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Merck

A gemcitabine sensitivity screen identifies a role for NEK9 in the replication stress response.

Nucleic acids research (2014-09-14)
Scott C Smith, Aleksandra V Petrova, Matthew Z Madden, Hongyan Wang, Yunfeng Pan, Matthew D Warren, Claire W Hardy, Dong Liang, Elaine A Liu, M Hope Robinson, Soumon Rudra, Jie Wang, Shahrzad Ehdaivand, Mylin A Torres, Ya Wang, David S Yu
ABSTRACT

The Replication Stress Response (RSR) is a signaling network that recognizes challenges to DNA replication and coordinates diverse DNA repair and cell-cycle checkpoint pathways. Gemcitabine is a nucleoside analogue that causes cytotoxicity by inducing DNA replication blocks. Using a synthetic lethal screen of a RNAi library of nuclear enzymes to identify genes that when silenced cause gemcitabine sensitization or resistance in human triple-negative breast cancer cells, we identified NIMA (never in mitosis gene A)-related kinase 9 (NEK9) as a key component of the RSR. NEK9 depletion in cells leads to replication stress hypersensitivity, spontaneous accumulation of DNA damage and RPA70 foci, and an impairment in recovery from replication arrest. NEK9 protein levels also increase in response to replication stress. NEK9 complexes with CHK1, and moreover, NEK9 depletion impairs CHK1 autophosphorylation and kinase activity in response to replication stress. Thus, NEK9 is a critical component of the RSR that promotes CHK1 activity, maintaining genome integrity following challenges to DNA replication.

MATERIALI
Numero di prodotto
Marchio
Descrizione del prodotto

Sigma-Aldrich
Ethyl alcohol, Pure 200 proof, Molecular Biology
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acqua, suitable for HPLC
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Sigma-Aldrich
Ethyl alcohol, Pure, 200 proof, ACS reagent, ≥99.5%
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Sigma-Aldrich
Acqua, Nuclease-Free Water, for Molecular Biology
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Sigma-Aldrich
Ethyl alcohol, Pure, 200 proof, meets USP testing specifications
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Sigma-Aldrich
Acqua, sterile-filtered, BioReagent, suitable for cell culture
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Sigma-Aldrich
Ethyl alcohol, Pure, 200 proof, anhydrous, ≥99.5%
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Sigma-Aldrich
Acqua, HPLC Plus
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Sigma-Aldrich
DAPI, for nucleic acid staining
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Sigma-Aldrich
Sodium fluoride, ACS reagent, ≥99%
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Sigma-Aldrich
Acqua, Deionized
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Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, Molecular Biology, DNase, RNase, and protease, none detected, ≥99% (titration)
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Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, 5 M in H2O, BioReagent, Molecular Biology, suitable for cell culture
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Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, BioXtra, ≥99.5% (AT)
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Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥99%
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Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, 0.9% in water, BioXtra, suitable for cell culture
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Sigma-Aldrich
Ioduro di propidio, ≥94.0% (HPLC)
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Sigma-Aldrich
Fenil metansolfonile fluoruro, ≥98.5% (GC)
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Sigma-Aldrich
Ethyl alcohol, Pure, 190 proof, ACS spectrophotometric grade, 95.0%
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Sigma-Aldrich
Anticorpo anti fosfo-istone H2A.X (Ser139), colone JBW301, clone JBW301, Upstate®, from mouse
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Supelco
Acqua, suitable for ion chromatography
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Sigma-Aldrich
Etanolo, ACS reagent, prima fine spirit, without additive, F15 o1
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Sigma-Aldrich
Acqua, for embryo transfer, sterile-filtered, BioXtra, suitable for mouse embryo cell culture
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Sigma-Aldrich
Etanolo, BioUltra, Molecular Biology, ≥99.8%, (absolute alcohol, without additive, A15 o1)
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Sigma-Aldrich
Acqua, Molecular Biology, sterile filtered
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Sigma-Aldrich
Etanolo, purum, absolute ethanol, denaturated with 4.8% isopropanol, A15 IPA1, ≥99.8% (based on denaturant-free substance)
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SAFC
Sodio cloruro, 5 M
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Sigma-Aldrich
Nocodazolo, ≥99% (TLC), powder
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Sigma-Aldrich
Fenil metansolfonile fluoruro, ≥99.0% (T)
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Sigma-Aldrich
Idrossiurea, 98%, powder
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