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NGS 圖庫製備

NGS 圖庫製備
<在對 DNA 或 RNA 樣本進行測序之前,核酸必須進行分離、片段化、末端修復,並使用連接或標記等方法與適應體進行共價鏈接。一個準備良好的 NGS 文庫的複雜性應能全面準確地反映樣本的複雜性,但也會反映文庫製備過程中引入的任何偏差。在為下一代測序準備 DNA 或 RNA 文庫時,一個關鍵目標是最大限度地增加複雜性,同時減少對 DNA 或 RNA 文庫的損耗;

我們的技術人員可以為您提供最優質的產品和服務,以滿足您的需求。

我們提供一系列 NGS 文庫製備工具,旨在簡化工作流程,促進高品質 DNA 或 RNA 文庫的製備,以準確表現樣本的複雜性,同時減少全基因組測序 (WGS)、全轉錄組分析 (WTA)、總 RNA 測序以及 miRNA 和 small RNA 測序應用的偏差。


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Genomic DNA Extraction Kits

For DNA library preparation, ;(gDNA) 需要從細胞、組織或其他樣本類型中提取高分子量的基因組 DNA。純化後的基因組 DNA 應該具有最小的剪切力以及生物和化學污染物,以便在隨後的擴增或測序反應中達到最佳性能。  

 Fire Monkey™/Fire Flower™ High molecular weight DNA extraction kit 可分離出高純度的基因組 DNA,並將剪切力和低分子量的核酸雜質降至最低。

  • 火猴™ 是一種標準的旋轉柱法,可在 1 小時內從 細菌 或 哺乳動物細胞中提取平均鏈長度為 >100kb的高分子量 DNA。
  • Fire Flower™ 是一種標準的旋轉柱式製程,可在 15 分鐘內從任何 樣本來源中選擇提取 DNA 的大小。Fire Flower™ 可以增加 30% 的整體平均鏈長度,同時消耗高達 30kb 的 DNA 片段 

全基因組擴增套件

DNA序列分析通常會受到少量可用樣品或提取率低的限制。當可以取得的起始材料有限時,可以使用擴增技術來增加起始 DNA 的數量。全基因組擴增 (WGA) 可用於預先擴增完整和高度片段化的 DNA 樣本,以輸入 NGS 工作流程。

SeqPlex-I WGA 套件可擴增少量 DNA 或降解 DNA 或高度片段 DNA,以直接輸入到 Illumina® 下一代測序 (NGS) 流式细胞中。

  • 可從低至 100 pg 的 DNA 開始進行測序
  • 增強的引物可進行全基因組測序。增強的引物可達到完整的基因組覆蓋、最小的序列偏差,以及下一代測序 (NGS) 理想的擴增片段大小
  • 成本效益高:不需要額外的 NGS 文庫準備步驟
  • 與 Illumina® 下一代測序相容

The SeqPlex ;Enhanced DNA Amplification Kit for whole genome amplification 專為促進從極少量或降解/高度片段化的 DNA 進行下一代測序而設計。本試劑盒可整合至 Illumina®、 SOLiD™ 或 454 測序工作流程。

  • 隨機引物技術可擴增片段 DNA,例如 ChIP 或 FFPE
  • 可從低至 100 pg  pg of ChIP DNA
  • 增強引物以達到完整基因組覆蓋、最小序列偏差 和引物移除
  • 與Illumina®兼容、SOLiD™ 或 454 庫預備用於下一代測序

Whole-Transcriptome-Amplification-Kits

製備 NGS 文庫的主要目標 ;在為 RNA-Seq 準備 NGS 文庫時,主要目標是最大化轉錄組文庫的複雜性,以完全代表起始序列庫,同時減少偏差。RNA-Seq用於高通量基因表達譜和轉錄組分析通常會受到低量起始RNA的挑戰。全轉錄組擴增技術(WTA)可用於從少量的 RNA 中產生足量的測序目標,但需要高保真的 RNA 序列;需要高保真的轉錄本複製,而不會損失或扭曲特定的 mRNA,以減少庫的偏差。

SeqPlex-I WTA 套件可擴增少量反向轉錄 RNA 或降解 RNA,以直接輸入到 Illumina® 下一代測序 (NGS) 流式细胞中。

  • 可擴增片段或極少量的總 RNA。 使用隨機引物技術,可輕鬆擴增來自所有來源(包括 FFPE 和 RIP)的片段或完整 RNA。
  • 半退化文庫引物設計確保更完整的轉錄組覆蓋和高效的引物 
  • 更少的步驟:測序前無需對 cDNA 進行片段化
  • 高效率:在 8 小時或更短時間內擴增 ds-cDNA
  • 成本效益高:不再需要額外的 NGS 文庫準備步驟
  • 相容於 Illumina® 新世代測序

The ;SeqPlex RNA Amplification Kit for whole transcriptome amplification (WTA)是專為促進下一代測序(NGS)而設計,可從少量或降解/高度片段化的RNA(e.例如,來自福尔马林固定石蜡包埋 (FFPE) 组织样本的 RNA)。

  • 隨機引物技術可擴增所有來源(包括 FFPE 和 RIP)的低量片段或完整 RNA。
  • 半退化文庫引物設計可提供更完整的轉錄組覆蓋和更有效率的引物。
  • 可在 8 小時或更短時間內完成 ds-cDNA 的擴增。
  • 與除 Pacific Bioscience 之外的所有新一代測序平台相容。

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