNA polymerase optimized for ultra-fast and convenient high-fidelity PCR
KOD One™ PCR Master-Mix
Ready-to-use 2X hot-start PCR master mix with a modified KOD DNA polymerase optimized for ultra-fast and convenient high-fidelity PCR
SYBR® Green I Gelfarbstoff für Nukleinsäuren
10,000 × in DMSO
DNAse I
Amplification Grade
Desoxynucleotid-Mischung, 10 mM
Molecular Biology Reagent
GenElute™ PCR-Reinigungskit
sufficient for 70 purifications
Custom DNA Oligos
Design and Order Custom Oligos
TransPlex® Complete Whole Transcriptom Amplification Kit
DNA polymerase included, Complete Kit with optimized enzyme to amplify total RNA in <4 hours, no 3′ bias
GenomePlex® Kit zur Gesamtgenom-Amplifikation von Einzelzellen
Amplify genome of a single cell
Microbial DNA standard from Escherichia coli
Suitable for PCR, sequencing and NGS, 10 ng/μL
SeqPlex DNA-Amplifikationskit
For use with high throughput sequencing technologies, Whole Genome Amplification kit designed to facilitate Next Gen Sequencing.
GenElute™-E Single Spin DNA Cleanup Kit
Reagents and consumables for clean-up of pre-purified DNA. 10, 50 or 250 purifications.
Water
Microbial DNA-free; Suitable for PCR, sequencing and NGS
GenomePlex® GGA Kit zur Gesamtgenom-Amplifikation
Optimized kit with enzyme for amplifying a variety of DNA including FFPE tissue
GenomePlex® Kit zur Gesamtgenom-Amplifikation (GGA)
Kit for whole genome amplification from a variety of DNA sources including FFPE tissue
Inactivated Escherichia coli
Suitable for DNA extraction, PCR, sequencing, next generation sequencing, >10^8 bacteria/ml
Microbial community DNA mix
Suitable for PCR, sequencing and NGS, 10 ng/μL
10x Single Cell Lysis & Fragmentation Buffer
SeqPlex RNA-Amplifikations-Kit
For use with high throughput sequencing technologies
Genomische DNA-Extraktionskits
Für die Erstellung von DNA-Bibliotheken hochmolekulare genomische DNA (gDNA) muss aus Zellen, Gewebe oder anderen Probentypen extrahiert werden. Gereinigte genomische DNA sollte nur minimale Scherkräfte sowie biologische und chemische Verunreinigungen aufweisen, um eine optimale Leistung bei nachfolgenden Amplifikations- oder Sequenzierungsreaktionen zu gewährleisten.
Das Fire Monkey™/Fire Flower™ DNA-Extraktionskit mit hohem Molekulargewicht ermöglicht die Isolierung hochreiner genomischer DNA mit minimaler Scherung und niedermolekularen Nukleinsäurekontaminanten.
- Fire Monkey™ ist ein Standard-Spin-Säulen-Verfahren, das hochmolekulare DNA mit durchschnittlichen Stranglängen von >100kb aus entweder bakteriellen oder Säugetierzellen in 1 Stunde extrahiert.
- Fire Flower™ ist ein Standard-Spin-Column-Verfahren, das innerhalb von 15 Minuten eine Größenauswahl der extrahierten DNA aus einer beliebigen Probenquelle vornehmen kann. Fire Flower™ kann die durchschnittliche Gesamtstranglänge um 30 % erhöhen und gleichzeitig DNA-Fragmente von bis zu 30 kb abtrennen.
Whole Genome Amplification Kits
Die DNA-Sequenzanalyse wird häufig durch geringe Mengen an verfügbarem Probenmaterial oder eine geringe Extraktionsausbeute eingeschränkt. Wenn nur wenig Ausgangsmaterial zur Verfügung steht, können Amplifikationstechniken eingesetzt werden, um die Menge der Ausgangs-DNA zu erhöhen. Die Ganzgenom-Amplifikation (WGA) kann verwendet werden, um sowohl intakte als auch stark fragmentierte DNA-Proben für die Eingabe in NGS-Workflows vorzuamplifizieren.
Das SeqPlex-I WGA Kit ermöglicht die Amplifikation kleiner DNA-Mengen oder degradierter oder stark fragmentierter DNA für den direkten Input in Illumina® Next-Generation Sequencing (NGS) Durchflusszellen.
- Erleichtert die Sequenzierung von nur 100 pg DNA
- Verbesserte Primer für vollständige Genomabdeckung, minimale Sequenzverzerrung und ideale Amplikongröße für Next Generation Sequencing (NGS)
- Kosteneffektiv: Kein zusätzlicher NGS-Bibliotheksvorbereitungsschritt
- Kompatibel mit Illumina® Sequenzierung der nächsten Generation
Das SeqPlex Enhanced DNA Amplification Kit für die Ganzgenom-Amplifikation wurde entwickelt, um die Next-Generation -Sequenzierung aus extrem kleinen Mengen oder aus degradierter/stark fragmentierter DNA zu erleichtern. Dieses Kit wurde für die Integration in die Illumina®, SOLiD™ oder 454 Sequenzierungs-Workflows entwickelt.
- Random Priming Technologie amplifiziert fragmentierte DNA wie ChIP oder FFPE
- Erleichtert die Sequenzierung von nur 100 pg von ChIP DNA
- Verbesserte Primer für vollständige Genomabdeckung, minimale Sequenzverzerrung und Primerentfernung
- Kompatibel mit Illumina®SOLiD™ oder 454 Library Prep für Next Generation Sequencing
Whole-Transcriptome-Amplification-Kits
Das wichtigste Ziel bei der Vorbereitung einer NGS-Bibliothek für RNA-Seq ist es, die Transkriptom bibliothek komplexität zu maximieren, um den Ausgangspool an Sequenzen vollständig zu repräsentieren und gleichzeitig Verzerrungen zu reduzieren. RNA-Seq für die Erstellung von Genexpressionsprofilen und Transkriptomanalysen mit hohem Durchsatz wird in der Regel durch geringe Mengen an Ausgangs-RNA erschwert. Mithilfe der Whole Transcriptome Amplification (WTA) können ausreichende Mengen an Sequenzierzielen aus kleinen RNA-Mengen erzeugt werden;erfordert eine hochtreue Transkriptreplikation ohne Verlust oder Verzerrung spezifischer mRNAs um Bibliotheks verzerrungen zu reduzieren.
Das SeqPlex-I WTA Kit ermöglicht die Amplifikation kleiner Mengen revers transkribierter RNA oder degradierter RNA für die direkte Eingabe in Illumina® Next-Generation Sequencing (NGS) Durchflusszellen.
- Amplifiziert fragmentierte oder extrem kleine Mengen an Gesamt-RNA. Fragmentierte oder intakte RNA aus allen Quellen, einschließlich FFPE und RIP, lassen sich leicht mit random priming Technologie amplifizieren.
- Das semi-degenerierte Primerdesign der Bibliothek gewährleistet eine vollständigere Transkriptomabdeckung und effizientes Priming
- Weniger Schritte: Keine Fragmentierung der cDNA vor der Sequenzierung erforderlich
- Hocheffizient: Amplifiziert ds-cDNA in 8 Stunden oder weniger
- Kostengünstig: Kein zusätzlicher NGS-Bibliotheksvorbereitungsschritt mehr erforderlich
- Kompatibel mit Illumina® Next Generation Sequencing
Das SeqPlex RNA Amplification Kit für die Amplifikation des gesamten Transkriptoms (WTA) wurde entwickelt, um die Sequenzierung der nächsten Generation (NGS) aus kleinen Mengen oder aus degradierter/hochgradig fragmentierter RNA (z.z. B. RNA aus formalinfixierten, in Paraffin eingebetteten (FFPE) Gewebeproben). Mit dem SeqPlex-Kit kann der Anwender RNA-Proben für die Eingabe in einen NGS-Workflow voramplifizieren.
- Die Random-Priming-Technologie amplifiziert geringe Mengen an fragmentierter oder intakter RNA aus allen Quellen, einschließlich FFPE und RIP.
- Semi-degenerate library primer design for more complete transcriptome coverage and efficient priming.
- Nicht notwendig DNA vor der Sequenzierung zu fragmentieren.
- Amplifiziert ds-cDNA in 8 Stunden oder weniger.
- Kompatibel mit allen Sequenzierplattformen der nächsten Generation außer Pacific Bioscience.
Verwandte Ressourcen
- Molecular Essentials Guide
Learn how our comprehensive molecular tools and reagents provide precise, ready-to-use solutions for your workflows.
- SeqPlex DNA Amplification Kit Protocol
SeqPlex DNA Amplification Kit enables NGS from small or degraded DNA quantities for whole genome amplification.
- Custom Next-Gen Sequencing Oligos
Regardless of next-generation sequencing (NGS) platform, universal and index adapter sequences are required for the proper assembly of sample fragments.
- Complete Whole Transcriptome Amplification Kit Protocol (WTA2)
WTA2, a Whole Transcriptome Amplification (WTA) method, allows for representative amplification of nanogram quantities of total RNA in less than 4 hours without 3-bias.
- SEQR - SeqPlex RNA Amplification Kit Protocol
The SeqPlex RNA Amplification kit provides a method for amplification of total RNA or isolated mRNA prior to entry into the workflows of the commonly used deep sequencing platforms.
- Whole Transcriptome Amplification of RNA from Low Cell-Number Samples
The efficacy of amplification of small quantities of total RNA with the Complete Whole Transcriptome Amplification Kit (WTA2) was examined in this study.
- Ganzgenom-Amplifikation (WGA) für die Biologie von Einzelzellen
Fortschritte bei Einzelzell-WGA haben den Beitrag der Genomik zur Einzelzellbiologie ermöglicht. Die Ganzgenom-Amplifikation (WGA) wird als eine unspezifische Amplifikation beschrieben, die ein Produkt liefert, das für das Ausgangsmaterial vollständig repräsentativ ist.
- Custom Oligos for Commercial Use
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