T_m 계산 및 프라이머 분석을 위한 OligoEvaluator™

DNA 또는 RNA 프라이머용 올리고평가기

올리고평가기는 올리고뉴클레오타이드용 프라이머 분석 툴입니다. 올리고뉴클레오타이드의 이차 구조, 프라이머 이량체 형성 및 물리적 특성을 분석합니다.

PCR용 프라이머 분석 값을 제공하는 온라인 올리고뉴클레오티드 서열 계산기인 OligoEvaluator™를 제공하게 되어 기쁩니다.

• 염기 수
• 분자량
• 소멸 계수
• 올리고 유형

• µg/OD at 260 nm
  
• 길이(염기쌍)
• 프라이머 용융 온도 Tm (°C)

• GC 내용 %
  
• GC 클램프
• 런 길이 (bp)

• 2차 구조
  
• 프라이머 이합체 확인
  
• BLAST 시퀀스 링크

올고이밸레이터™는 사용하기 쉽습니다. DNA 또는 RNA를 선택하고 서열을 붙여넣은 다음 계산을 클릭하면 올고이밸레이터™ 도구가 값을 반환합니다. 보고된 모든 속성은 편리한 Excel 템플릿으로 내보낼 수 있습니다.

올리고 특성, 재현탁 및 희석 계산

올고평가기™는 세 가지 모듈로 구성되어 있습니다. 분석을 선택하면 한 번에 최대 10개의 프라이머의 전체 특성을 확인할 수 있습니다. 재현탁 및 희석은 OligoEvaluator™ 내에서 별도의 계산기 모듈입니다.

계산기 고급 기능

반응 조건

올고평가자™ 계산기에서 사용되는 정의 및 값

매개변수	값
올리고 농도	기본값 = 250.0 nM.
1가 이온 농도	이 값은 반응 혼합물에 존재하는 모든 1가 이온(예: K+)의 농도입니다. K+은 음전하를 띤 프라이머와 템플릿 백본 사이의 전하 반발력을 줄여 어닐링을 촉진합니다. 기본값 = 100.0mM입니다.
자유 Mg++ 이온 농도	반응 혼합물 내 Mg2+(마그네슘 이온)의 농도입니다. Mg2+은 열안정성 DNA 중합 효소에 필요한 보조 인자입니다. 기본값은 5.0mM입니다.
총 Na[+] 등가물	나트륨 등가물은 다음과 같이 계산됩니다: [Na+] = 1가 이온 농도 + 4 × (유리 Mg2+) 1/2(모두 몰도) 기본값 = 382.84 mM
자유 에너지 계산을 위한 온도	이 값은 ΔG = ΔH - T ΔS 공식에서 깁스 자유 에너지(ΔG)를 계산하는 데 사용됩니다. 기본값은 25.0°C(298K)입니다.

프라이머의 어닐링 온도는 어떻게 계산하나요?

올리고평가기™는 올리고의 용융 온도를 제공합니다. 계산기 분석 모듈에 시퀀스를 입력하면 일곱 번째 열에서 T_m을 확인할 수 있습니다. 어닐링 온도는 일반적으로 T_m 값보다 몇도 낮아야 합니다. 용융 온도에 대한 자세한 정보는 올리고핵산염 용융 온도 문서에서 확인할 수 있습니다.

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제품

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