Funkcjonalna genomika przesiewowa
Funkcjonalna genomika umożliwia odkrywanie funkcji genów i ich zaangażowania w szlaki biochemiczne, komórkowe i fizjologiczne. Dostępność kompletnych sekwencji genomu, w połączeniu z łatwo programowalnymi narzędziami do modyfikacji genomu, pozwala na przeprowadzenie tych analiz w skali całego genomu. Podstawowym celem badań genomicznych jest zrozumienie powstawania określonego fenotypu poprzez modyfikację funkcji genów w ukierunkowany, celowy sposób. Gdy poszczególne geny są usuwane lub modulowane w komórce lub organizmie, zmiany w fenotypie lub zachowaniu mogą być bezpośrednio lub pośrednio obserwowane poprzez starannie zaplanowane eksperymenty. Funkcjonalna genomika przesiewowa pozwala na przeprowadzenie tej analizy w systematyczny i zrównoleglony sposób, wyjaśniając skomplikowane szlaki i stany chorobowe oraz ułatwiając identyfikację nowych celów leków.
Istnieją dwa podstawowe sposoby, w jakie genomika funkcjonalna może łączyć genetykę z fenotypem. Przesiewowe badania genetyczne obejmują modyfikację wielu genów, wybór komórek lub organizmów o interesującym nas fenotypie, a następnie identyfikację genów, których modulacja wywołała zmianę fenotypu. Odwrotne badania genetyczne analizują fenotyp komórek lub organizmów po zakłóceniu określonego genu lub kombinacji genów.
Nagrodzone kategorie
Kompleksowa analiza mikrobiomu jelitowego: Odkryj holistyczne rozwiązanie obejmujące przygotowanie próbek, sekwencjonowanie, bioinformatykę i statystyki. Od 16S do WGS.
Uwolnij moc naszego portfolio biomateriałów, nanomateriałów, materiałów energetycznych i elektronicznych do wszystkich badań i zastosowań przemysłowych.
Postępy w edycji genów, wyciszaniu genów, modulacji genów, sekwencjonowaniu następnej generacji (NGS) i fenotypowych technologiach przesiewowych umożliwiają wydajne wykonywanie funkcjonalnych ekranów genomowych w szerokiej gamie systemów modelowych.
- Interferencja RNA (RNAi): Do wyciszania genów można stosować kilka rodzajów odczynników RNAi, w tym długie dwuniciowe RNA (dsRNA), syntetyczne małe interferujące RNA (siRNA) i krótkie RNA ze spinką do włosów (shRNA). Te odczynniki RNAi są wprowadzane do komórek poprzez bezpośrednią transfekcję czynnika modulującego (siRNA i dsRNA), poprzez transfekcję DNA kodującego shRNA napędzane promotorem lub metodami transdukcji wirusowej przy użyciu konstruktów lentiwirusowych ze sklonowanymi kasetami shRNA. dsRNA i siRNA mogą być stosowane w ekranach tablicowych do badań przesiewowych o wysokiej przepustowości, podczas gdy shRNA mogą być wprowadzane do populacji komórek w ekranach tablicowych lub zbiorczych do analizy o wysokiej przepustowości, z ekranami zbiorczymi wykorzystującymi sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) do dekonwolucji.
- Systemy CRISPR-Cas: Systemy CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat) mogą być wykorzystywane do manipulowania genomami, transkryptomami i epigenomami komórek ssaków. W edycji genów CRISPR-Cas9 nukleaza Cas9 jest kierowana do określonego miejsca za pomocą RNA prowadzącego. W zależności od zastosowanego wariantu Cas9, CRISPR może być wykorzystywany do genetycznego wyciszania produkcji transkryptów poprzez wprowadzanie mutacji z przesunięciem ramki, represję maszyn transkrypcyjnych, rekrutację czynników transkrypcyjnych w celu aktywacji ekspresji, indukowanie ukierunkowanych mutacji punktowych lub modyfikowanie markerów epigenetycznych. Podobnie jak w przypadku RNAi, CRISPR może być wprowadzany bezpośrednio jako kompleks RNP w badaniach przesiewowych lub jako plazmidowe DNA lub lentiwirus do zastosowań zarówno w badaniach zbiorczych, jak i przesiewowych. Pule, biblioteki i tablice CRISPR ułatwiają wyjątkowo wszechstronne, wysokoprzepustowe badania przesiewowe genów do analizy funkcjonalnej. Badania przesiewowe z modulacją genomu są również możliwe dzięki beznukleazowemu systemowi CRISPR, który wykorzystuje enzymatycznie nieaktywny dCas9 w połączeniu z efektorami transkrypcji, które aktywują (CRISPRa) lub hamują (CRISPRi) transkrypcję genów, prowadząc do zwiększenia lub zmniejszenia ekspresji genów.
Odwiedź naszą wyszukiwarkę dokumentów, aby znaleźć arkusze danych, certyfikaty i dokumentację techniczną.
Powiązane artykuły
- Porównano metody transdukcji lentiwirusowej komórek Jurkat. Spinokulację porównano z całonocną inkubacją z polibarenem (bromkiem heksadimetryny) i płytkami pokrytymi fibroneką.
- CRISPR lentiviral screening libraries, partnered with 10x Genomics, offer powerful research tools for pooled screening.
- esiRNA are endoribonuclease prepared siRNAs that target the same mRNA sequence for gene silencing. Here are some of the most asked questions regarding esiRNA uses and availability.
- Genome-wide screening with optimized gRNAs per gene ensures specific and efficient knockout, controlling time and cost.
- Systemy wektorów lentiwirusowych mają priorytetowe znaczenie dla bezpieczeństwa, a środki ostrożności zapobiegają replikacji. Dobre praktyki obsługi są niezbędne do użytkowania.
- Zobacz wszystkie (21)
Powiązane protokoły
- Protokół odczynnika do transfekcji siRNA X-tremeGENE™ i rozwiązywanie problemów
- Dowiedz się więcej o CRISPR Cas9, czym jest i jak działa. CRISPR to nowe, przystępne cenowo narzędzie do edycji genomu, umożliwiające dostęp do edycji genomu dla wszystkich.
- Szczegółowa procedura przeprowadzania transdukcji lentiwirusowej cząsteczek MISSION shRNA w celu uzyskania stabilnego, długotrwałego wyciszenia i zmiany fenotypu.
- Lentiviruses represent a powerful tool in research applications to transduce a wide range of cell types.
- Determine optimal antibiotic concentration for stable cell lines, ensuring efficient selection in transduced cells.
- Zobacz wszystkie (8)
Znajdź więcej artykułów i protokołów
Jak możemy pomóc
W przypadku jakichkolwiek pytań, prosimy o przesłanie prośby o wsparcie klienta
lub rozmowę z naszym zespołem obsługi klienta:
Email custserv@sial.com
lub zadzwoń +1 (800) 244-1173
Dodatkowe wsparcie
- Chromatogram Search
Use the Chromatogram Search to identify unknown compounds in your sample.
- Kalkulatory i aplikacje
Web Toolbox - narzędzia naukowe i zasoby dla chemii analitycznej, nauk przyrodniczych, syntezy chemicznej i materiałoznawstwa.
- Customer Support Request
Obsługa klienta, w tym pomoc przy zamówieniach, produktach, kontach i kwestiach technicznych związanych z witryną.
- FAQ
Explore our Frequently Asked Questions for answers to commonly asked questions about our products and services.