下一代測序

Next-generation sequencing (NGS) 是一個詞彙,廣泛地涵蓋了幾種相關的技術,這些技術能夠對生物的選定區域或整個基因組進行大量並行或深度測序覆蓋。在以基因組學為基礎的研究領域中,測序技術已存在數十年之久。然而,NGS 或大量平行 DNA 和 RNA 測序技術的持續進步,在快速降低成本的同時,也為研究人員提供了更多的全基因組測序覆蓋範圍和資料分析工具。NGS 的應用範圍超越了全基因組分析,因為它對基礎基因組學和疾病研究的最新進展都有重大影響。
特色類別
NGS 方法概述
雖然 NGS 的方法和試劑在不斷演進,但現在已有許多 NGS 系統可供研究人員使用。常用的平台結合了 NGS 工作流程中幾個關鍵步驟的使用,包括樣本或文庫製備、簇生成、測序和資料分析。樣本製備通常包括 DNA 擴增或加入序列連結物或適應物。當含有共價連結物的 DNA 與固體表面雜交,進行橋接式 PCR 擴增,或使用乳液 PCR 等其他方法,即可產生各 DNA 序列的簇。此外,還有許多 DNA 測序方法,包括結合測序、合成測序、火法測序和離子半導體測序。
NGS 数据分析的分析方法
所有 NGS 工作流程的最后一个要素是测序后的关键数据分析步骤。雖然每個 NGS 平台和工作流程都會產生大量擷取在電腦上的數位資訊,但生物資訊學家必須使用持續增加的分析工具來分析原始資料集,以進行讀取比對和映射,例如 Bowtie、Galaxy 和許多其他工具。NGS 技術領域的許多發展都來自於眾多科學領域的合併,以開發和優化此類大型資料集的分析和詮釋。根據特定的應用需求,研究人員現在能夠使用這些強大的工具來對整個基因組、外顯體或轉錄組進行測序,以進行基礎研究和疾病研究。
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