在下面的描述中,标记物被描述为基因或基因产物。

 

damGATC位点甲基化A。dam甲基模式用于区分旧的(甲基化的)和新的(未甲基化的)链,以达到损伤修复的目的(修复未甲基化的链)。Dam甲基化也用于计时复制(在两条链都被Dam甲基化之前不要复制)。这种甲基化会干扰几种限制性内切酶,包括BclI和ClaI。

 

dcm使CCWGG甲基化。

 

dnaJ伴侣蛋白。突变体可以稳定大肠杆菌中的一些蛋白质。

 

dutdUTPase,一种通过破坏dUTP阻止尿嘧啶掺入DNA的酶。Dut-ung双突变体在其DNA中积累了大量的尿嘧啶。

 

e14一种类似原噬菌体的元素,存在于K-12中,但在许多衍生物中缺失。e14携带mcrA基因,所以e14-菌株是mcrA-。

 

endAend1核酸酶的基因,大肠杆菌的主要核酸内切酶。

 

F一种自我传播的质粒(100 kb),赋予了菌毛制造能力(为“雄性”),从而会被男性特异性噬菌体(如M13)感染。

 

F'大肠杆菌中挑取一些染色体DNA的F质粒。F'可以有自己的基因型。两种流行的模型编码lacβ肽(ΔM15),或LacIQ

 

hsdRSM限制性酶系,在特定序列中对宿主DNA进行甲基化,并切割不被甲基化的DNA。R基因是核酸内切酶,M基因是甲基化酶,S基因是这两种酶发挥功能所必需的酶。因此hsdR突变体不具有核酸内切酶功能,但仍然甲基化。HsdS突变体不具有内切核酸酶或甲基化酶。两种流行的模型是大肠杆菌K的K系统和大肠杆菌B的B系统。

 

lacIQ过量产生lacI基因产物,lac操纵子的阻遏子。

 

lacY 乳糖通透酶。LacY突变体不能用于蓝/白筛选,但可用于调节IPTG诱导的基因表达中的基因表达。

 

lacZβ-半乳糖苷酶基因。Δ(lacZ)M15突变表达β片段。这常见于F’元件或缺陷型80φ原噬菌体上。许多质粒表达α片段。两者共同形成功能性β-半乳糖苷酶。

 

Δlac除了一些侧翼DNA外,还有三种常见的缺失,涉及整个lacZYA操纵子:ΔU169,ΔX111和ΔX74。

 

离子一种负责降解异常蛋白质和关闭sulA功能的蛋白酶。大肠杆菌B自然缺乏离子。

 

 mal B   malB 区域包含基因 malEFG malK lamB malM。Δ(malB)可删除整个区域的大部分或全部。LamB是λ噬菌体的受体。

 

mcr A 在某些序列中用甲基胞嘧啶限制DNA。当原噬菌体e14丢失时,McrA丢失。

 

mcr BC在某些序列中限制含有甲基胞嘧啶的DNA的系统。Δ(mcrC-mrr) 删除六个基因:mcrC-mcrB-hsdS-hsdM-hsdR-mrr

 

mrr甲基胞嘧啶和甲基腺嘌呤限制系统。

 

recA 大多数同源重组途径需要。

 

recB  ExoV函数需要。重组缺陷。

 

recC  ExoV函数需要。

 

recD  ExoV函数需要。RecD突变体可稳定反向重复序列,但会干扰质粒维持。

 

recF 质粒间同源重组所需的重组基因。

 

recJ 质粒间同源重组所需的重组基因。

 

 rpoH (或htpR热休克转录因子)需要用于表达一些热休克蛋白酶。

 

sbcB  核酸外切酶I功能所需。携带recB recCsbcB的菌株通常也是sbcC。这些四重突变株有完全重组能力并在λ中繁殖反向重复序列,但质粒复制异常。

 

sbcC有助于(与sbcB)抑制recBC突变体的作用。sbcC 突变体是Rec+并且在质粒中稳定地繁殖反向重复序列。

 

 supE (或glnV)突变型tRNA在UAG密码子处插入谷氨酰胺,以抑制读取框中的UAG突变。SupE是一些噬菌体突变体裂解生长所必需的。

 

supF(或tyrT)突变型tRNA在UAG密码子处插入酪氨酸,以抑制读取框中UAG突变的影响。这种突变是一些λ噬菌体(如λgt11)裂解生长所必需的。

 

 traD  F质粒的缀合缺陷突变体。

 

ung尿嘧啶N-糖基化酶中的突变体,一种从DNA中去除尿嘧啶的酶。ung突变体使尿嘧啶在DNA中持续存在。

 

Φ80dlacΔM15 对Φ80的一种有缺陷的原噬菌体衍生物具有溶原性。lacZΔM15等位基因为蓝白筛选提供β肽。

 

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