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  • Protonated rhodosemiquinone at the Q(B) binding site of the M265IT mutant reaction center of photosynthetic bacterium Rhodobacter sphaeroides.

Protonated rhodosemiquinone at the Q(B) binding site of the M265IT mutant reaction center of photosynthetic bacterium Rhodobacter sphaeroides.

Biochemistry (2015-03-12)
Ágnes Maróti, Colin A Wraight, Péter Maróti
ABSTRACT

The second electron transfer from primary ubiquinone Q(A) to secondary ubiquinone Q(B) in the reaction center (RC) from Rhodobacter sphaeroides involves a protonated Q(B)(-) intermediate state whose low pK(a) makes direct observation impossible. Here, we replaced the native ubiquinone with low-potential rhodoquinone at the Q(B) binding site of the M265IT mutant RC. Because the in situ midpoint redox potential of Q(A) of this mutant was lowered approximately the same extent (≈100 mV) as that of Q(B) upon exchange of ubiquinone with low-potential rhodoquinone, the inter-quinone (Q(A) → Q(B)) electron transfer became energetically favorable. After subsequent saturating flash excitations, a period of two damped oscillations of the protonated rhodosemiquinone was observed. The Q(B)H(•) was identified by (1) the characteristic band at 420 nm of the absorption spectrum after the second flash and (2) weaker damping of the oscillation at 420 nm (due to the neutral form) than at 460 nm (attributed to the anionic form). The appearance of the neutral semiquinone was restricted to the acidic pH range, indicating a functional pK(a) of <5.5, slightly higher than that of the native ubisemiquinone (pK(a) < 4.5) at pH 7. The analysis of the pH and temperature dependencies of the rates of the second electron transfer supports the concept of the pH-dependent pK(a) of the semiquinone at the Q(B) binding site. The local electrostatic potential is severely modified by the strongly interacting neighboring acidic cluster, and the pK(a) of the semiquinone is in the middle of the pH range of the complex titration. The kinetic and thermodynamic data are discussed according to the proton-activated electron transfer mechanism combined with the pH-dependent functional pK(a) of the semiquinone at the Q(B) site of the RC.

MATERIALI
Numero di prodotto
Marchio
Descrizione del prodotto

Sigma-Aldrich
Ethyl alcohol, Pure, 200 proof, ACS reagent, ≥99.5%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ethyl alcohol, Pure, 200 proof, meets USP testing specifications
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acido citrico, meets analytical specification of Ph. Eur., BP, USP, E330, anhydrous, 99.5-100.5% (based on anhydrous substance)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ethyl alcohol, Pure 190 proof, for molecular biology
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acido citrico, ACS reagent, ≥99.5%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
BIS-TRIS propano, ≥99.0% (titration)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Etanolo, BioUltra, Molecular Biology, ≥99.8%, (absolute alcohol, without additive, A15 o1)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acido citrico, ≥99.5%, FCC, FG
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acido citrico, 99%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ferrocene, 98%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Methylamine solution, 33 wt. % in absolute ethanol ((denatured with 1% toluene))
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Methylamine solution, 40 wt. % in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acido citrico, anhydrous, suitable for cell culture, suitable for plant cell culture
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Methylamine solution, 2.0 M in THF
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
USP
1,4-Benzochinone, United States Pharmacopeia (USP) Reference Standard
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Supelco
Etanolo, Pharmaceutical Secondary Standard; Certified Reference Material
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
p-Benzochinone, reagent grade, ≥98%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Supelco
Etanolo, standard for GC
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Etanolo, purum, fine spirit, denaturated with 4.8% methanol, F25 METHYL1, ~96% (based on denaturant-free substance)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Supelco
p-Benzochinone, Pharmaceutical Secondary Standard; Certified Reference Material
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Supelco
Acido citrico, Pharmaceutical Secondary Standard; Certified Reference Material
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acido citrico, BioUltra, anhydrous, ≥99.5% (T)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
USP
Acido citrico, United States Pharmacopeia (USP) Reference Standard
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Methylamine solution, 2.0 M in methanol
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acido citrico, anhydrous, free-flowing, Redi-Dri, ACS reagent, ≥99.5%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
MES solution, BioUltra, Molecular Biology, 0.5 M in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Etanolo
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Etanolo, purum, fine spirit, denaturated with 2% 2-butanone, F25 MEK1, ~96% (based on denaturant-free substance)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
BIS-TRIS propano, BioXtra, ≥99.0% (titration)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Supelco
Ethanol solution, certified reference material, 2000 μg/mL in methanol
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili