OligoEvaluator™ 用于 T_m 计算和引物分析

OligoEvaluator™ 用于 DNA 或 RNA 引物

OligoEvaluator 是一款用于寡核苷酸的引物分析工具。它可分析寡核苷酸的二级结构、引物二聚体形成和物理特性。

我们很高兴为您提供 OligoEvaluator™，这是我们的在线寡核苷酸序列计算器，可为 PCR 提供引物分析值：

• 碱基数
• 分子量
• 消光系数
• 寡聚物类型

• 在 260 纳米波长下的微克/OD
  
• 长度（碱基对）
• 引物熔化温度 Tm (°C)

• GC含量%
  
• GC钳位
• 运行长度（bp）

• 二级结构
  
• 二聚体检查
  
• BLAST序列链接

OligoEvaluator™使用简单：选择 DNA 或 RNA，粘贴序列，然后点击计算，OligoEvaluator™ 工具就会返回数值。所有报告的属性都可以导出到方便的 Excel 模板中。

计算寡核苷酸属性、重悬浮和稀释

OligoEvaluator™ 由三个模块组成。选择分析，一次最多可查看 10 个引物的完整属性。重悬和稀释是 OligoEvaluator™ 中独立的计算器模块。

模块	特性
分析	一次最多可输入 10 个序列，该工具会返回所有主要物理性质的值，如分子量、熔化温度、二级结构和引物二聚体形成（二级结构和引物二聚体形成信息以简单易懂的文本格式提供，如"......"）。g.二级结构--strong）
重悬	输入数量、所需浓度和分子量，工具将返回重悬干燥寡核苷酸所需的水或缓冲液体积 <
稀释	输入原液（重悬浮）浓度、所需最终体积和所需最终浓度，工具会返回稀释所需的原液体积

计算器高级功能
描述
反应条件
BLAST 搜索	检查寡核苷酸序列同源性

反应条件

OligoEvaluator™ 计算器中使用的定义和数值

。

参数	值
Oligo 浓度	默认值 = 250.0 nM.
单价离子浓度	这是反应混合物中所有单价离子（如 K+）的浓度。K+ 通过减少带负电的引物和模板骨架之间的电荷排斥，促进退火。
游离 Mg++ 离子浓度	这是反应混合物中 Mg2+ （镁离子）的浓度。Mg2+ 是恒温 DNA 聚合酶所需的辅助因子。 默认值 = 5.0 mM。
Na[+] 总当量	钠当量的计算方法如下： [Na+] = 单价离子浓度 + 4 × (游离 Mg2+) 1/2 （均为摩尔浓度） 默认值 = 382.84 mM
自由能计算温度	该值用于计算吉布斯自由能 (ΔG)，公式为：ΔG = ΔH - T ΔS。 默认值 = 25.0 °C (298K)。

如何计算引物的退火温度？

OligoEvaluator™ 提供寡核苷酸的熔化温度。只需在计算器分析模块中输入序列，您就会发现第七栏中报告了 T_m 。退火温度通常应比 T_m 值低几度。您可以在我们关于配位核苷酸熔化温度的文章中找到有关熔化温度的更多详细信息。

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