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WTA1
TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit
DNA polymerase separate.
Synonym(e):
TransPlex® Gesamt-Transkriptom Amplifikations-Kit, Transkriptom-Amplifikationskit
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Über diesen Artikel
NACRES:
NA.55
UNSPSC Code:
41121800
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technique(s)
whole genome amplification: suitable
dilution
(WTA)
input
purified DNA
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wet ice
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−20°C
General description
TransPlex® ist eine Methode zur Amplifikation des Gesamttranskriptoms (GTA). Sie ermöglicht die repräsentative Amplifikation von Nanogramm-Mengen der Gesamt-RNA in weniger als 4 Stunden ohne 3′-Verzerrung. Mikrogramm-Mengen von Amplifikationsprodukten, die aus Gewebe, kultivierten Zellen, formalinfixierten Proben oder Serum gewonnen wurden, eignen sich für Downstream-Anwendungen wie qPCR oder Microarray-Analysen.
Application
Das TransPlex® Gesamttranskriptom-Amplifikations-Kit dient zur Synthese von Doppelstrang-cDNA. Es wird außerdem für die Amplifikation von cDNA eingesetzt.
Geeignet zur Verwendung mit nachgelagerten Anwendungen, darunter:
- qPCR
- Microarray-Analyse
- Klonierung
Biochem/physiol Actions
Das WTA-Verfahren umfasst zwei Schritte. Im ersten Schritt wird die Proben-RNA mit nicht-selbstkomplementären Primern, die ein quasi-randomisiertes 3′-Ende und ein universelles 5′-Ende besitzen, revers transkribiert. Im Verlauf der Polymerisation dienen verschobene Einzelstränge als neue Templates für das Primer-Annealing und die Extension. Die resultierende OmniPlex cDNA-Bibliothek besteht aus zufällig generierten, überlappenden Fragmenten mit einer Länge von 100–1.000 Basen, die flankiert sind von der universellen Endsequenz. Ihre Amplifikation mittels PCR mit dem Universalprimer ergibt dann das WTA-Produkt.
Features and Benefits
- Amplifikation der Gesamt-RNA in weniger als 4 Stunden mit unter 30 Minuten tatsächlicher Bearbeitungszeit
- Nur 5 ng Ausgangsmaterial sind erforderlich, um eine hochgradig repräsentative Bibliothek der Gesamt-RNA zu erstellen
- Mikrogramm-Mengen von Amplifikationsprodukten, die aus intakter RNA aus Gewebe, Kulturzellen, Serum oder zersetzter RNA aus formalinfixierten, in Paraffin eingebetteten Proben gewonnen wurden
Legal Information
TransPlex is a registered trademark of Rubicon Genomics, Inc.
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Dieser Artikel | |||
|---|---|---|---|
| description DNA polymerase separate. | description DNA polymerase included, Complete Kit with optimized enzyme to amplify total RNA in <4 hours, no 3′ bias | description For use with high throughput sequencing technologies | description For use with high throughput sequencing technologies, Whole Genome Amplification kit designed to facilitate Next Gen Sequencing. |
| technique(s) whole genome amplification: suitable | technique(s) whole genome amplification: suitable, whole transcriptome amplification: suitable | technique(s) whole genome amplification: suitable | technique(s) whole genome amplification: suitable |
| shipped in wet ice | shipped in wet ice | shipped in wet ice | shipped in wet ice |
| input purified DNA | input purified RNA | input purified RNA | input purified DNA |
| dilution (WTA) | dilution - | dilution (WTA) | dilution (WGA) |
| storage temp. −20°C | storage temp. −20°C | storage temp. −20°C | storage temp. −20°C |
| Quality Level 200 | Quality Level 200 | Quality Level 200 | Quality Level 200 |
Signalwort
Warning
Gefahrencodes
Sicherheitshinweise
Hazard Classifications
Eye Irrit. 2 - Skin Irrit. 2
Flammpunkt (°F)
Not applicable
Flammpunkt (°C)
Not applicable
Was ist los?
WGK 3
Lagerklasse
12 - Non Combustible Liquids
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What is the Department of Transportation shipping information for this product?
1 answer-
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What is the difference between WTA and WGA? I use the TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit, Product WTA1.
1 answer-
The starting material for WTA is RNA, whereas for WGA it is genomic DNA. After the RNA is reverse-transcribed into the DNA complement by WTA, the OmniPlex library is formed. This library is in turn amplified by PCR.
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Can TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit, Product WTA1, be used to amplify archival fixed tissue or degraded samples?
1 answer-
Yes, the WTA kit effectively amplifies degraded RNA, including formalin-fixed and paraffin-embedded samples.
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Is the TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit, Product WTA1, also applicable for ribosomal RNA and/or small RNA amplification?
1 answer-
Using the kit as is, Ribosomal RNA does appear to amplify. However, we have not quantitated how well it is amplified.
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What is the concentration of the dNTPs supplied with the TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit, Product WTA1?
1 answer-
The dNTP Mix (D6193) is supplied as 10 mM each.
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Can TransPlex® Whole Transcriptome Amplification Kit, Product WTA1, be used for downstream applications?
1 answer-
Upon creation of a cDNA library, quantitative qPCR or microarray analysis may be performed
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