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  • Structure-Function Analyses of the Interactions between Rab11 and Rab14 Small GTPases with Their Shared Effector Rab Coupling Protein (RCP).

Structure-Function Analyses of the Interactions between Rab11 and Rab14 Small GTPases with Their Shared Effector Rab Coupling Protein (RCP).

The Journal of biological chemistry (2015-06-03)
Patrick Lall, Andrew J Lindsay, Sara Hanscom, Tea Kecman, Elizabeth S Taglauer, Una M McVeigh, Edward Franklin, Mary W McCaffrey, Amir R Khan
ABSTRACT

Rab GTPases recruit effector proteins, via their GTP-dependent switch regions, to distinct subcellular compartments. Rab11 and Rab25 are closely related small GTPases that bind to common effectors termed the Rab11 family of interacting proteins (FIPs). The FIPs are organized into two subclasses (class I and class II) based on sequence and domain organization, and both subclasses contain a highly conserved Rab-binding domain at their C termini. Yeast two-hybrid and biochemical studies have revealed that the more distantly related Rab14 also interacts with class I FIPs. Here, we perform detailed structural, thermodynamic, and cellular analyses of the interactions between Rab14 and one of the class I FIPs, the Rab-coupling protein (RCP), to clarify the molecular aspects of the interaction. We find that Rab14 indeed binds to RCP, albeit with reduced affinity relative to conventional Rab11-FIP and Rab25-FIP complexes. However, in vivo, Rab11 recruits RCP onto biological membranes. Furthermore, biophysical analyses reveal a noncanonical 1:2 stoichiometry between Rab14-RCP in dilute solutions, in contrast to Rab11/25 complexes. The structure of Rab14-RCP reveals that Rab14 interacts with the canonical Rab-binding domain and also provides insight into the unusual properties of the complex. Finally, we show that both the Rab coupling protein and Rab14 function in neuritogenesis.

MATERIALI
Numero di prodotto
Marchio
Descrizione del prodotto

Sigma-Aldrich
Cloruro di magnesio, Molecular Biology, 1.00 M±0.01 M
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Imidazolo, ReagentPlus®, 99%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
DL-Dithiothreitol solution, BioUltra, Molecular Biology, ~1 M in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, Molecular Biology, DNase, RNase, and protease, none detected, ≥99% (titration)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Cloruro di magnesio, ≥98%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Imidazolo, ACS reagent, ≥99% (titration)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, 5 M in H2O, BioReagent, Molecular Biology, suitable for cell culture
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, BioXtra, ≥99.5% (AT)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥99%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, 0.9% in water, BioXtra, suitable for cell culture
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Supelco
DL-Dithiothreitol solution, 1 M in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fenil metansolfonile fluoruro, ≥98.5% (GC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, ACS reagent, 99.4-100.6%, powder
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Imidazolo, Molecular Biology, ≥99% (titration)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, anhydrous, crystalline, BioReagent, suitable for cell culture
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid solution, 0.02% in DPBS (0.5 mM), sterile-filtered, BioReagent, suitable for cell culture
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
SAFC
Sodio cloruro, 5 M
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Cloruro di magnesio, powder, <200 μm
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Imidazolo, BioUltra, ≥99.5% (GC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fenil metansolfonile fluoruro, ≥99.0% (T)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, 99.995% trace metals basis
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ethylenediaminetetraacetic acid, BioUltra, anhydrous, ≥99% (titration)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Imidazole buffer Solution, BioUltra, 1 M in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Imidazolo, puriss. p.a., ≥99.5% (GC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, BioUltra, Molecular Biology, ≥99.5% (AT)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Cloruro di magnesio, BioUltra, Molecular Biology, 2 M in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, BioUltra, Molecular Biology, ~5 M in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Cloruro di magnesio, BioUltra, Molecular Biology, ~1 M in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Cloruro di magnesio, suitable for insect cell culture, BioReagent, ≥97.0%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Cloruro di magnesio, PCR Reagent, 25 mM MgCI2 solution for PCR
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili