Vordefinierte siRNA
MISSION® vordefinierte siRNA wurde mit Hilfe des proprietären Rosetta Inpharmatics siRNA Design-Algorithmus in einer exklusiven Partnerschaft mit Merck & Co. entwickelt. Der Rosetta siRNA Design-Algorithmus nutzt positionsspezifische Bewertungsmatrizes und Wissen über die Keimregion, um die spezifischsten und effektivsten Sequenzen für Ihre Zielgene vorherzusagen. Die Regeln des Algorithmus wurden auf der Grundlage empirischer Daten entwickelt, die in dreijährigen Experimenten zur Genstilllegung gesammelt wurden.
Produktvorteile
- Erstklassige, garantierte Genstilllegung
- Effizientes Knockdown gering abundanter Signale
- Vereinfachte Transfektionsoptimierung mit 11 Positivkontroll-siRNA
- Unterscheidung zwischen sequenzspezifischer Stilllegung und unspezifischen Effekten mit 8 Negativkontroll-siRNA
- Hunderte funktional validierter, vordefinierter siRNA
Produktmerkmale
- Spezies: Mensch, Maus und Ratte
- Mengen: 2 (10 nmol), 5 (25 nmol) & 10 (50 nmol) OD
- Aufreinigung: Entsalzen & HPLC
- Sequenzform: 21mer-Duplexe mit dTdT-Überhängen
- Qualitätskontrolle: 100 % Massenspektrometrie*
- Format: Lieferung trocken in Röhrchen
*Je nach Herstellungsort kann PAGE zur Bewertung von siRNA-Duplexen verwendet werden.
Vordefinierte Garantie
Mindestens zwei von drei gekauften MISSION® vordefinierten siRNA, die auf dasselbe Gen abzielen, werden den Ziel-mRNA-Spiegel in kultivierten Zellen um 75 % reduzieren, wenn sie mit einer Konzentration von ≥ 30 nM transfiziert werden. Wenn zwei der siRNA beim Zielgen keinen Knockdown von 75 % bewirken, stellen wir kostenfrei drei weitere siRNA für dieses Gen zur Verfügung. Falls es keine siRNA mehr für dieses Gen gibt oder alle siRNA das Zielgen nicht um 75 % vermindern, erstatten wir den Kaufpreis zurück.
Für die Gültigkeit der Garantie ist der Erhalt geeigneter unterstützender Daten zur Transfektionseffizienz erforderlich. Geeignete unterstützende Daten für die Transfektionseffizienz sollten qPCR-Daten umfassen, die die Ziel-mRNA-Spiegel einer MISSION Positivkontroll-siRNA (GAPDH, MAPK1, TP53 usw.), die mit ≥ 30 nM transfiziert wurde, mit einer geeigneten Negativkontrolle (z. B. eine Mock-Transfektion, eine scrambled siRNA-Sequenz oder eine MISSION Universal Negativkontroll-siRNA) vergleichen, die einen Knockdown der Ziel-mRNA von 75 % belegt.
Aufgrund der Variabilität von Antikörpern und Protein-Halbwertszeiten können wir keine Daten aus proteinbasierten Nachweisverfahren akzeptieren.
Produktgruppen
Ein beliebtes gepooltes Format sind 4 Duplexe zu je 5 nmol in einem Röhrchen (20 nmol gepoolt) und die gleichen 4 Duplexe zu je 5 nmol in separaten Röhrchen (weitere 20 nmol individuell). Unsere ausgeklügelten Geräte für die Flüssigkeitsverarbeitung bieten jedoch eine Vielzahl weiterer Möglichkeiten. Für eine Machbarkeitsprüfung Ihrer spezifischen Anforderungen wenden Sie sich bitte an [email protected].
Validierte siRNA
Viele häufig vorkommende Gentargets wurden für mRNA-Knockdowns ≥ 75 % validiert (Abbildung 1 mit Beispieldaten und der Tabelle für eine nach Gensymbolen geordnete Liste häufig bestellter, validierter siRNA). Validierte siRNA eignen sich sowohl für die Transfektionsoptimierung als auch für Positivkontrollen.

Abbildung 1.HeLa-Zellen, die mit vordefinierter siRNA bei einer Konzentration von 30 nM transfiziert wurden. Der prozentuale Anteil der verbleibenden Genexpression wurde 48 Stunden nach der Transfektion mittels qPCR gemessen (in Relation zu mock). Die Daten stellen den Mittelwert vier biologischer Replikate dar.
| Validierte siRNA nach Gensymbol | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ABCC1 | CDC7 | DYRK1A | IGFBP4 | MLH1 | PIK3R4 | PRPS1 | SIK2 |
| ACP1 | CDC73 | DYRK1B | IL6ST | MSH2 | PIM2 | PRSS23 | SLC16A1 |
| ACP2 | CDK1 | EEF2K | ILK | MST4 | PIN1 | PSEN1 | SLC25A17 |
| ACVR1 | CDK11B | EIF2AK4 | IMPA2 | MTA2 | PINK1 | PSEN2 | SLC2A1 |
| ACVR1B | CDK17 | EIF4A3 | INPPL1 | MTM1 | PIP4K2B | PSMA7 | SLC30A1 |
| ADAM10 | CDK2 | EMR2 | IP6K1 | MTMR1 | PIP5K1A | PSMB4 | SLK |
| ADAM12 | CDK4 | ENPP1 | IP6K2 | MTMR2 | PKN2 | PSMB5 | SMU1 |
| ADAM15 | CDK5 | EPHA5 | IPMK | MTMR3 | PLAUR | PSMB6 | SNRK |
| ADIPOR1 | CDK6 | EPHB4 | IRAK1 | MTMR6 | PLK1 | PSPH | SORT1 |
| ADIPOR2 | CDK7 | F3 | IRAK4 | MTOR | PLK4 | PTK2 | SRC |
| ADRBK1 | CDK8 | FADD | ITPK1 | NADK | POLK | PTP4A1 | SRPK1 |
| AKT1 | CDK9 | FDFT1 | JAK1 | NCSTN | PPAP2C | PTPLA | ST7 |
| AKT2 | CDKL5 | FER | JUND | NDRG1 | PPAT | PTPN1 | STAT3 |
| ALPL | CDKN1B | FMNL1 | JUP | NEDD8 | PPM1D | PTPN11 | STK16 |
| APP | CDKN3 | FURIN | LANCL1 | NEK2 | PPME1 | PTPN12 | STK24 |
| ARAF | CELSR1 | FYN | LATS1 | NEK6 | PPP1CA | PTPN14 | STK3 |
| ARHGDIA | CERK | FZD4 | LDHA | NEK7 | PPP1CB | PTPN23 | STYX |
| ATF1 | CHEK1 | FZD5 | LEPR | NEK9 | PPP1CC | PTPN9 | TAOK1 |
| ATM | CHUK | FZD6 | LGALS3 | NET1 | PPP1R11 | PTPRE | TAOK3 |
| ATP6V0C | CKS2 | GLTSCR2 | LIMK2 | NF1 | PPP1R12A | PTPRF | TBK1 |
| ATR | CLPP | GPRC5A | LRP5 | NLN | PPP1R2 | PTPRJ | TEK |
| AURKB | CPE | GRB2 | LRP6 | NME1 | PPP1R3C | PTPRK | TESK1 |
| AXIN1 | CPT1A | GRK6 | LTBR | NME1-NME2 | PPP1R7 | PTPRS | TFRC |
| AXL | CRKL | GRN | LYN | NME2 | PPP2CA | RAB22A | TGFBR1 |
| BACE1 | CSK | GSK3B | MAD2L1 | NOTCH2 | PPP2CB | RAF1 | TGM1 |
| BACE2 | CSNK2A1 | HADHB | MANF | NPR1 | PPP2R1A | RAP1B | TGM2 |
| BAD | CTNNB1 | HBEGF | MAP2K2 | NR1H2 | PPP2R2A | RARG | THRA |
| BAG1 | CTSA | HCG 1757335 | MAP2K5 | NR1H3 | PPP2R5A | RB1 | TK1 |
| BCAT1 | CXCR4 | HDAC1 | MAP3K3 | NR2C2 | PPP2R5D | RELA | TKT |
| BIRC5 | CXCR7 | HDAC2 | MAP3K4 | NR2F2 | PPP2R5E | RHOA | TLR4 |
| BMP6 | CYLD | HECTD1 | MAPK14 | NUP85 | PPP3CC | RIOK3 | TM4SF1 |
| BMPR1A | DAD1 | HIPK2 | MAPK3 | OCRL | PPP5C | RIPK1 | TNFRSF10B |
| BRAF | DAPK3 | HIPK3 | MAPK6 | OXSR1 | PPP6C | RIPK2 | TRIM28 |
| BUB1 | DCN | HPRT1 | MAPK8 | PAK2 | PREPL | RNF10 | TWF1 |
| BUB1B | DDR1 | HSPA1A | MAPK9 | PASK | PRKACA | RNF5 | TYRO3 |
| CASK | DGKA | HSPA1B | MAPKAPK5 | PBK | PRKACB | ROCK1 | VEGFC |
| CCL2 | DMBT1 | HSPB8 | MARK3 | PCNA | PRKAG1 | ROCK2 | VIPR1 |
| CCNA2 | DNMT1 | HTRA1 | MASTL | PCSK9 | PRKAR1A | ROR2 | VRK2 |
| CCNC | DUSP10 | HUNK | MBTPS1 | PDE8A | PRKAR2A | RPS6KA3 | WNK1 |
| CCND1 | DUSP11 | ICAM1 | MELK | PDGFRB | PRKCA | RPS6KA4 | YES1 |
| CCT2 | DUSP12 | ICK | MET | PDK1 | PRKCI | RPS6KB1 | ZMPSTE24 |
| CD63 | DVL2 | IGF1R | MIF | PGK1 | PRKCZ | RYK | |
| CD82 | DVL3 | IGF2R | MINPP1 | PHPT1 | PRKDC | SHC1 | |
Materialien
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