一般描述
CRISPR(聚类规则间隔短回文重复序列)是DNA的重复序列。这些序列会被转录成单个转录本,然后再分成短的重复序列。
生化/生理作用
利用全基因组慢病毒池的力量敲除和筛选人类基因组中的每个基因。Sigma全人类基因组慢病毒CRISPR池提供200 ul 8 x 25 ul等分液,通过p24的最低滴度为5x108病毒颗粒/ml。
特点和优势
- 使用CRISPR核酸酶敲除蛋白编码基因,以评估以下功能:
- 在没有机器人或专门设备的情况下,在工作台上高效筛选整个全人类基因(16,000+基因)
- 提高灵活性,从2个子池(Gecko v2)增加到8个子池且每池23,000个克隆(共计184,000个克隆)
- 从之前每个基因6个gRNA扩展到10个gRNA(Gecko v2)
- 大量既定浓缩和损耗控制使研究人员可以自信地评估其克隆池筛选实验的成功程度
- 2向量系统(克隆池仅适用于gRNA,Cas9单独有售)
- 便于优化:使用与Gecko v2相同的向量系统可对两个系统进行优化
- 最小化脱靶效应:严苛的gRNA设计和平铺规则
制备说明
Puro Kill曲线和每毫升CFU(菌落形成单位)的测定。
在进行文库规模的筛选之前,必须进行两个预实验:(1)测定靶细胞类型对嘌呤霉素的敏感性(Kill曲线);以及(2)通过集落形成分析(以CFU/ml为单位)测定细胞类型中慢病毒的功能性滴度。 MOI(感染复数)的计算应基于CFU值。 不同的细胞类型的转导效率有所不同,不同的慢病毒结构表现也不尽相同,因此在进行克隆池实验前,利用控制慢病毒CRISPR克隆(可从Sigma获得)优化实验条件至关重要。
其他说明
本产品仅供研&发使用,不得用于药物、家庭或其他用途。有关危险和安全处理方法的信息,请参阅材料安全数据表。尽管产生的慢病毒转导颗粒不能复制,但建议在实验室操作中将其视为2级风险(RGL-2)物种。遵循所有已发布的RGL-2实验室处理和废物净化指南。