General description
Die Nukleosomen-Umbaufaktor-Untereinheit BPTF (UniProt A2A654 und E9Q6A7; auch bekannt als Bromodomäne und PHD-Finger-haltiger Transkriptionsfaktor, Fetal Alz-50 Klon-1-Protein, Fötales Alzheimer-Antigen) wird bei Mäusen durch das Bptf-Gen (auch bekannt als Fac1, Falz) kodiert (Gen-ID: 207165). BPTF, SNF2L und pRBAP46/48 sind die drei Untereinheiten des Nukleosomen-Umbaufaktors NURF, eines ISWI-Chromatin-Umbaukomplexes, der das ATP-abhängige Nukleosomengleiten katalysiert. BPTF vermittelt die NURF-Zielstellenspezifität über Interaktionen mit Transkriptionsfaktoren, Histonvarianten und Histonmodifikationen auf transkriptionell aktiven Genen. BPTF spielt eine wichtige Rolle bei der Regulierung der Nukleosomenbesetzung in nukleosomenfreien Regionen (NFRs) an Stellen, die von den multivalenten Faktoren CTCF und Cohesin besetzt sind, und zwar durch direkte Interaktion mit CTCF und der Cohesin-Untereinheit SA2. Darüber hinaus interagiert BPTF auch mit c-MYC und spielt eine wesentliche Rolle bei dessen genomischer Verteilung und biologischer Aktivität. BPTF ist notwendig für das Überleben von c-MYC-überexprimierenden Zellen und für die c-MYC-gesteuerte Tumorgenese im Pankreas der Maus. Die Ausschaltung von BPTF führt zu einer verringerten Zugänglichkeit von c-MYC-Chromatin und verzögert die Tumorentwicklung in präneoplastischen Pankreas-Azinuszellen erheblich. Folglich korreliert die BPTF-Expression in humanen Tumoren positiv mit der Aktivierung von c-MYC-Gensignaturen.
~ 300 kDa gemessen. 333,2/321,6 kDa (Maus; UniProt A2A654/E9Q6A7) und 338,3/325,1/322,2 kDa (humane Isoform 1/2/3; UniProt Q12830) berechnet. In manchen Lysaten können nichtcharakterisierte Banden auftreten.
Immunogen
MBP-markiertes rekombinantes Maus-BPTF-Fragment aus der Region zwischen der dritten und vierten Coiled-Coil.
Application
Analyse mittels Chromatin-Immunpräzipitation (ChIP): Eine repräsentative Charge wies die BPTF-Chromatinverteilung an BPTF-Zielstellen durch ChIP-PCR mit einer Chromatinzubereitung aus embryonalen Stammzellen der Maus (mESC) nach (Mit freundlicher Genehmigung von Joseph Landry, Ph.D, Virginia Commonwealth University School of Medicine).
ChIP-Seq-Analyse: Eine repräsentative Charge lokalisierte die BPTF-Chromosom 19-Anreicherungsstellen durch ChIP-Seq-Analyse (Mit freundlicher Genehmigung von Joseph Landry, Ph.D, Virginia Commonwealth University School of Medicine).
Chromatin-Immunpräzipitation(ChIP)-Analyse: Eine repräsentative Charge wies die BPTF-Verteilung an Ctcf-gerichteten Chromatinstellen mit BPTF-abhängigen nukleosomfreien Regionen (NFR) mit einer Chromatinzubereitung aus embryonalen Stammzellen der Maus (mESC) nach (Qiu, Z., et al. (2015). Mol. Cell. Biol. 35(1):224-237).
Western-Blot-Analyse: Eine 1:1.250-Verdünnung einer repräsentativen Charge wies BPTF in 50 µg embryonalem Fibroblastenlysat von Wildtyp-, aber nicht BPTF-Knockout-Mäusen nach (Mit freundlicher Genehmigung von Joseph Landry, Ph.D, Virginia Commonwealth University School of Medicine).
Anti-BPTF (VCU19)-Antikörper, Katalognr. ABE1966 ist ein hochspezifischer polyklonaler Kaninchen-Antikörper, der auf BPTF abzielt und in Chromatin-Immunpräzipitation (ChIP), ChIP-seq und Western Blot geprüft wurde.
Forschungskategorie
Epigenetik & Zellkernfunktion
Biochem/physiol Actions
Die Spezifizität dieses polyklonalen Antikörpers wurde durch einen Zielbandennachweis mit embryonalem Fibroblastenlysat von Wildtyp-, aber nicht BPTF-Knockout-Mäusen bestätigt (Mit freundlicher Genehmigung von Joseph Landry, Ph.D, Virginia Commonwealth University School of Medicine).
Physical form
Affinitätsgereinigt.
Aufgereinigter polyklonaler Kaninchen-Antikörper in Puffer mit 0,1 mol/l Tris-Glycin (pH-Wert 7,4), 150 mmol/l NaCl mit 0,05 % Natriumazid.
Preparation Note
Bei 2–8 °C ab Empfangsdatum 1 Jahr haltbar.
Analysis Note
Beurteilt mittels Western Blot in NIH/3T3-Zelllysat.
Western-Blot-Analyse: Eine 1:2.000-Verdünnung dieses Antikörpers wies BPTF in 10 µg NIH/3T3-Zelllysat nach.
Other Notes
Konzentration: Die Konzentration entnehmen Sie bitte dem chargenspezifischen Datenblatt.
Disclaimer
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