溴化乙锭

产品编号。E1510E1385E7637 和  E8751

同义词:溴化 3,8-二氨基-5-乙基-6-苯基菲啶;2,7-二氨基-10-乙基-9-苯基菲啶鎓溴化物;Homidium Bromide;Dromilac; EtBr

 产品描述

溴化 3,8-二氨基-5-乙基-6-苯基菲啶;2,7-二氨基-10-乙基-9-苯基菲啶鎓溴化物;Homidium Bromide;Dromilac; EtBr外观:红色至紫色粉末

分子式:C21H20N3Br

分子质量:394.3

熔点:255-266°C 下分解 1,2

光谱数据:

紫外/可见吸光度:

210 nm 处的最大值,EmM= 0.20-0.5; 285 nm, EmM= 5.0-10.0; 316 nm, EmM= 50.0; 343 nm, EmM= 40.0 (water)3

已发表的吸收光谱(甲醇),λmax 为 296 nm和

525 nm 1

λmax=475 nm,EmM=5.76(0.66 M 甘氨酸缓冲液)4

溶剂对吸光度的影响:

λmax=480 nm(水);515(甘油);520 nm(甲醇):520 nm(丙酮);532 nm(乙醇);535 (DMSO) 和 540 nm(吡啶)。 5 与核酸结合后,相对于水的最大吸光度红移到更长的波长。6,7

荧光:

报告的 EtBr-核酸复合物的激发/发射波长:

在 526 nm 处,Em 在 605 nm 处(含水)8

Ex 360 nm,Em 590 nm(在 PBS 中)9

Ex 在 525 nm,Em 在 600 nm (10 mM TBE,pH 8.0) 10

Ex(吸收)在 510 nm,Em 在 590 nm。11

Ex(吸收)在 482 nm(蓝绿色),Em 在 616 nm(红橙色)。12 随着溶剂极性的降低,EtBr 的荧光产率增加。13

溴化乙锭是生物技术研究中广为人知且应用广泛的荧光染料。早期的用法是作为兽医杀锥虫剂。 14 它是插入双链 DNA 和 RNA 的诱变化合物。 1,10 EtBr 的荧光在结合双链 RNA 时增加 21 倍,在结合双链 DNA 时增加 25 倍(尽管组蛋白阻断了 EtBr 与 DNA 的结合)。溴化乙锭已用于许多核酸的荧光分析。 15,16,17 它已被证明能与单链 DNA (尽管没有那么强) 2 和三链 DNA结合。 18 由于与 DNA 结合,EtBr 是 DNA 聚合酶的强力抑制剂。4

E7637,分子生物学级粉末 ,适用于凝胶电泳和 DNA 分离程序。E1510,水溶液 (10 mg/ml),适用于凝胶电泳和 DNA 分离过程。E1385 分子生物学级水溶液 (500 mg/ml),适用于凝胶电泳。

 

 相关产品

亚甲蓝 M4159 )被报告为另一种染色剂。 19 噻唑橙同源二聚体 (单体 = 产品编号 390062 被认为是非致突变的,但可用于检测琼脂糖凝胶中的 DNA。20

用于细胞研究, 二氢乙锭 (产品编号: D7008 ),也称为氢化乙锭,是一种可能的替代品。它是染料的还原形式,在细胞内被转化(脱氢)为乙锭阳离子,然后嵌入 DNA 中。21,22

目前,推荐的最终处置方法是焚烧,如 SDS 中所讨论的。23通过 Rohm 和 Haas Amberlite XAD-16 树脂的处理溶液被证明是有效的检测极限,没有发现完全净化的溶液具有致突变性。24,25我们提供 XAD-16 作为散装产品,以及几种吸附染料的产品,以便于处理。见 Rezorian A161 筒( 57611 57610 )和用于 EtBr 去污的 Extractor™ ( Z361569 )。在染料突破之前,可使用 5 mL Rezorian A161 滤芯处理超过 16L 的溶液(0.5 mg/L 的 EtBr)。鲁尔锁筒 可与 4 mm I.D. 管道、注射器或低压色谱系统配合使用。用于 EtBr 去污的 Extractor™ 可以处理多达 10L 的溶液(0.5 mg/L 的 EtBr)。处理 EtBr 水溶液的其他方法也被提出。 26,27,28 我们尚未验证,也未认可这些程序。
 

 准备说明

在室温下,将 10 mg/mL EtBr 溶于水中,生成红色溶液。2 在水中可溶浓度可达 20 mg/mL,在乙醇中可溶浓度可达 2 mg/mL。1 溶于 750 份氯仿中 1 份。3

如果避光,EtBr 在水或 PBS 中的储备溶液在室温下至少稳定两年。11

 储存/稳定性

这种固体粉末在室温下储存两年后,在避光的情况下变化很小。
 

 程序

用于电泳染色 6

  1. 染料通常以 0.5 mg/mL 掺入凝胶和电泳缓冲液中。注:在染料存在的情况下,线性双链 DNA 的电泳迁移率降低约 15%。
  2. 在凝胶运行后,将凝胶浸入电泳缓冲液或含有 EtBr (0.5 mg/mL) 的水中室温染色 30-45 min。 
  3. 脱色是可选的。如果通过在室温下将染色的凝胶浸泡在水或 1 mM MgSO4 中 20 min,可以降低未结合的 EtBr 引起的背景荧光,那么检测极少量 (10 ng) 的 DNA 会变得更容易


 材料

     

 参考文献

  1. Green, F.J., Sigma-Aldrich Handbook of Stains, Dyes and Indicators, p. 318.
  2. Internal quality control - molecular biology laboratories.
  3. Merck Index, 12th ed., #4767 (1996).
  4. W.H. Elliott, Biochem. J., 86, 562-567 (1963).
  5. Olmsted, J., III. and Kerans, D.R., Biochem., 16, 3647 (1977).
  6. Sambrook, J. et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd ed., (Cold Spring Harbor Laboratory, 1989), p 6.15, 6.44 etc.
  7. Le Pecq, J.-B., in Methods of Biochemical Analysis, 20, 43-86.
  8. Bechtol, K.B. et al., American Biotechnology Lab, p. 8, December 1994.
  9. Anal. Biochem., 65, 225 (1975).
  10. Severini, A. and Morgan, A.R., Anal. Biochem., 193, 83-89 (1991).
  11. Crary, B. and Boyrsenko, M., Biotechniques, 4, 98-101 (1986).
  12. Givan, A., Flow Cytometry: First Principles (Wiley-Liss, NY) p. 104 and p. 64,
  13. Methods in Enzymology, 32, 239 (1974).
  14. Watkins, T.I., J. Chem. Soc., 3059-3064, (1952).
  15. Moore, S.P. and Sutherland, B.M., Anal. Biochem., 144, 15-19 (1985).
  16. El-Hamalawi, A.-R. A. et al., Anal. Biochem., 67, 384 (1975).
  17. Karsten, U. and Wollenberger, A., Anal. Biochem., 77, 464 (1977).
  18. Scaria, P.V. and Shafer, R.H., J. Biol. Chem., 266, 5417-5423 (1991).
  19. Technique: A Journal of Methods in Cell and Molec. Biol., 1, 183-187 (1989).
  20. Wilke, W.W. et al., Mod. Pathol., 7 (3), 385-387 (1994).
  21. Saiki, I. et al., J. Natl. Cancer Inst., 77 (6),1235-1240 (1986).
  22. Budd, S.L et al., FEBS Lett., 415, 21-24 (1997).
  23. Corresponding Safety Data Sheet (SDS).
  24. Joshua, H., BioTechniques, 4 (3), 207-208 (1986).
  25.  Lunn, G. and Sansone, E.B., Biotech. Histochem., 66, 307-315 (1991).
  26. Lunn, G. and Sansone, E.B., Anal. Biochem., 162, 453 (1987).
  27. Communications from M.A. Armour, University of Alberta, Edmonton, Canada – prior to presentation at First Asian Symposium on Academic Activity for Water Treatment, Tokyo (1992).
  28. Zocher, R. et al., Biol. Chem. Hoppe Seyler, 369 (10), 1191-1194 (1988).