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Vordefinierte siRNA

MISSION® vordefinierte siRNA wurde mit Hilfe des proprietären Rosetta Inpharmatics siRNA Design-Algorithmus in einer exklusiven Partnerschaft mit Merck & Co. entwickelt. Der Rosetta siRNA Design-Algorithmus nutzt positionsspezifische Bewertungsmatrizes und Wissen über die Keimregion, um die spezifischsten und effektivsten Sequenzen für Ihre Zielgene vorherzusagen. Die Regeln des Algorithmus wurden auf der Grundlage empirischer Daten entwickelt, die in dreijährigen Experimenten zur Genstilllegung gesammelt wurden.

Produktvorteile

  • Erstklassige, garantierte Genstilllegung
  • Effizientes Knockdown gering abundanter Signale
  • Vereinfachte Transfektionsoptimierung mit 11 Positivkontroll-siRNA
  • Unterscheidung zwischen sequenzspezifischer Stilllegung und unspezifischen Effekten mit 8 Negativkontroll-siRNA
  • Hunderte funktional validierter, vordefinierter siRNA

Produktmerkmale

  • Spezies: Mensch, Maus und Ratte
  • Mengen: 2 (10 nmol), 5 (25 nmol) & 10 (50 nmol) OD
  • Aufreinigung: Entsalzen & HPLC
  • Sequenzform: 21mer-Duplexe mit dTdT-Überhängen
  • Qualitätskontrolle: 100 % Massenspektrometrie*
  • Format: Lieferung trocken in Röhrchen

*Je nach Herstellungsort kann PAGE zur Bewertung von siRNA-Duplexen verwendet werden.

Vordefinierte Garantie

Mindestens zwei von drei gekauften MISSION® vordefinierten siRNA, die auf dasselbe Gen abzielen, werden den Ziel-mRNA-Spiegel in kultivierten Zellen um 75 % reduzieren, wenn sie mit einer Konzentration von ≥ 30 nM transfiziert werden. Wenn zwei der siRNA beim Zielgen keinen Knockdown von 75 % bewirken, stellen wir kostenfrei drei weitere siRNA für dieses Gen zur Verfügung. Falls es keine siRNA mehr für dieses Gen gibt oder alle siRNA das Zielgen nicht um 75 % vermindern, erstatten wir den Kaufpreis zurück.
Für die Gültigkeit der Garantie ist der Erhalt geeigneter unterstützender Daten zur Transfektionseffizienz erforderlich. Geeignete unterstützende Daten für die Transfektionseffizienz sollten qPCR-Daten umfassen, die die Ziel-mRNA-Spiegel einer MISSION Positivkontroll-siRNA (GAPDH, MAPK1, TP53 usw.), die mit ≥ 30 nM transfiziert wurde, mit einer geeigneten Negativkontrolle (z. B. eine Mock-Transfektion, eine scrambled siRNA-Sequenz oder eine MISSION Universal Negativkontroll-siRNA) vergleichen, die einen Knockdown der Ziel-mRNA von 75 % belegt.
Aufgrund der Variabilität von Antikörpern und Protein-Halbwertszeiten können wir keine Daten aus proteinbasierten Nachweisverfahren akzeptieren.

 Produktgruppen

Ein beliebtes gepooltes Format sind 4 Duplexe zu je 5 nmol in einem Röhrchen (20 nmol gepoolt) und die gleichen 4 Duplexe zu je 5 nmol in separaten Röhrchen (weitere 20 nmol individuell). Unsere ausgeklügelten Geräte für die Flüssigkeitsverarbeitung bieten jedoch eine Vielzahl weiterer Möglichkeiten. Für eine Machbarkeitsprüfung Ihrer spezifischen Anforderungen wenden Sie sich bitte an [email protected].

Validierte siRNA

Viele häufig vorkommende Gentargets wurden für mRNA-Knockdowns ≥ 75 % validiert (Abbildung 1 mit Beispieldaten und der Tabelle für eine nach Gensymbolen geordnete Liste häufig bestellter, validierter siRNA). Validierte siRNA eignen sich sowohl für die Transfektionsoptimierung als auch für Positivkontrollen.

HeLa-Zellen, die mit vordefinierter siRNA bei einer Konzentration von 30 nM transfiziert wurden.

Abbildung 1.HeLa-Zellen, die mit vordefinierter siRNA bei einer Konzentration von 30 nM transfiziert wurden. Der prozentuale Anteil der verbleibenden Genexpression wurde 48 Stunden nach der Transfektion mittels qPCR gemessen (in Relation zu mock). Die Daten stellen den Mittelwert vier biologischer Replikate dar.

Validierte siRNA nach Gensymbol
ABCC1CDC7DYRK1AIGFBP4MLH1PIK3R4PRPS1SIK2
ACP1CDC73DYRK1BIL6STMSH2PIM2PRSS23SLC16A1
ACP2CDK1EEF2KILKMST4PIN1PSEN1SLC25A17
ACVR1CDK11BEIF2AK4IMPA2MTA2PINK1PSEN2SLC2A1
ACVR1BCDK17EIF4A3INPPL1MTM1PIP4K2BPSMA7SLC30A1
ADAM10CDK2EMR2IP6K1MTMR1PIP5K1APSMB4SLK
ADAM12CDK4ENPP1IP6K2MTMR2PKN2PSMB5SMU1
ADAM15CDK5EPHA5IPMKMTMR3PLAURPSMB6SNRK
ADIPOR1CDK6EPHB4IRAK1MTMR6PLK1PSPHSORT1
ADIPOR2CDK7F3IRAK4MTORPLK4PTK2SRC
ADRBK1CDK8FADDITPK1NADKPOLKPTP4A1SRPK1
AKT1CDK9FDFT1JAK1NCSTNPPAP2CPTPLAST7
AKT2CDKL5FERJUNDNDRG1PPATPTPN1STAT3
ALPLCDKN1BFMNL1JUPNEDD8PPM1DPTPN11STK16
APPCDKN3FURINLANCL1NEK2PPME1PTPN12STK24
ARAFCELSR1FYNLATS1NEK6PPP1CAPTPN14STK3
ARHGDIACERKFZD4LDHANEK7PPP1CBPTPN23STYX
ATF1CHEK1FZD5LEPRNEK9PPP1CCPTPN9TAOK1
ATMCHUKFZD6LGALS3NET1PPP1R11PTPRETAOK3
ATP6V0CCKS2GLTSCR2LIMK2NF1PPP1R12APTPRFTBK1
ATRCLPPGPRC5ALRP5NLNPPP1R2PTPRJTEK
AURKBCPEGRB2LRP6NME1PPP1R3CPTPRKTESK1
AXIN1CPT1AGRK6LTBRNME1-NME2PPP1R7PTPRSTFRC
AXLCRKLGRNLYNNME2PPP2CARAB22ATGFBR1
BACE1CSKGSK3BMAD2L1NOTCH2PPP2CBRAF1TGM1
BACE2CSNK2A1HADHBMANFNPR1PPP2R1ARAP1BTGM2
BADCTNNB1HBEGFMAP2K2NR1H2PPP2R2ARARGTHRA
BAG1CTSAHCG 1757335MAP2K5NR1H3PPP2R5ARB1TK1
BCAT1CXCR4HDAC1MAP3K3NR2C2PPP2R5DRELATKT
BIRC5CXCR7HDAC2MAP3K4NR2F2PPP2R5ERHOATLR4
BMP6CYLDHECTD1MAPK14NUP85PPP3CCRIOK3TM4SF1
BMPR1ADAD1HIPK2MAPK3OCRLPPP5CRIPK1TNFRSF10B
BRAFDAPK3HIPK3MAPK6OXSR1PPP6CRIPK2TRIM28
BUB1DCNHPRT1MAPK8PAK2PREPLRNF10TWF1
BUB1BDDR1HSPA1AMAPK9PASKPRKACARNF5TYRO3
CASKDGKAHSPA1BMAPKAPK5PBKPRKACBROCK1VEGFC
CCL2DMBT1HSPB8MARK3PCNAPRKAG1ROCK2VIPR1
CCNA2DNMT1HTRA1MASTLPCSK9PRKAR1AROR2VRK2
CCNCDUSP10HUNKMBTPS1PDE8APRKAR2ARPS6KA3WNK1
CCND1DUSP11ICAM1MELKPDGFRBPRKCARPS6KA4YES1
CCT2DUSP12ICKMETPDK1PRKCIRPS6KB1ZMPSTE24
CD63DVL2IGF1RMIFPGK1PRKCZRYK 
CD82DVL3IGF2RMINPP1PHPT1PRKDCSHC1 

Materialien

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