Ugrás a tartalomra
Merck
KezdőlapFehérje szerkezeti analízisAminosavak referenciatáblázata

Aminosavak referenciatáblázata

Az aminosavak típusai

AminosavReagensekCellakultúra és molekuláris biológiaAnalitikai és érzékeny alkalmazások
Alanin (Ala/A)A7627A746905129
Arginin (Arg/R)A5006 A809411009
Asparagin (Asn/N)A8381A4284A4284A7094
Aszparaginsav (Asp/D)A9256A7219A8949A8949
Cisztein (Cys/C)<>C7880C685230129
 C7352 
Glutaminsav (Glu/E)G1251 G841549449
Glutamin (Gln/Q)G3126 G854049419
  G7513 
Glicin (Gly/G)G7126G8898 50046
Hisztidin (His/H)H8000H603453319
Hidroxiprolin (Hyp/O)H54409H54409H5534  
Izoleucin (Ile/I)I2752I740358879
Leucin (Leu/L)L8000/td> L891261819
Lizin (Lys/K)L5626L86626292929
Methionin (Met/M)M9625M53086431964319<>/td>
Fenilalanin (Phe/F)P2126P5482 
Prolin (Pro/P)P0380P560781709
Serine (Ser/S)S4500S43118495984959<>/td>
Threonin (Thr/T)T8625T844189179
Triptofán (Trp/W)T0254T894193659
Tirozin (Tyr/Y) T856693829
 T1145 
Valin (Val/V)V0500Valin (Val/V)V0500V0513 94619

A gyakori aminosavak tulajdonságai

NévMolekuláris
súly
Molekuláris
képlet
Reziduum
képlet
Maradék súlya
(-H2O)
pKa1pKb2pKx3pl4
Alanin (Ala/A) 89.10C3H7NO2C3H5NO71.082.349.69-6.00
Arginin (Arg/R)174.20C6H14N4O2 C6H14N4O2C6H12N4O156.192.179.0412.4810.76
Asparagin (Asn/N)132.12C4H8N2O3C4H6N2O2114.112.028.80-5.41
Aszparaginsav (Asp/D)133.11C4H7NO4C4H5NO3115.091.889.603.652.77
Cisztein (Cys/C)121.16C3H7NO2SC3H5NOS103.151.9610.288.185.07
Glutaminsav (Glu/E)147.13C5H9NO4C5H7NO3129.122.199.674.253.22
Glutamin (Gln/Q)146.15C5H10N2O3C5H8N2O2128.132.179.13-5.65
Glicin (Gly/G)75.07 C2H5NO22C2H3NO57.052.349.60-5.97
Hisztidin (His/H)155.16C6H9N3O2C6H7N3O137.141.829.176.007.59
Hidroxiprolin (Hyp/O) 131.13C5H9NO3C5H7NO2113.111.829.65--
--
Izoleucin (Ile/I)131.18 C6H13NO2C6H11NO113.162.369.60-6.02
Leucin (Leu/L)131.18C6H13NO2C6H11NO113.162.369.60-5.98
Lizin (Lys/K)146.19C6H14N2O22.C6H12N2O128.182.188.9510.539.74
Methionin (Met/M)149.21C5H11NO2SC5H9NOS131.202.289.21-5.74
Fenilalanin (Phe/F)165.19C9H11NO2C9H9NO147.181.839.13-5.48
Prolin (Pro/P)115.13C5H9NO2C5H7NO97.121.9910.60-6.30
Pyroglutamát (Glp/U)139.11C5H7NO3C5H5NO2121.09----5.68
Serin (Ser/S)105.09C3H7NO3C3H5NO287.082.219.15-5.68
Threonin (Thr/T)119.12C4H9NO3C4H7NO2101.112.099.10-5.60
Triptofán (Trp/W)204.23C11H12N2O22C11H10N2O186.222.839.39
-5.89
Tirozin (Tyr/Y)181.19C9H11NO3C9H9NO2163.182.209.1110.075.66
Valin (Val/V)117.15C5H11NO2C5H9NO99.132.329.62-5.96

pKa a -COOH csoport disszociációs állandója logaritmusának negatívja.
2 pKb a -NH3 csoport disszociációs állandója logaritmusának negatívja.
3 pKx a molekula bármely más csoportjának disszociációs állandója logaritmusának negatívja.
4 pl a pH az izoelektromos ponton.
Hivatkozás: D.R. Lide, Handbook of Chemistry and Physics72nd Edition, CRC Press, Boca Raton, FL, 1991.


Aminosavak oldalláncok szerint

Aminosavak azok a vegyületek vagy építőelemek, amelyek a peptideket és a fehérjéket alkotják. Minden egyes aminosav egy aminocsoportból és egy karboxilcsoportból épül fel, amelyek egy tetraéderes szénhez kapcsolódnak. Ezt a szenet α-szénnek (alfa-szénnek) nevezzük. 

Az aminosavak az oldalláncok tekintetében különböznek egymástól, amelyeket R-csoportoknak nevezünk. Az egyes aminosavak R-csoportjai szerkezetükben, elektromos töltésükben és polaritásukban különböznek egymástól.

Az alábbi táblázatok és szerkezetek segítségével megismerkedhetünk az aminosavak tulajdonságaival, típusaival, alkalmazásával és elérhetőségével.


Hidrofób oldalláncú aminosavak - Alifás aminosavak


Hidrofób oldalláncú aminosavak - Aromás


Aminosavak polárisan semleges oldalláncokkal


Aminosavak elektromosan töltött oldalláncokkal - savasak


Aminosavak elektromosan töltött oldalláncokkal - Alapvetően



Hydrophobicity Index for Common Amino Acids

A hidrofóbiaindex a relatív hidrofóbia, vagyis az aminosav vízben való oldhatóságának a mértéke. Egy fehérjében a hidrofób aminosavak valószínűleg a fehérje belsejében találhatók, míg a hidrofil aminosavak valószínűleg a vizes környezettel érintkeznek.

A lenti táblázatban szereplő értékeket úgy normalizáltuk, hogy a leghidrofóbabb maradék 100-as értéket kap a glicinhez képest, amely semlegesnek tekinthető (0 érték). A skálákat extrapoláltuk a glicinnél hidrofilebb maradékokra.

A pH 2A

ApH 2 értékek: Sereda et al., J. Chrom. 676: 139-153 (1994).
BpH 7 értékek: Monera et al., J. Protein Sci. 1: 319-329 (1995).

Hivatkozások

1.
Hayman M, Smith K, Cameron N, Przyborski S. 2005. Growth of human stem cell-derived neurons on solid three-dimensional polymers. Journal of Biochemical and Biophysical Methods. 62(3):231-240. https://doi.org/10.1016/j.jbbm.2004.12.001
2.
Cho IJ, Ahn JY, Kim S, Choi MS, Ha TY. 2008. Resveratrol attenuates the expression of HMG-CoA reductase mRNA in hamsters. Biochemical and Biophysical Research Communications. 367(1):190-194. https://doi.org/10.1016/j.bbrc.2007.12.140
3.
Polleux F, Ghosh A. 2002. The Slice Overlay Assay: A Versatile Tool to Study the Influence of Extracellular Signals on Neuronal Development. Science Signaling. 2002(136):pl9-pl9. https://doi.org/10.1126/stke.2002.136.pl9
4.
Rama Rao KV, Reddy PV, Tong X, Norenberg MD. 2010. Brain Edema in Acute Liver Failure. The American Journal of Pathology. 176(3):1400-1408. https://doi.org/10.2353/ajpath.2010.090756
5.
Marx M, Günter RH, Hucko W, Radnikow G, Feldmeyer D. 2012. Improved biocytin labeling and neuronal 3D reconstruction. Nat Protoc. 7(2):394-407. https://doi.org/10.1038/nprot.2011.449
A folytatáshoz jelentkezzen be

Az olvasás folytatásához jelentkezzen be vagy hozzon létre egy felhasználói fiókot.

Még nem rendelkezik fiókkal?

Ügyfeleink kényelme érdekében ezt az oldalt géppel fordítottuk le. Törekedtünk arra, hogy ez a fordítás pontos legyen. A gépi fordítás azonban nem tökéletes. Ha nem elégedett a gépi fordítással, kérjük, tekintse meg az angol nyelvű változatot.