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NGS 라이브러리 준비

NGS 라이브러리 준비

라이브러리 준비는 차세대 시퀀싱의 첫 번째 단계로, DNA 또는 RNA 샘플을 시퀀싱하기 전에 핵산을 분리하고, 단편화하고, 말단을 복구하고, 결합 또는 태그화 방법을 사용하여 어댑터에 공유 결합을 해야 합니다.잘 준비된 NGS 라이브러리의 복잡성은 샘플의 복잡성을 완전하고 정확하게 반영해야 하지만, 라이브러리 준비 과정에서 도입된 편향도 반영해야 합니다.차세대 시퀀싱을 위해 DNA 또는 RNA 라이브러리를 준비할 때 가장 중요한 목표는결과 라이브러리의 품질이 NGS 결과에 큰 영향을 미칠 수 있으므로 복잡성을 극대화하는 동시에 PCR 또는 기타 증폭으로 인한 편향을 줄이는 것입니다.

소프트랩은 워크플로우를 간소화하고 샘플 복잡성을 정확하게 표현하는 동시에 전체 유전체 시퀀싱(WGS), 전체 전사체 분석(WTA), 전체 RNA 시퀀싱, miRNA 및 작은 RNA 시퀀싱 애플리케이션을 위한 편향을 줄이는 고품질 DNA 또는 RNA 라이브러리를 쉽게 준비할 수 있도록 설계된 NGS 라이브러리 준비 도구 포트폴리오를 제공합니다.


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게놈 DNA 추출 키트

DNA 라이브러리 준비의 경우, 세포, 조직 또는 기타 샘플 유형에서 고분자량 게놈 DNA(gDNA)를  추출 해야 합니다. 정제된 게놈 DNA는 후속 증폭 또는 시퀀싱 반응에서 최적의 성능을 발휘하기 위해 전단 및 생물학적, 화학적 오염 물질이 최소화되어야 합니다.

고분자 DNA 추출 키트인 Fire Monkey™/Fire Flower™를 사용하면 전단 및 저분자 핵산 오염 물질을 최소화하면서 고순도 게놈 DNA를 분리할 수 있습니다.

  • Fire Monkey™는 표준 스핀 컬럼 공정으로 박테리아 또는 포유류 세포에서 평균 가닥 길이가 100kb인 고분자 DNA를 1시간 내에 추출할 수 있습니다.
  • Fire Flower™는 표준 스핀 컬럼 공정으로 15분 이내에 모든 샘플 소스에서 추출한 DNA의 크기를 측정할 수 있습니다. Fire Flower™는 전체 평균 가닥 길이를 30%까지 늘리면서 DNA 조각을 최대 30kb까지 고갈시킬 수 있습니다.

전장 유전체 증폭 키트

DNA 시퀀스 분석은 종종 소량의 사용 가능한 샘플 또는 낮은 추출 수율로 인해 제한을 받습니다. 제한된 출발 물질을 얻을 수 있는 경우, 증폭 기술을 사용하여 출발 DNA의 양을 늘릴 수 있습니다. 전체 게놈 증폭(WGA)을 사용하여 온전한 DNA 샘플과 고도로 단편화된 DNA 샘플을 모두 사전 증폭하여 NGS 워크플로우에 입력할 수 있습니다.

'SeqPlex-I WGA 키트'는 소량의 DNA 또는 분해되거나 고도로 단편화된 DNA를 증폭하여 Illumina® 차세대 시퀀싱(NGS) 플로우 셀에 직접 입력할 수 있도록 합니다.

  • 최소 100pg의 DNA에서 시퀀싱을 용이하게 합니다
  • 완전한 게놈 커버리지를 위한 향상된 프라이머, 최소한의 시퀀스 편향, 차세대 시퀀싱(NGS)에 이상적인 앰플리콘 크기
  • 비용 효율적: 추가 NGS 라이브러리 준비 단계 없음
  • 일루미나® 차세대 시퀀싱과 호환 가능

The SeqPlex 전체 게놈 증폭을 위한 향상된 DNA 증폭 키트는 극소량 또는 분해/고도로 단편화된 DNA로부터 차세대 시퀀싱을 용이하게 하도록 설계되었습니다. 이 키트는 Illumina®, SOLiD™ 또는 454 시퀀싱 워크플로우에 통합되도록 개발되었습니다.

  • 랜덤 프라이밍 기술은 ChIP 또는 FFPE와 같은 단편화된 DNA를 증폭합니다
  • 최소 100 pg&에서 시퀀싱을 용이하게 합니다.의 ChIP DNA
  • 완전한 게놈 커버리지, 최소 시퀀스 편향 및 프라이머 제거를 위한 향상된 프라이머
  • 일루미나®와 호환 가능,  SOLiD™ 또는 차세대 시퀀싱을 위한 454 라이브러리 준비

전사체-암호화 키트

주요 목표

;RNA-Seq을 위한 NGS 라이브러리를 준비할 때 가장 중요한 목표는 편향성을 줄이면서 시작 시퀀스 풀을 완전히 대표할 수 있도록 전사체 라이브러리의 복잡성을 극대화하는 것입니다.고처리량 유전자 발현 프로파일링 및 전사체 분석을 위한 RNA-Seq은 일반적으로 적은 양의 시작 RNA로 인해 어려움을 겪습니다. 전체 전사체 증폭(WTA)은 소량의 RNA로부터 충분한 양의 시퀀싱 타깃을 생성하는 데 사용할 수 있지만;라이브러리 편향을 줄이기 위해 특정 mRNA의 손실이나 왜곡 없이 높은 충실도의 전사체 복제가 필요합니다.

'SeqPlex-I WTA 키트'를 사용하면 소량의 역전사 RNA 또는 분해된 RNA를 증폭하여 Illumina® 차세대 시퀀싱(NGS) 흐름 셀에 직접 입력할 수 있습니다.

  • 단편화된 또는 극소량의 전체 RNA를 증폭합니다. FFPE 및 RIP를 포함한 모든 소스의 단편화된 또는 온전한 RNA는 무작위 프라이밍 기술을 사용하여 쉽게 증폭할 수 있습니다.
  • 반분열 라이브러리 프라이머 설계로 보다 완전한 전사체 커버리지와 효율적인 프라이밍을 보장합니다
  • 더 적은 단계: 시퀀싱 전에 cDNA를 단편화할 필요가 없습니다
  • 고효율: 8시간 이내에 ds-cDNA를 증폭합니다
  • 비용 효율적: 더 이상 추가적인 NGS 라이브러리 준비 단계가 필요하지 않습니다
  • 일루미나® 차세대 시퀀싱과 호환됩니다

The 전체 전사체 증폭(WTA)을 위한 SeqPlex RNA 증폭 키트는 소량 또는 분해/고도로 단편화된 RNA(예.예: 포르말린 고정 파라핀 포매(FFPE) 조직 샘플에서 추출한 RNA). SeqPlex 키트를 사용하면 NGS 워크플로우에 입력하기 위해 RNA 샘플을 사전 증폭할 수 있습니다.

  • 랜덤 프라이밍 기술은 FFPE 및 RIP를 포함한 모든 소스에서 소량의 단편화 또는 온전한 RNA를 증폭합니다.
  • 보다 완전한 전사체 커버리지와 효율적인 프라이밍을 위한 반분열 라이브러리 프라이머 설계
  • 시퀀싱 전에 DNA를 단편화할 필요가 없습니다.
  • 8시간 이내에 ds-cDNA를 증폭합니다.
  • 태평양 바이오사이언스를 제외한 모든 차세대 시퀀싱 플랫폼과 호환됩니다.

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