Preparazione delle librerie NGS
Offriamo un portafoglio di strumenti per la preparazione di librerie NGS progettati per semplificare i flussi di lavoro e facilitare la preparazione di librerie di DNA o RNA di alta qualità che rappresentano accuratamente la complessità del campione riducendo al contempo i bias per il sequenziamento dell'intero genoma (WGS), l'analisi dell'intero trascrittoma (WTA), il sequenziamento dell'RNA totale e le applicazioni di sequenziamento di miRNA e piccoli RNA.
Prodotti
Kit di estrazione del DNA genomico
Per la preparazione di librerie di DNA, DNA genomico (gDNA) ad alto peso molecolare deve essere estratto da cellule, tessuti o altri tipi di campioni. Il DNA genomico purificato deve presentare un taglio minimo e contaminanti biologici e chimici per ottenere prestazioni ottimali nelle reazioni di amplificazione o sequenziamento successive.
Il kit di estrazione del DNA ad alto peso molecolare Fire Monkey™/Fire Flower™ consente di isolare il DNA genomico di elevata purezza con un taglio minimo e contaminanti di acido nucleico a basso peso molecolare.
- Fire Monkey™ è un processo standard in colonna centrifuga che estrae DNA ad alto peso molecolare con lunghezza media dei filamenti di 100kb da cellule batteriche o di mammifero in 1 ora.
- Fire Flower™ è un processo standard in colonna centrifuga in grado di selezionare dimensionalmente il DNA estratto da qualsiasi fonte di campione in 15 minuti. Fire Flower™ può aumentare la lunghezza media complessiva dei filamenti del 30%, eliminando al contempo frammenti di DNA fino a 30kb.
Kit di amplificazione dell'intero genoma
L'analisi della sequenza del DNA è spesso limitata da piccole quantità di campione disponibile o da una bassa resa di estrazione. Quando il materiale di partenza è limitato, si possono utilizzare tecniche di amplificazione per aumentare la quantità di DNA di partenza. L'amplificazione dell'intero genoma (WGA) può essere utilizzata per preamplificare sia campioni di DNA intatti che altamente frammentati da inserire nei flussi di lavoro NGS.
Il kit SeqPlex-I WGA consente di amplificare piccole quantità di DNA o DNA degradato o altamente frammentato per l'immissione diretta nelle celle a flusso per il sequenziamento di nuova generazione (NGS) Illumina®.
- Facilita il sequenziamento a partire da soli 100 pg di DNA
- Primer potenziati per una copertura completa del genoma, un bias di sequenza minimo e una dimensione degli ampliconi ideale per il sequenziamento di prossima generazione (NGS)
- Efficace dal punto di vista dei costi: Nessuna fase aggiuntiva di preparazione della libreria NGS
- Compatibile con il sequenziamento di nuova generazione Illumina®
Il SeqPlex Enhanced DNA Amplification Kit per l'amplificazione dell'intero genoma è stato progettato per facilitare il sequenziamento di prossima generazione a partire da quantità estremamente ridotte o da DNA degradato/altamente frammentato. Questo kit è stato sviluppato per integrarsi nei flussi di lavoro di sequenziamento Illumina®, SOLiD™, o 454.
- La tecnologia di priming casuale amplifica il DNA frammentato come ChIP o FFPE
- Facilita il sequenziamento a partire da soli 100 pg di ChIP o di FFPE nbsp;di ChIP DNA
- Primers potenziati per una copertura completa del genoma, bias di sequenza minimi, e rimozione dei primer
- Compatibile con Illumina®SOLiD™ o 454 per la preparazione di librerie per il sequenziamento di nuova generazione
Kit per l'amplificazione di interi trascrittomi
L'obiettivo principale nella preparazione di una libreria NGS nella preparazione di una libreria NGS per RNA-Seq è quello di massimizzare la complessità della libreria trascrittomica per rappresentare appieno il pool di sequenze di partenza riducendo il bias.L'RNA-Seq per la profilazione dell'espressione genica ad alto rendimento e l'analisi del trascrittoma è comunemente ostacolato da basse quantità di RNA di partenza. L'amplificazione dell'intero trascrittoma (WTA) può essere utilizzata per generare quantità sufficienti di target di sequenziamento da piccole quantità di RNA ma richiede un'elevata fedeltà di replicazione dei trascritti senza perdita o distorsione di specifici mRNA per ridurre il bias delle librerie .
Il kit SeqPlex-I WTA consente l'amplificazione di piccole quantità di RNA trascritto inversamente o degradato da immettere direttamente nelle celle a flusso per il sequenziamento di prossima generazione (NGS) Illumina®.
- Amplifica quantità frammentate o estremamente piccole di RNA totale. RNA frammentato o intatto da tutte le fonti, compresi FFPE e RIP, sono facilmente amplificati utilizzando la tecnologia di priming casuale.
- Il design dei primer della libreria semidegenerata assicura una copertura più completa del trascrittoma e un priming efficiente
- Meno passaggi: Non è necessario frammentare il cDNA prima del sequenziamento
- Alta efficienza: Amplifica il ds-cDNA in 8 ore o meno
- Efficace dal punto di vista dei costi: Non richiede più un'ulteriore fase di preparazione della libreria NGS
- Compatibile con il sequenziamento di nuova generazione Illumina®
Il SeqPlex RNA Amplification Kit per l'amplificazione dell'intero trascrittoma (WTA) è stato progettato per facilitare il sequenziamento di prossima generazione (NGS) da piccole quantità o da RNA degradato/altamente frammentato (ad es.RNA proveniente da campioni di tessuto inclusi in paraffina e fissati in formalina (FFPE)). Il kit SeqPlex consente all'utente di preamplificare i campioni di RNA da inserire in un flusso di lavoro NGS.
- La tecnologia di priming casuale amplifica basse quantità di RNA frammentato o intatto da tutte le fonti, compresi FFPE e RIP.
- Progettazione di primer per librerie semidegenerate per una copertura più completa del trascrittoma e un priming efficiente.
- Non è necessario frammentare il DNA prima del sequenziamento.
- Amplifica il ds-cDNA in 8 ore o meno.
- Compatibile con tutte le piattaforme di sequenziamento di nuova generazione tranne Pacific Bioscience.
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