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  • Investigations on the interactions of DiAmsar with serum albumins: Insights from spectroscopic and molecular docking techniques.

Investigations on the interactions of DiAmsar with serum albumins: Insights from spectroscopic and molecular docking techniques.

Luminescence : the journal of biological and chemical luminescence (2014-10-15)
Zari Hooshyar, Ghasem Rezanejade Bardajee, Nahaleh Kakavand, Mohaddeseh Khanjari, Nastaran Dianatnejad
ZUSAMMENFASSUNG

Diamine-sarcophagine (DiAmsar) binding to human serum albumin (HSA) and bovine serum albumin (BSA) was investigated under simulative physiological conditions. Fluorescence spectra in combination with Fourier transform infrared (FT-IR), UV-visible (UV-vis) spectroscopy, cyclic voltammetry (CV), and molecular docking method were used in the present work. Experimental results revealed that DiAmsar had an ability to quench the HSA and BSA intrinsic fluorescence through a static quenching mechanism. The Stern-Volmer quenching rate constant (Ksv ) was calculated as 0.372 × 10(3)  M(-1) and 0.640 × 10(3)  M(-1) for HSA and BSA, respectively. Moreover, binding constants (Ka ), number of binding sites (n) at different temperatures, binding distance (r), and thermodynamic parameters (∆H°, ∆S°, and ∆G°) between DiAmsar and HSA (or BSA) were calculated. DiAmsar exhibited good binding propensity to HSA and BSA with relatively high binding constant values. The positive ∆H° and ∆S° values indicated that the hydrophobic interaction is main force in the binding of the DiAmsar to HSA (or BSA). Furthermore, molecular docking results revealed the possible binding site and the microenvironment around the bond.

MATERIALIEN
Produktnummer
Marke
Produktbeschreibung

Sigma-Aldrich
Ethyl alcohol, Pure, 200 proof, anhydrous, ≥99.5%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Methanol, anhydrous, 99.8%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natronlauge, BioUltra, Molecular Biology, 10 M in H2O
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natronlauge, 1.0 N, BioReagent, suitable for cell culture
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Salzsäure -Lösung, 1.0 N, BioReagent, suitable for cell culture
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Ethyl alcohol, Pure, 190 proof, ACS spectrophotometric grade, 95.0%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Salzsäure, 36.5-38.0%, BioReagent, Molecular Biology
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Supelco
Salzsäure -Lösung, volumetric, 0.1 M HCl (0.1N), endotoxin free
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Salzsäure -Lösung, ~6 M in H2O, for amino acid analysis
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Chlorwasserstoff, ReagentPlus®, ≥99%
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Chlorwasserstoff -Lösung, 3 M in cyclopentyl methyl ether (CPME)
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natriumhydroxid, BioUltra, suitable for luminescence, ≥98.0% (T), pellets
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Salzsäure -Lösung, 32 wt. % in H2O, FCC
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Zinn(II)-chlorid Dihydrat, ≥99.99% trace metals basis
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Natriumhydroxid, ultra dry, powder or crystals, 99.99% trace metals basis
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Zinn(II)-chlorid Dihydrat, ≥99.97% trace metals basis
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Tris(ethylendiamin)cobalt(III)-chlorid Dihydrat
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Methanol, suitable for NMR (reference standard)
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
Methanol -Lösung, suitable for NMR (reference standard), 4% in methanol-d4 (99.8 atom % D), NMR tube size 3 mm × 8 in.
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.
Sigma-Aldrich
3-Ethyl-2,4-pentandion, Tautormermischung, 98%
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Sigma-Aldrich
Natriumhydroxid-16O -Lösung, 20 wt. % in H216O, 99.9 atom % 16O
Preise und Verfügbarkeit sind derzeit nicht verfügbar.