siRNA

esiRNA/ esiFLEX/非编码

MISSION esiRNA

Eupheria Biotech

 

   

 



本页内容
MISSION esiRNA
优点
esiRNA靶向长链非编码RNA
esiRNA筛选视频教程
esiRNA常见问题(常见问题解答)
MISSION esiRNA产品线
订购信息
esiRNA对照
参考文献


esiRNA技术概述

(921 Kb PDF)

MISSION® esiRNA

MISSION esiRNA为RNAi研究人员提供了一种经过验证、高性价比、简单的RNAi筛选方法。MISSION esiRNA是由内切核糖核酸酶制备的siRNA库,由全部靶向相同mRNA序列的siRNA异质混合物组成。这些多重沉默触发因子有助于获得高度特异性和有效的基因沉默,并且与单个或混合的siRNA相比具有更低的脱靶效应。

 

产品线

MISSION esiRNA和MISSION esiFLEX可单独购买,可用于定制阵列Panel或靶向人和小鼠基因的基因组文库。




产品 esiRNA编码基因数 esiRNA长链非编码基因数 规格(µg) 形式 特点和订购信息
单独 esiRNAs 16,744 (人类)
14,068 (小鼠)
1,761 (人类)
643 (小鼠)
20 / 50 单管
96/384-孔板
轻松网络订购
立即搜索
esiFLEX 16,744 (人类)
14,068 (小鼠)
1,761 (人类)
643 (小鼠)
1 / 2.5 / 5 96 / 384-孔板 定制阵列。择优挑选文库
联系我们
文库 16,744 (人类)
14,068 (小鼠)
1,761 (人类)
643 (小鼠)
1 / 2.5 / 5 384-孔板 预置阵列文库
联系我们
esiOPEN 定制
所有物种
定制 20 / 50 单管 定制序列(DEQOR优化)
联系我们
esiSEC 16,744 (人类)
14,068 (小鼠)
1,761 (人类)
643 (小鼠)
20 / 50 单管 验证一级esiRNA用二级独立esiRNA
联系我们

了解更多 关于我们编码esiRNA的信息。

了解更多 关于我们的长链非编码esiRNA的信息。

将时间和精力用在发现研究上!

特性和优点

  • 比单一或混合的siRNA脱靶效应更低
  • 保证 比单一或混合的siRNA脱靶效应更低
  • 比单一或混合的siRNA脱靶效应更低
  • 提供超过16,000个人类和超过14,000个小鼠靶点
  • 可进行快速初级筛选
  • 高靶点特异性
 

MISSION esiRNA如何制备?

esiRNA或内切核糖核酸酶制备的siRNA是由大肠杆菌RNA酶III裂解长双链RNA(dsRNA)产生的siRNA库。请参见图1。

 

图一
:MISSION esiRNA生产概述。
注:该流程是针对个体esiRNA的生产。

生成PCR产物

通过使用对载体骨架具有特异性的引物或附加有RNA聚合酶启动子序列的靶向特异性引物进行克隆,并利用PCR扩增克隆的cDNA来产生用于体外转录的模板。PCR产物经过测序进行验证。基于DEQOR siRNA设计程序确定具有最高可能数量的高效siRNA,从而选择扩增区域。MISSION esiRNA被设计用来涵盖所有已知靶基因的转录变体。

体外转录和长链dsRNA制备

将由cDNA生成的PCR产物用于体外转录反应。再使用RNA聚合酶产生dsRNA,然后在消化之前将两条单链RNA链退火。

酶消化

为了缩短dsRNA,将长dsRNA进行酶促消化。经过该消化过程可产生复杂的siRNA样分子库。

消化后dsRNA纯化

随后,将消化后产物进行纯化以除去剩余的DNA模板、未使用的核苷酸、以及长于约40bp的dsRNA。经该纯化步骤,可产生平均长度为21bp的MISSION esiRNA。

MISSION esiRNAs

由于起始材料是cDNA,因此每个MISSION esiRNA都能保证靶向一个真正的基因,研究人员不需要花费更多的时间用于检测实际不存在的“预测”基因。

MISSION esiRNA是所有靶向相同mRNA序列的siRNA的异质混合物。 这些多重沉默触发可以获得高度特异性和有效的基因沉默。

用于哺乳动物细胞中的RNAi筛选的esiRNA视频教程

esiRNA Video

esiRNA FAQ(常见问题解答)

 


MISSION esiRNA 产品线

MISSION esiRNA和MISSION esiFLEX可单独购买,可用于定制阵列Panel或靶向人和小鼠基因的基因组文库。

点击此处查看更多esiRNA产品信息。
浏览esiRNA的完整列表。

单一 esiRNA

我们的单一esiRNA非常适合单个基因的生物学鉴定。目前,我们提供针对16,744个人类和14,068个小鼠转录物的esiRNA,规格为20μg或50μg,标准化至200ng /μl。如果需要更大规格,敬请垂询。所有esiRNA都是基于ENSEMBL数据库的序列注释设计的,并且包装在独立的管中

平板预制esiRNA

通过96孔定制板提供的20μg或50μg esiRNA,标准化至200ng /μl。目前,我们提供针对16,744个人类和14,068个小鼠转录物的esiRNA。 平板订单必须具有≥10个靶点。

esiRNA 文库

MISSION esiRNA文库可用于全基因组和长链非编码人类和小鼠的靶基因。我们的基因组规模的esiRNA文库是最先进的RNAi试剂,特别适用于大规模功能缺失筛选。

目前,我们提供由16,744个esiRNAs组成的人类库和一个含有14,068个esiRNA的小鼠库。所有esiRNA都是根据ENSEMBL数据库的序列注释设计的。长链非编码RNA文库由1761个(人)和643个(小鼠)esiRNA组成。这些文库被预置在96孔板或384孔板中,所有位置均含有1μg、2.5μg或5.0μg的量,并可标准化至50 ng /μl。其他数量、定制阵列或其他平板规格可根据要求提供。

esiFLEX esiRNA

我们的esiFLEX esiRNA子基因组集合为平板预制定制提供了方便的小规模选择。我们为人类或小鼠物种提供esiFLEX,并在我们的产品组合中提供16,744个人类和14,068个小鼠esiRNA。esiFLEX文库以1μg、2.5μg或5μg的量预置至96孔板中,并可标准化至50ng /μl。客户可以自由选择平板上每个esiRNA的位置。其他数量、浓度或平板规格可根据要求提供。所有esiRNA都是根据ENSEMBL数据库的序列注释设计的。最小订单需要至少24个靶点。

esiOPEN esiRNA

esiOPEN提供了完全自由的靶向定制esiRNAs的解决方案。不管物种如何,客户可以提供任何转录序列(至少500bp),我们可以根据所提供的序列,在其内找到最佳靶区域(由DEQOR确定),从而合成esiRNA 以确保最大效率和特异性。esiOPEN esiRNA以20μg或50μg的规格提供,可标准化至200 ng /μl,并包装于独立的管中。可应客户要求提供更大规格。

esiSEC esiRNA

esiSEC为我们的产品组合中的所有初级esiRNA提供二级独立沉默触发子。esiSEC可用于验证由我们的初级esiRNA诱导的RNAi表型。esiSEC esiRNA以20μg或50μg的规格提供,可标准化至200 ng /μl,并包装在独立的管中。可应客户要求提供更大规格。所有esiRNA都是根据ENSEMBL数据库的序列注释设计的。


esiRNA 订购信息

单一 esiRNAs
通过在 上方搜索框中 输入您的目标基因并将选定的esiRNA添加到您的购物车中,轻松找到您的MISSION esiRNA靶点。

对于所有其他esiRNA产品:

对照

  • 阴性对照:RLUC, FLUCeGFP MISSION esiRNAs
  • 阳性对照:eg5 (KIF11) MISSION esiRNA(强有丝分裂停滞/活力表型)
  • 靶向eGFP的MISSION esiRNA也可用作表达eGFP的细胞中的敲除阳性对照
  • 经过验证的人类MISSION esiRNA—许多常见的基因靶点,包括LAMIN A、PLK4和AURKB,已被验证用于> 70%的mRNA敲低。 经过验证的MISSION esiRNA适用于转染优化和作为阳性对照
  • qPCR 验证数据
  • Western Blot 验证数据


经验证的人类MISSION esiRNA
基因名称 esiRNA 产品号 基因名称 esiRNA 产品号 基因名称 esiRNA 产品号
ANAPC1 EHU029991 DCTN2 EHU086581 PLK4 EHU001691
ANAPC10 EHU108801 ETN3 EHU040581 RAD21 EHU108911
ANAPC5 EHU069691 H3F3A EHU127091 RCD-8 EHU094431
AURKB EHU001471 INCENP EHU001891 SEC13L1 EHU152131
c14orf10 EHU143981 KIF11 EHU019931 SEH1L EHU049161
CENPA EHU098081 KIF23 EHU066121 SUV39H2 EHU093651
CEP192 EHU026711 LMNA EHU063791 TACC3 EHU063201
CETN2 EHU137031 MAD2L1 EHU074611 TUBG1 EHU056411
ch-TOG EHU078221 NEK2 EHU109951 TUBGCP3 EHU073291
CLASP1 EHU028941 NUMA EHU059141 TPX2 EHU093011
CP110 EHU007261 NUP37 EHU048011    



参考文献

MISSION esiRNA — 经过验证的RNAi筛选工具

Roguev, A. et al. Quantitative genetic-interaction mapping in mammalian cells. Nature Methods 10, 432–437 (2013).

Abbasi, M., Lavasanifar, A. & Uludag, H. Recent attempts at RNAi-mediated P-glycoprotein downregulation for reversal of multidrug resistance in cancer. Medicinal research reviews 33, 33-53 (2013).

Alvarez-Calderon, F., Gregory, MA. & DeGregori, J. Using functional genomics to overcome therapeutic resistance in hematological malignancies. Immunologic research 55, 100-15 (2013).

Kim, N. & Song, K. KIFC1 is essential for bipolar spindle formation and genomic stability in the primary human fibroblast IMR-90 cell. Cell structure and function (2013).

Ngondo-Mbongo, RP., Myslinski, E., Aster, JC. & Carbon, P. Modulation of gene expression via overlapping binding sites exerted by ZNF143, Notch1 and THAP11. Nucleic acids research (2013).

Vella, P. et al. Tet Proteins Connect the O-Linked N-acetylglucosamine Transferase Ogt to Chromatin in Embryonic Stem Cells. Molecular cell 49, 645-56 (2013).

Calegari, F. et al. Tissue-specific RNA interference in postimplantation mouse embryos with endoribonuclease-prepared short interfering RNA. PNAS, 99, 14236-14240 (2002).

Lin, Z. et al. (2011) Reduced Level of Ribonucleotide Reductase R2 Subunits Increases Dependence on Homologous Recombination Repair of Cisplatin-Induced DNA Damage. Mol Pharmacol doi:10.1124/mol.111.074708. Abstract

Krastev, D.B. et al. A systematic RNAi synthetic interaction screen reveals a link between p53 and snoRNP assembly. Nat Cell Biol 13, 809-18 (2011). Abstract

Nitzsche, A. et al. RAD21 cooperates with pluripotency transcription factors in the maintenance of embryonic stem cell identity. PLoS One 6, e19470 (2011). Abstract

Leushacke, M. et al. An RNA interference phenotypic screen identifies a role for FGF signals in colon cancer progression. PLoS One (2011), accepted for publication.

Slabicki M., et al. (2010) A Genome-Scale DNA Repair RNAi Screen Identifies SPG48 as a Novel Gene Associated with Hereditary Spastic Paraplegia. PLoS Biol 8(6): e1000408. doi:10.1371/journal.pbio.1000408. Paper (2.22 Mb PDF)

Collinet, et al. Systems survey of endocytosis by multiparametric image analysis. Nature 464, 243-249 (2010). Abstract

Theis, M. et al. Comparative profiling identifies C13orf3 as a component of the Ska complex required for mammalian cell division. EMBO J. 28, 1453-65 (2009). Abstract

Ding, L. et al. A Genome-Scale RNAi Screen for Oct4 Modulators Defines a Role of the Paf1 Complex for Embryonic Stem Cell Identity. Cell Stem Cell. 9, 403-15 (2009). Abstract

Kittler, R. et al. Genome-scale RNAi profiling of cell division in human tissue culture cells. Nat. Cell Biol. 9, 1401-12 (2007). Abstract

Kittler, R. et al. An endoribonuclease-prepared siRNA screen in human cells identifies genes essential for cell division. Nature 432, 1036-40 (2004). Abstract

Additional esiRNA Literature References

Stewart, G. S. et al. The RIDDLE syndrome protein mediates a ubiquitin-dependent signaling cascade at sites of DNA damage. Cell 136, 420-34 (2009). Abstract

Lawo, S. et al. HAUS, the 8-Subunit Human Augmin Complex, Regulates Centrosome and Spindle Integrity. Curr Biol., 19, 816-26 (2009). Abstract

Fazzio, T. G. et al. An RNAi screen of chromatin proteins identifies Tip60-p400 as a regulator of embryonic stem cell identity. Cell 2008 134, 162-74 (2008). Abstract

Konstantinova, I. et al. EphA-Ephrin-A-mediated beta cell communication regulates insulin secretion from pancreatic islets. Cell 129, 359-70 (2007). Abstract

Nikolova, G. et al. The vascular basement membrane: a niche for insulin gene expression and Beta cell proliferation. Dev Cell. 10, 397-405 (2006). Abstract

Kittler, R. et. al. RNA interference rescue by bacterial artificial chromosome transgenesis in mammalian tissue culture cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 102, 2396-401 (2005). Abstract

Liu, W. Y. et al. Efficient RNA interference in zebrafish embryos using synthesized with SP6 RNA polymerase. Dev. Growth Differ. 47(5), 323-31 (2005). Abstract

Yang, D. et al. Short RNA duplexes produced by hydrolysis with Escherichia coli RNase III mediate effective RNA interference in mammalian cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 99, 9942-7 (2002). Abstract

 


联系我们

有关esiRNAs的技术问题,敬请联系我们的技术服务部门: techserv@sial.com

MISSION为Sigma-Aldrich Co的注册商标。 LLC 标签许可证

返回页首