Ugrás a tartalomra
Merck

Szekvenálás

A DNS- vagy RNS-szálban lévő nukleinsavak összetételének és sorrendjének meghatározásának képessége mélyreható hatással van a modern genetika megértésére és számos olyan területre, amely elengedhetetlen a betegségek kutatásához és az összes szervezet jobb megértéséhez. A nukleinsavak szekvenálásának képessége nemcsak egy szervezet genetikai kódjának megfejtéséhez hasznos, hanem további molekuláris technológiákkal kombinálva a kutatók számára egy hatékony eszközt biztosít a DNS-szekvenciák egyszerű manipulálásához és e változások szekvenálással történő ellenőrzéséhez. Mivel a kódoló DNS a fehérjék kódolt információjaként funkcionál, a kutatók ma már olyan rekombináns fehérjéket tervezhetnek testre szabottan, amelyek számos funkcionális elemet tartalmaznak, és amelyeket széles körben használnak ugyanilyen nagyszámú fontos kutatási kérdés megválaszolására. A teljes genom szekvenáláshoz szükséges további reagensek és útmutatók a Next-Generation Sequencing forráson találhatók.



Sanger-szekvenálás

Az analitikai kémiai módszerekkel már korán meg lehetett határozni a nukleinsavak összetételét. Fred Sanger és munkatársai azonban olyan módszereket dolgoztak ki - kezdetben sugárzással jelölt emésztett fragmentumok és kétdimenziós frakcionálás segítségével -, amelyekkel az első teljes nukleinsekvenciák némelyikét meg tudták adni. A terület fejlődése több évtizeden át folytatódott, és minden egyes fejlesztés a szekvenált fehérjék és genomok egyre növekvő könyvtárát gyarapította. E fejlesztések közé tartozik a nukleotidok hossz szerinti elválasztása gélelektroforézissel, majd kapilláris elektroforézissel. Emellett a fluoreszcensen jelölt nukleotidok beépítése és az egyes nukleinsavtöredékek automatizált számítógépes elemzése ma már mind meghatározzák a modern Sanger-szekvenálási módszert.

DNS-szekvenálási módszertan

Míg a DNS-szekvenálás módszerei folyamatosan fejlődtek a technológia kezdete óta, számos alapvető összetevőre még mindig szükség van, és azokat a modern DNS-szekvenálási platformok is használják. A DNS-előkészítés jellemzően magában foglalja a DNS izolálását és tisztítását a gazdaszervezetből. További kritikus komponenseket, köztük a szabad DNS-bázisokat, a DNS-primereket, a fluoreszcens címkéket tartalmazó módosított DNS-bázisokat (terminátor bázisok) és a DNS-polimerázt egyetlen edénybe adják össze. Az ezeket a komponenseket tartalmazó edényben egy sor melegítési és hűtési lépésen keresztül a teljes hosszúságú DNS-szekvenciához képest kis DNS-szekvenciákból álló könyvtárat állítanak elő, amelyek mindegyike fluoreszcens végcímkézett terminátor bázissal végződik. A fluoreszcensen végcímkézett nukleotidokat tartalmazó új DNS-szálakat hosszuk szerint szétválasztjuk, egy kapilláris csövön keresztül vezetjük, és méret szerint rendezzük. Ezután lézerrel gerjesztik a fluoreszcens bázist az egyes szálakon, miközben egy kamera rögzíti a jelet. Végül pedig egy számítógépet használnak általában arra, hogy az összegyűjtött információt a teljes hosszúságú DNS-szekvenciává állítsák össze.

Dokumentum keresés
Konkrétabb információkat keres?

Látogasson el dokumentumkeresőnkbe adatlapok, tanúsítványok és műszaki dokumentációk kereséséhez.

Dokumentumok keresése

A folytatáshoz jelentkezzen be

Az olvasás folytatásához jelentkezzen be vagy hozzon létre egy felhasználói fiókot.

Még nem rendelkezik fiókkal?