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Suppression of problematic compound oligomerization by cosolubilization of nondetergent sulfobetaines.

ChemMedChem (2015-03-12)
Yumiko Mizukoshi, Koh Takeuchi, Misa Arutaki, Takeshi Takizawa, Hiroyuki Hanzawa, Hideo Takahashi, Ichio Shimada
ABSTRACT

Numerous small organic compounds exist in equilibrium among monomers, soluble oligomers, and insoluble aggregates in aqueous solution. Compound aggregation is a major reason for false positives in drug screening, and even soluble oligomers can interfere with structural and biochemical analyses. However, an efficient way to manage the equilibrium of aggregation-prone compounds, especially those involved with soluble oligomers, has not been established. In this study, solution NMR spectroscopy was used as a suitable technique to detect compound oligomers in equilibrium, and it was demonstrated that cosolubilization of nondetergent sulfobetaines (NDSBs) can largely suppress compound oligomerization and aggregation by shifting the equilibrium toward the monomers. The rotational correlation time was obtained from the ratio of the selective and nonselective longitudinal NMR relaxation times, which directly and quantitatively reflected the apparent sizes of the compounds in the equilibrium. The rotational correlation time of the aggregation-prone compound SKF86002 (1 mM) was substantially reduced from 0.31 to 0.23 ns by cosolubilization of 100 mM NDSB195. NDSB cosolubilization allowed us to perform successful structural and biochemical experiments with substantially fewer artifacts, which represents a strategy to directly resolve the problematic oligomerization and aggregation of compounds.

MATERIALI
Numero di prodotto
Marchio
Descrizione del prodotto

Sigma-Aldrich
Dimetil solfossido, Hybri-Max, sterile-filtered, BioReagent, suitable for hybridoma, ≥99.7%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Dimetil solfossido, ACS reagent, ≥99.9%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Dimetil solfossido, Molecular Biology
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Sigma-Aldrich
Dimetil solfossido, suitable for HPLC, ≥99.7%
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Sigma-Aldrich
Ossido di deuterio, 99.9 atom % D
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Dimetil solfossido, sterile-filtered, BioPerformance Certified, meets EP, USP testing specifications, suitable for hybridoma
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Dimetil solfossido, ReagentPlus®, ≥99.5%
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Sigma-Aldrich
Dimetil solfossido, ≥99.5% (GC), suitable for plant cell culture
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Sigma-Aldrich
DL-Dithiothreitol solution, BioUltra, Molecular Biology, ~1 M in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, Molecular Biology, DNase, RNase, and protease, none detected, ≥99% (titration)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, 5 M in H2O, BioReagent, Molecular Biology, suitable for cell culture
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, BioXtra, ≥99.5% (AT)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, BioReagent, suitable for cell culture, suitable for insect cell culture, suitable for plant cell culture, ≥99%
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Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, 0.9% in water, BioXtra, suitable for cell culture
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Supelco
DL-Dithiothreitol solution, 1 M in H2O
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Sigma-Aldrich
Ossido di deuterio, 99.9 atom % D, contains 0.05 wt. % 3-(trimethylsilyl)propionic-2,2,3,3-d4 acid, sodium salt
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Sigma-Aldrich
Nω-Nitro-L-arginine methyl ester hydrochloride, ≥97% (TLC), powder
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Sigma-Aldrich
L-arginina, not synthetic, meets EP, JP, USP testing specifications, suitable for cell culture, 98.5-101.0%
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Sigma-Aldrich
Dimetil solfossido, BioUltra, Molecular Biology, ≥99.5% (GC)
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Sigma-Aldrich
N-succinil-Ala-Ala-Pro-Phe-p-nitroanilide
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, 5 M
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SAFC
Sodio cloruro, 5 M
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Sigma-Aldrich
Potassium phosphate tribasic, reagent grade, ≥97%
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SAFC
L-arginina
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Sigma-Aldrich
L-arginina, reagent grade, ≥98% (HPLC), powder
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Sigma-Aldrich
Dimetil solfossido, meets EP testing specifications, meets USP testing specifications
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, BioUltra, Molecular Biology, ≥99.5% (AT)
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Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, meets analytical specification of Ph. Eur., BP, USP, 99.0-100.5%
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Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, BioUltra, Molecular Biology, ~5 M in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio cloruro, 99.999% trace metals basis
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