07-360

Anti-Acetyl-Histon H3(Lys27)-Antikörper

serum, Upstate^®

• Synonym(e): H3K27Ac, Histone H3 (acetyl K27)
• UNSPSC Code: 12352203
• NACRES: NA.41
• eCl@ss: 32160702
• Clone: polyclonal
• Species reactivity: human, vertebrates, Saccharomyces cerevisiae
• Application: ChIP, DB, WB
• Citations: 178

Eigenschaften

• biological source: rabbit
• Quality Segment: 100
• antibody form: serum
• antibody product type: primary antibodies
• clone: polyclonal
• species reactivity: human, vertebrates, Saccharomyces cerevisiae
• species reactivity (predicted by homology): yeast (based on 100% sequence homology)
• manufacturer/tradename: Upstate^®
• technique(s): ChIP: suitable (ChIP-seq), dot blot: suitable, western blot: suitable
• isotype: IgG
• NCBI accession no.: NM_003493
• UniProt accession no.: P61830
• shipped in: dry ice
• target post-translational modification: acetylation (Lys27)
• Gene Information: human ... HIST1H3F(8968)

Beschreibung

General description

17 kDa

Histon H3 (UniProt: P61830) wird in Hefe vom Gen HHT1 (auch bekannt als YBR010W, YBR0201, HHT2, SIN2, YNL031C, N2749; Gen-ID: 852295) kodiert. Histon H3 ist eine Kernkomponente des Nukleosoms. Nukleosomen wickeln und komprimieren DNA in Chromatin, wodurch zellulären Mechanismen, die DNA als Matrize erfordern, der Zugang zur DNA erschwert wird. Histon H3 kann verschiedene posttranslationale Modifikationen durchlaufen, welche die Genexpression entweder aktivieren oder unterdrücken. Histon H3 kann eine Mono-, Di- oder Trimethylierung durchlaufen. Trimethyliertes H3K27 ist eng mit inaktiven Genpromotoren assoziiert und monomethyliertes H3K27 ist mit aktiven Promotoren assoziiert. Das dimethylierte H3K27 hat ein ähnliches Verteilungsmuster wie H3K27. Histon H3 kann auch eine Acetylierung an Lys9, 14, 18, 23, 27 und 56 durchlaufen. Die Acetylierung von Histon H3 führt zur Transkriptionsaktivierung. Die Acetylierung von Histon definiert die Offenheit von Chromatin, da acetylierte Histone nicht so dicht gepackt sein können wie deacetylierte Histone. H3K27ac ist eine wichtige Enhancer-Markierung, die zwischen aktiven und bereiten Enhancer-Elementen unterscheiden kann, und Enhancer-proximale Gene ohne H3K27ac-Anreicherung weisen geringere Expressionsstärken auf als durchschnittliche Enhancer-proximale Gene. Die Menge von H3K27ac sinkt schrittweise ab dem frühesten Pronukleusstadium bis zum 8-Zellen-Stadium, was der wichtigsten embryonalen Genomaktivierung (EGA) entspricht, gefolgt von einer erneuten Acetylierung von H3K27 ab dem Morulastadium, das die erste Zelllinienspezifikation von IVF-Embryos begleitet. Bei Drosophila liegt H3K27ac bei frühen Embryos in hohen Konzentrationen vor und sinkt nach 4 Stunden, wenn die Konzentration von trimethyliertem H3K27 steigt. (Literatur: Creyghton, MP et al. ( ). Proc. Natl. Acad. Sci. USA 107(50); 21931-21936; Tie, F et al (2009). Development 136 (18); 3131-3141).

Immunogen

Epitop: Lys27

KLH-konjugiertes lineares Peptid, das 11 Aminosäuren der N-terminalen Region des humanen, an Lysin 27 acetylierten Histon H3 entspricht.

Application

ChIP-Seq-Analyse: Die Chromatin-Immunpräzipitation wurde mit dem Magna ChIP HiSens-Kit (Katalognr. 17-10460), 2 µl Anti-Acetyl-Histon H3 (Lys27)-Antikörper (Katalognr. 07-360), 20 µl Protein A/G-Beads und 1E6 vernetztem HeLa-Zellen-Chromatin durchgeführt, gefolgt von einer DNA-Aufreinigung mit magnetischen Beads. Aus Input- und ChIP-DNA-Proben wurden unter Verwendung von Standardprotokollen mit barcodierten Illumina-Adaptern Bibliotheken erstellt und auf dem Illumina HiSeq-Instrument analysiert. Ein Übermaß von vierzehn Millionen Reads von FastQ-Dateien wurden nach der Entfernung des TagDust-Tags (http://genome.gsc.riken.jp/osc/english/dataresource/) mit Bowtie (http://bowtie-bio.sourceforge.net/manual.shtml) kartiert. Peaks wurden mit MACS (http://luelab.dfci.harvard.edu/MACS/) identifiziert, wobei Peaks und Reads im UCSC Genome Browser (http://genome.ucsc.edu) von BigWig und BED-Dateien als benutzerdefinierter Track dargestellt werden. Die höchsten 25 % der identifizierten Peaks in Datensatz 07-360 zeigten eine Überlappung von 96 % mit Peaks, die im Track ENCODE H3K27Ac BROAD Histone für HeLa-S3 identifiziert wurden.

Anti-Acetyl-Histon-H3(Lys27)-Antikörper ist ein polyklonaler Kaninchen-Antikörper für den Nachweis von an Lysin 27 acetyliertem Histon H3. Dieser Antikörper ist auch als Anti-H3K27ac bekannt, wurde in Peer-Reviewed-Fachzeitschriften publiziert, seine Spezifizität wurde mittels Dot Blot (DB) verifiziert und er wurde in ChIP, ChIP-Seq, WB, DB und Mplex validiert.

Forschungs-Unterkategorie
Histone

Forschungskategorie
Epigenetik und Zellkernfunktion

Biochem/physiol Actions

Erkennt an Lysin 27 acetyliertes Histon H3.

Physical form

Nicht aufgereinigt

Polyklonales Kaninchen-Antiserum mit 0,05 % Natriumazid und 30 % Glycerin.

Preparation Note

Bei -20 °C ab Versanddatum 2 Jahre haltbar. Aliquotieren, um wiederholtes Einfrieren und Auftauen zu vermeiden. Für maximale Produktrückgewinnung das Originalfläschchen nach dem Auftauen und vor dem Abnehmen der Kappe zentrifugieren.

Analysis Note

Kontrolle
Säureextrahierte Proteine aus HeLa-Zellen, die mit Natriumbutyrat behandelt wurden

Mittels Western Blot an Säureextrakt von mit 5 mmol/l Natriumbutyrat behandelten HeLa-Zellen beurteilt.

Western-Blot-Analyse: Eine 1:5.000-Verdünnung dieses Antikörpers wies Acetyl-Histon H3 (Lys27) in Säureextrakt von mit 5 mmol/l Natriumbutyrat behandelten HeLa-Zellen nach.

Other Notes

Konzentration: Die chargenspezifische Konzentration entnehmen Sie bitte dem Analysenzertifikat.

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• Lagerklasse: 12 - Non Combustible Liquids
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