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Merck

Mechanism-Based Post-Translational Modification and Inactivation in Terpene Synthases.

ACS chemical biology (2015-09-18)
Roland D Kersten, Jolene K Diedrich, John R Yates, Joseph P Noel
RESUMEN

Terpenes are ubiquitous natural chemicals with diverse biological functions spanning all three domains of life. In specialized metabolism, the active sites of terpene synthases (TPSs) evolve in shape and reactivity to direct the biosynthesis of a myriad of chemotypes for organismal fitness. As most terpene biosynthesis mechanistically involves highly reactive carbocationic intermediates, the protein surfaces catalyzing these cascade reactions possess reactive regions possibly prone to premature carbocation capture and potentially enzyme inactivation. Here, we show using proteomic and X-ray crystallographic analyses that cationic intermediates undergo capture by conserved active site residues leading to inhibitory self-alkylation. Moreover, the level of cation-mediated inactivation increases with mutation of the active site, upon changes in the size and structure of isoprenoid diphosphate substrates, and alongside increases in reaction temperatures. TPSs that individually synthesize multiple products are less prone to self-alkylation then TPSs possessing relatively high product specificity. In total, the results presented suggest that mechanism-based alkylation represents an overlooked mechanistic pressure during the evolution of cation-derived terpene biosynthesis.

MATERIALES
Número de producto
Marca
Descripción del producto

Sigma-Aldrich
Hexano, ReagentPlus®, ≥99%
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Sigma-Aldrich
Yodoacetamida, BioUltra
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Sigma-Aldrich
Yodoacetamida, Single use vial of 56 mg
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Sigma-Aldrich
Urea, powder, BioReagent, Molecular Biology, suitable for cell culture
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Sigma-Aldrich
Yodoacetamida, ≥99% (NMR), crystalline
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Sigma-Aldrich
Urea, ACS reagent, 99.0-100.5%
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Sigma-Aldrich
BIS-TRIS propano, ≥99.0% (titration)
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Sigma-Aldrich
Hexano, Laboratory Reagent, ≥95%
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Supelco
Urea, 8 M (after reconstitution with 16 mL high purity water)
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Sigma-Aldrich
Urea solution, BioUltra, ~8 M in H2O
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Sigma-Aldrich
Urea, ReagentPlus®, ≥99.5%, pellets
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Sigma-Aldrich
Urea, BioUltra, Molecular Biology, 99% (T)
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Sigma-Aldrich
Urea, BioXtra, pH 7.5-9.5 (20 °C, 5 M in H2O)
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Sigma-Aldrich
Urea, suitable for electrophoresis
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Sigma-Aldrich
Urea, puriss., meets analytical specification of Ph. Eur., BP, USP, 99.0-100.5%, 99.0-101.0% (calc. on dry substance)
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Sigma-Aldrich
BIS-TRIS propano, BioXtra, ≥99.0% (titration)
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Sigma-Aldrich
Urea, meets USP testing specifications
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Sigma-Aldrich
4-Chlorotoluene, 98%
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SAFC
Yodoacetamida
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Sigma-Aldrich
Urea, puriss. p.a., ACS reagent, reag. Ph. Eur., ≥99%
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Sigma-Aldrich
BIS-TRIS propano, BioPerformance Certified, suitable for cell culture, ≥99.0%
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Sigma-Aldrich
Urea solution, 40 % (w/v) in H2O
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Sigma-Aldrich
Urea-12C, 99.9 atom % 12C
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