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# qPCR

La PCR quantitativa in tempo reale (qPCR) utilizza molecole segnalatrici fluorescenti per consentire la quantificazione dei prodotti amplificati. Come nella PCR convenzionale, viene amplificato un modello di DNA, cDNA o RNA, ma ad ogni ciclo vengono monitorati i segnali fluorescenti per la quantificazione relativa o assoluta.
Questa tecnica è utile in numerosi ambiti di ricerca, tra cui l’analisi dell’espressione genica, la genotipizzazione, l’analisi dei microRNA, l’analisi delle variazioni genetiche e l’analisi delle proteine.
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La reazione a catena della polimerasi (PCR) è uno strumento fondamentale nei laboratori di biologia molecolare. La PCR viene utilizzata per amplificare il DNA di diversi ordini di grandezza e i nostri reagenti e risorse sono adatti a numerosi flussi di lavoro di ricerca, tra cui l’analisi dell’espressione genica, la genotipizzazione, il sequenziamento e le applicazioni di mutagenesi.
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Panoramica
Articoli e protocolli correlati
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## Come analizzare i dati della qPCR
La fluorescenza delle molecole reporter viene misurata e quantificata; in genere si tratta di coloranti (ad esempio SYBR® Green, bromuro di etidio) che si intercalano tra le basi del DNA a doppia elica, oppure di sonde progettate per legarsi a una sequenza specifica (ad esempio Molecular Beacons, sonde TaqMan®) sul DNA.
## Quantificazione relativa dei dati qPCR
Esistono due principali metodi di quantificazione dei dati qPCR. La quantificazione relativa, il metodo più comune, utilizza le informazioni ΔΔCt, grazie alle quali viene determinato il rapporto di espressione o di abbondanza del gene bersaglio nel campione, rispetto a un gene di controllo, e normalizzato con il rapporto di espressione di un gene di riferimento. Poiché i valori di efficienza E per i geni bersaglio e di riferimento differiscono, questo metodo tiene conto anche delle differenze nei valori di E. Questo metodo è impiegato più frequentemente nell’analisi dell’espressione genica.
## Quantificazione assoluta dei dati qPCR
Il secondo metodo, la quantificazione assoluta, è più comune nella microbiologia ambientale e si avvale della curva standard (SC). Il metodo SC utilizza una serie di diluizioni di una concentrazione nota del modello, N0, per creare una curva standard mediante la regressione lineare di log(N0) rispetto al CT (ciclo di soglia). Questa viene poi utilizzata per calcolare le concentrazioni del modello nel campione. Il presupposto di questo metodo è che il valore di efficienza del campione sia uguale a quello dello standard.
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Dopo aver completato una PCR tradizionale, l'analisi dei dati della PCR/qPCR viene condotta mediante risoluzione attraverso un gel di agarosio o, più recentemente, attraverso un capillare.
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PCR assay guide navigates you through primer validation and other assay optimization factors to ensure high sensitivity and specificity for optimum DNA/ RNA quantification.
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PCR workflow's variability influenced by sample source, reverse transcription, and assay design, impacting reproducibility.
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- [Protocollo universale SYBR Green qPCR](https://www.sigmaaldrich.com/IT/it/technical-documents/protocol/genomics/qpcr/sybr-green-qpcr)
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Chromatin Immunoprecipitation qPCR for studying gene regulation across conditions.
- [Primer Concentration Optimization](https://www.sigmaaldrich.com/IT/en/technical-documents/protocol/genomics/qpcr/primer-concentration-optimization)
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