代谢组学

IUBMB Nicholson Minimaps - 代谢通路图

© 2003 IUBMB

 

在过去的40年中,21个版本的一百多万张代谢通路图一直在努力呈现独特而全面的代谢图谱。现在,这些通路图增补了Minimap,即选取指定单条通路并将其放大,以说明之前可能未体现出来的内容——如区域化、酶和调控。通过利用不同颜色的背景区分不同器官、细胞器、组织和膜,将有可能说明同一个细胞中的对峙反应(如生物合成和降解)多久能够同时发生一次。通路将从高亮起点向高亮终产物方向“流动”——该过程在相关病例中将使用血管进行说明。这些Minimap旨在展示易于探索、有意义及有趣的通路。这是现实版的代谢!

从下表中选取Minimap,每一个Minimap都具有两个版本:GIF和PDF。PDF最好使用Acrobat 4.0版或更高版本查看。从Adobe网站上也许可以下载免费的PDF插件。

 

标题 PDF
1.代谢的核心 PDF (52 kb)
2.糖酵解 PDF (44 kb)
3. 乳酸和乙醇发酵 PDF (240 kb)
4.糖酵解和TCA循环 - 反应 PDF (52 kb)
5.糖酵解和TCA循环 – 潜在能量的产物 PDF (54 kb)
6.糖酵解和TCA循环 - 酶和酶学委员会参考编号 PDF (62 kb)
7.糖酵解和TCA循环 – 区域化 PDF (53 kb)
8.糖酵解和TCA循环 - 区域化(简化版) PDF (49 kb)
9.糖酵解和TCA循环 -穿梭 PDF (70 kb)
10.糖酵解和TCA循环 – 调控 PDF (58 kb)
11.线粒体ATP形成 PDF (640 kb)
12.ATP产量 PDF (636 kb)
13. TCA循环的回补反应 PDF (61 kb)
14. 乙醛酸途径 PDF (65 kb)
15.糖异生和糖酵解 PDF (143 kb)
16.糖异生和糖酵解 - 调控 PDF (133 kb)
17.脂质代谢 PDF (112 kb)
18.氨基酸脱氨基作用 – 尿素循环 PDF (87 kb)
19.嘌呤代谢 PDF (98 kb)
20.嘧啶代谢 PDF (104 kb)
21.戊糖磷酸途径 PDF (73 kb)
22.戊糖磷酸途径 - 途径II PDF (70 kb)
23.叶绿体的光合作用 PDF (631 kb)
24.光合作用 - 调控 PDF (461 kb)
25.叶绿体的夜间代谢活动 PDF (590 kb)
26.基础光合作用 PDF (489 kb)
27.光合作用 - 卡尔文(Calvin)循环 PDF (119 kb)
28.叶酸代谢 PDF (66 kb)
29.叶酸反应 PDF (63 kb)
30.叶酸与早期化疗 PDF (181 kb)
31.异戊二烯代谢 PDF (88 kb)
32.异戊二烯代谢产物 PDF (143 kb)
33.血红素代谢 PDF (123 kb)
34.前列腺素 PDF (245 kb)
35.ATP和组氨酸相互关系 PDF (75 kb)


 
致谢

衷心感谢给予这些作品以鼓励、指导和积极批评的生物化学家们,包括我在利兹大学生物化学和分子生物学学院的同事们,特别是Ed Wood。剑桥大学的Martin Brand和罗格斯大学的Malcolm Watford始终耐心贡献他们的专业知识,使一些最复杂和最重要的代谢图谱的准确度和清晰度得以提高。IUBMB命名委员会(Nomenclature Committee of the IUBMB)对代谢图谱进行了官方监督,其中一些最繁忙的成员花费了无数时间来评估和校正我在生物化学和印刷方面的许多错误。特别感谢剑桥国王学院的Hal Dixon、伦敦国王学院的Dick Cammack和都柏林圣三一学院的Keith Tipton。

Donald Nicholson