MBD0050

Akkermansia muciniphila Sonda FISH-ATTO488

Probe for fluorescence in situ hybridization (FISH), 20µM in water

• NACRES: NA.54
• UNSPSC Code: 41105500

Właściwości

• Quality Segment: 200
• technique(s): FISH: suitable
• fluorescence: λ_ex 504 nm; λ_em 521 nm
• shipped in: dry ice
• storage temp.: −20°C

Opis

General description

Technika fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ (FISH) opiera się na hybrydyzacji fluorescencyjnie znakowanej sondy oligonukleotydowej do określonej komplementarnej sekwencji DNA lub RNA w całych i nienaruszonych komórkach.Mikrobiologiczna FISH umożliwia wizualizację, identyfikację i izolację bakterii dzięki rozpoznawaniu rybosomalnego RNA również w próbkach niekulturowych. Technika FISH może służyć jako potężne narzędzie w dziedzinie badań mikrobiomu, umożliwiając obserwację natywnych populacji drobnoustrojów w różnych środowiskach mikrobiomu, takich jak próbki pochodzenia ludzkiego (krew3 i tkanki4), ekologia drobnoustrojów (stałe biofilmy5 i systemy wodne6) oraz rośliny7. Zdecydowanie zaleca się uwzględnienie kontroli pozytywnych i negatywnych w testach FISH, aby zapewnić specyficzne wiązanie sondy będącej przedmiotem zainteresowania i odpowiednie warunki protokołu. Oferujemy sondy kontroli pozytywnej (MBD0032/33) i negatywnej (MBD0034/35), które towarzyszą konkretnej sondzie będącej przedmiotem zainteresowania. Sonda Akkermansia muciniphila specyficznie rozpoznaje komórki Akkermansia muciniphila. Akkermansia muciniphila to bakteria Gram-ujemna, o owalnym kształcie, niemotylna, nietworząca zarodników, ściśle beztlenowa.8 A. m uciniphila zamieszkuje przewód pokarmowy ponad 90% dorosłych i stanowi od 1 do 4% mikrobioty kałowej.9 Jest to jeden z 20 najliczniejszych gatunków wykrywanych w ludzkich jelitach.10 Warstwa śluzu ludzkiego jelita jest niszą, która jest kolonizowana przez specyficzne bakterie, takie jak A. muciniphila. A. muciniphila może rozkładać mucynę, kluczowy składnik śluzu, przy użyciu enzymów sialidazy i fukozydazy, i wykorzystywać ją jako źródło węgla i azotu.11 W rezultacie gospodarz wytwarza dodatkowy śluz, podczas gdy bakteria wytwarza oligosacharydy i krótkołańcuchowe kwasy tłuszczowe (SCFA), które mogą być wykorzystywane przez gospodarza i wyzwalać układ odpornościowy. Dodatkowym efektem ochronnym SCFA jest stymulacja wzrostu mikrobioty związanej ze śluzem, która służy jako bariera przed przenikaniem patogenów do komórek jelitowych.9,12 Stwierdzono, że obfitość A. muciniphila w jelicie była skorelowana ze zdrowym jelitem i odwrotnie skorelowana z wieloma stanami chorobowymi.11 W porównaniu ze zdrowymi osobami z grupy kontrolnej, poziom A. muciniphila był niski u pacjentów z zaburzeniami jelitowymi, takimi jak nieswoiste zapalenie jelit (IBD), ale także w innych schorzeniach, takich jak autyzm, atopia i otyłość.11,13-16 Dlatego też sugeruje się, że poziom A. muciniphila może służyć jako biomarker zdrowego jelita.17 A. muciniphila jest obiecującym potencjalnym probiotykiem, który może być podawany w leczeniu chorób takich jak zapalenie jelita grubego, zespoły metaboliczne, choroby immunologiczne i nowotwory.10 Technika FISH została z powodzeniem wykorzystana do identyfikacji A. muciniphila za pomocą sondy w różnych próbkach, takich jak czysta hodowla (jak opisano w legendzie rysunku18), próbki kału19-21, zawartość światła jelita22, próbki wyrostka robaczkowego23, zawartość i tkanka jelita ślepego24,25 i tkanka okrężnicy26. Sonda może być również stosowana do FISH w połączeniu z cytometrią przepływową (FCM-FISH)19,20,21 oraz FISH w połączeniu z mikrospektroskopią Ramana

Features and Benefits

• Wizualizacja, identyfikacja i izolacja komórek Akkermansia muciniphila.
• Obserwacja natywnych populacji komórek A. muciniphila w różnych środowiskach mikrobiomu.
• Specyficzna, czuła i niezawodna identyfikacja A. muciniphila w mieszanej populacji bakterii.
• Specyficzna, czuła i niezawodna identyfikacja nawet w przypadku niskiej liczebności A. muciniphila w próbce.
• FISH może uzupełnić metody wykrywania oparte na PCR, unikając wykrywania bakterii zanieczyszczających.
• Dostarcza informacji na temat morfologii A. muciniphila.
• Identyfikuje A. muciniphila w próbkach klinicznych, takich jak zawartość światła jelita, próbki wyrostka robaczkowego (utrwalone w formalinie próbki zatopione w parafinie (FFPE)), próbki kału i tkanki okrężnicy.
• Zdolność do wykrywania A. muciniphila w jego naturalnym środowisku jest niezbędnym narzędziem do badania interakcji gospodarz-mikrobiom.

Ta strona może zawierać tekst przetłumaczony maszynowo.

Informacja o środkach bezpieczeństwa

• Klasa składowania: 12 - Non Combustible Liquids
• Co się dzieje?: WGK 1