代谢组学

代谢通路

谨此纪念Donald Nicholson博士(1916-2012)

Donald Nicholson博士于1936年获得伦敦大学化学专业理学学士学位,并于1940年获得该专业博士学位。之后,他进入位于诺丁汉的Boots Pure 医药公司工作,从事最早的磺胺类抗菌药物的研发和生产。1946年,他以化学疗法I.C.I研究员的身份加入利兹医学院细菌学系,并一直担任微生物学讲师或高级讲师,直至1981年“退休”。即便超过90岁高龄,Nicholson博士仍然积极致力于创作更小更细的“小型通路图谱”,特别是“动态通路图谱”。为了表彰他的工作,他被授予了科学荣誉博士学位,并成为国际生物化学与分子生物学联合会(IUBMB)仅有的两位终身名誉成员之一。

了解更多Nicholson博士的信息,以及他如何创建代谢途径图。

代谢通路图谱中包含超过500种Sigma产品的超链接。只需点击代谢产物名称或者酶的EC编号即可获得产品信息。

 

第22版(2003年)IUBMB-Sigma-Nicholson代谢通路图谱包含了更新的通路,涉及线粒体和叶绿体的ATP代谢。 该图的“骨架”是糖酵解途径,接下来是三羧酸循环和呼吸链,它们通过ATP合成酶共同完成了ATP的合成。ATP是所有生命所需的大部分能量来源。新陈代谢过程中许多生物合成和分解途径,如碳水化合物、氨基酸、脂类都与该骨架联系在一起,并且通过不同颜色来区分。可能的情况下,人类的新陈代谢则用黑色箭头来区分。大约550个反应都被它们的IUBMB酶学委员会(EC)编号加以标记,并编入索引。

查看图表 (3.05 Mb PDF)—查看图表时使用Adobe Reader的放大工具。

第22版全面的代谢途径图。包含了糖酵解,碳水化合物,氨基酸,脂类,核苷酸,类固醇,维生素代谢以及更多内容。

 

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出版资料

由Donald Nicholson设计

由密苏里州圣路易斯的Sigma-Aldrich公司制备并出版

©2002 International Union of Biochemistry and Molecular Biology版权所有。


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 第22版如今增补了在线小型通路图,可根据需要选择某些通路并加以放大,显示出以前不能被展示的新陈代谢的各个方面——例如区室化和调控。

  

另一个独特而令人兴奋的发展是引入了动画代谢通路——“动态通路图”。 它们正在被转换成Flash的形式,以便于所有人都可以在网上免费的访问。生物化学因此变得更加清晰,生物化学和新陈代谢也变得更加“有意义,精彩和充满乐趣!”

代谢途径图上酶学委员会编号的完整目录

该表将所有酶的名称与相应的代谢途径图上的EC编号相互对照


先天性代谢异常图

包含在线人类孟德尔遗传法则(OMIM)疾病数据库的超链接(PDF 1.6MB)

IUBMB-Nicholson小型通路图
 可选择某些通路并加以放大,显示出以前不能被展示的新陈代谢的各个方面——例如区室化,酶和调控。


IUBMB-Nicholson电子传递动画

动画演示线粒体中质子动力势是如何产生并驱动ATP合成酶。

IUBMB-Nicholson ATP合成酶动画

动画演示许多人认为的生命系统最重要的分子机制


 IUBMB-Nicholson糖酵解途径动画

动画演示葡萄糖转变为丙酮酸的反应。

 IUBMB-Nicholson三羧酸循环动画

动画演示细胞如何利用乙酰辅酶A的势能转化为NADH + H+和UQH2的还原能

 IUBMB-Nicholson丙酮酸脱氢酶复合物动画

动画演示细胞质中丙酮酸如何与乙酰辅酶A以及线粒体基质中的三羧酸循环联系起来。