CRISPRILIB

Zestaw biblioteki całego ludzkiego genomu i długich niekodujących bibliotek CRISPRi

• Synonim(y): Biblioteka CRISPRi, Zestaw CRISPRi dla ludzkiego genomu
• NACRES: NE.02
• UNSPSC Code: 41105904

Właściwości

• packaging: pkg of 80 vials (4x50μL aliquots for each of the 20 kit components)
• application(s): CRISPR; CRISPR
• shipped in: dry ice
• storage temp.: −70°C

Opis

General description

CRISPRi to potężne narzędzie do modulowania ekspresji genów. Technologia ta wykorzystuje dCas9 do działania jako syntetyczne czynniki transkrypcyjne poprzez rekrutację endogennych kompleksów represorów transkrypcji do promotorów genów i wzmacniaczy, co skutkuje obniżeniem transkrypcji genów. CRISPRi osiąga fenotypy LOF bez ograniczeń RNAi i CRISPR KO, chociaż CRISPRi opiera się na dostarczaniu przez lentiwirusy, technologia ta oferuje nowe możliwości inżynierii genomu. CRISPRi może być stosowana indywidualnie, aby celować w obszary genomu, które są niedostępne dla innych technologii perturbacji genów (np. regiony niekodujące) lub w połączeniu, aby odkryć sieci regulacji genów leżące u podstaw dyskretnych fenotypów. Wreszcie, zbiorcze badania przesiewowe CRISPRi można łączyć z metodami sekwencjonowania RNA pojedynczych komórek, aby umożliwić wielowymiarową charakterystykę perturbacji genów CRISPR.

Human Whole Genome and Long Non Coding CRISPRi Library Kit zawiera 17 sub-puli 5 najlepszych gRNA na gen, a także oddzielną sub-pulę 5 dodatkowych gRNA na gen dla zwiększenia czułości i zawiera wbudowane niecelujące kontrole. Wszystkie pule są dostosowane funkcjonalnie w oparciu o liczbę przewodników, aby zapewnić około 3 powtórzeń w zależności od linii komórkowej przy 500 gRNA na komórkę. Wektory zawierają zarówno BFP, jak i puromycynę jako markery selekcji oraz zoptymalizowane rusztowanie dla ekspresji i funkcji sgRNA. Każda pula biblioteki zawiera niecelujące kontrole sgRNA. Efektor UCOE KRAB-dCas9 został zaprojektowany z myślą o spójnej ekspresji i hamowaniu, umożliwiając wyciszanie genów, badanie utraty funkcji przy mniejszym ryzyku toksyczności dla komórek z powodu przerwania podwójnej nici, co sprawia, że system CRISPRi jest idealnym wyborem do perturbacji niekodujących genów, zastosowań wymagających odwracalnego, miareczkowalnego rozwiązania i niezbędnych genów.

• Poszczególne klony CRISPRi można łatwo zamówić online lub kontaktując się z lokalnym przedstawicielem handlowym.
• Niestandardowe pule do dalszych badań przesiewowych lub pule CRISPR kompatybilne z 10x Genomics są również dostępne po skontaktowaniu się z lokalnym przedstawicielem handlowym.

Aby uzyskać więcej informacji na temat badań przesiewowych z użyciem CRISPRi/a, kliknij tutaj.

Application

• Genomika funkcjonalna / walidacja celu
• Bezstronne genetyczne badania przesiewowe całego genomu
• Konfiguracja i optymalizacja testów przesiewowych
• Stworzenie linii komórkowych stabilnie wyrażających KRAB-dCas9
• Zatwierdzone kontrole pozytywne i negatywne

Biochem/physiol Actions

Potęga CRISPR w inżynierii genomowej, w połączeniu z możliwością przeprowadzania badań przesiewowych na dużą skalę, całego genomu, utraty funkcji (LOF), pozwoliła na nowe przełomy w identyfikacji szlaków genowych w oporności na leki i chorobach. CRISPR jest najczęściej wykorzystywany do tworzenia dwuniciowych przerw, które często powodują utratę funkcji genów (CRISPR-KO). Jednak pełny zakres zastosowania CRISPR wykracza poza ukierunkowane cięcie DNA. Niezależne od nukleazy zastosowania CRISPR zapewniają taką samą specyficzność celowania, ale zamiast cięcia, CRISPRi pozwala na ukierunkowaną ingerencję w funkcję genu poprzez dostarczanie transkrypcyjnych domen represorowych do określonej sekwencji docelowej przy użyciu zmodyfikowanych kompleksów dCas9 + gRNA. Znokautowanie genów jest komplementarne do CRISPR-KO i CRISPRa (aktywacja) i ma wyraźną przewagę nad istniejącymi strategiami utraty funkcji, takimi jak RNAi. Nawiązaliśmy współpracę z Uniwersytetem Kalifornijskim w San Francisco, aby zapewnić najlepsze w swojej klasie narzędzia do badań przesiewowych CRISPRi.

Features and Benefits

• Kompletna, gotowa do użycia biblioteka CRISPRi dla całego genomu, ukierunkowana na kodujące białka i długie niekodujące RNA
• Najlepszy w swojej klasie algorytm selekcji gRNA UCSF i zoptymalizowane rusztowanie gRNA (F+E)
• Łatwość optymalizacji: Zatwierdzona kontrola pozytywna ukierunkowana na RAB1A i kontrola niecelująca do konfiguracji testu
• UCOE KRAB-dCas9 dla spójnej ekspresji efektora w szerokiej gamie linii komórkowych
• Biblioteki dostarczane w wysokim mianie funkcjonalnym, w oparciu o analizę FAC lub CFU
• Użyj puromycyny i / lub BFP jako markerów selekcji
• Cele genów z UCSF podzielone na kategorie funkcjonalne, zarówno kodujące, jak i lncRNA Kinazy, fosfatazy, cele leków Rak i apoptoza Stres i proteostaza Mitochondria, przemieszczanie się, ruchliwość Ekspresja genów Białka błonowe, nieprzypisane (nowe cele)

Other Notes

17 Subpools with a minimum concentration of 1x10⁸ TU/mL(via FACS assay)
CRISPRIL1: CRISPRi Pool H1 Top5 Kinase Phosphatase Drug Targets
CRISPRIL2: CRISPRi Pool H1 Supp5 Kinase Phosphatase Drug Targets
CRISPRIL3: CRISPRi Pool H2 Top5 Cancer Apoptosis
CRISPRIL4: CRISPRi Pool H2 Supp5 Cancer Apoptosis
CRISPRIL5: CRISPRi Pool H3 Top5 Stress Proteostasis
CRISPRIL6: CRISPRi Pool H3 Supp5 Stress Proteostasis
CRISPRIL7: CRISPRi Pool H4 Top5 Mitochondria Trafficking Motility
CRISPRIL8: CRISPRi Pool H4 Supp5 Mitochondria Trafficking Motility
CRISPRIL9: CRISPRi Pool H5 Top5 Gene Expression
CRISPRIL10: CRISPRi Pool H5 Supp5 Gene Expression
CRISPRIL11: CRISPRi Pool H6 Top5 Membrane Proteins
CRISPRIL12: CRISPRi Pool H6 Supp5 Membrane Proteins
CRISPRIL13: CRISPRi Pool H7 Top5 Unassigned
CRISPRIL14: CRISPRi Pool H7 Supp5 Unassigned
CRISPRIL15: CRISPRi Pool Long Noncoding iPSC and Common Cancer Cell Lines 1
CRISPRIL16: CRISPRi Pool Long Noncoding iPSC 13
CRISPRIL17: CRISPRi Pool Long Noncoding Common Cancer Cell Lines 2

2 Controls and 1 Effector Construct with a minimum concentration of 5x10⁵ TU/mL(via FACS or CFU assay)
CRISPRIE: KRAB-dCAS9 CRISPRi Construct Lentiviral Transduction Particles
CRISPRI01: CRISPRi Rab1a Control Lentiviral Transduction Particles
CRISPRI06: CRISPRi Nontargeting Control Puromycin Transduction Particles

Legal Information

Umowa licencyjna na użytkowanieCRISPR

Licencje na fluorofory Lentiviral, WPRE i Evrogen

Ta strona może zawierać tekst przetłumaczony maszynowo.

Informacja o środkach bezpieczeństwa

• Klasa składowania: 12 - Non Combustible Liquids