03-310

Odczynnik in vivo SHAPE do analizy struktury RNA w żywych komórkach

liquid

• Synonim(y): Odczynnik SHAPE
• UNSPSC Code: 12161503
• NACRES: NA.32
• eCl@ss: 32161000
• Form: liquid
• Storage temp.: -10 to -25°C

Właściwości

• Nazwa produktu: Odczynnik in vivo SHAPE do analizy struktury RNA w żywych komórkach, permits the analysis of RNA structure in living cells
• Quality Segment: 100
• form: liquid
• manufacturer/tradename: Upstate^®
• concentration: 2 M
• technique(s): activity assay: suitable (reverse transcriptase)
• shipped in: dry ice
• storage temp.: -10 to -25°C

Opis

General description

Cechy i zalety

• Gotowy do użycia roztwór bez RNazy
• Niska toksyczność umożliwia stosowanie z żywymi komórkami
• Wysoka przepuszczalność komórek dla szybkiej modyfikacji RNA
• Reaguje ze wszystkimi nukleotydami RNA bez uprzedzeń, umożliwiając mapowanie w wysokiej rozdzielczości

Odczynnik In Vivo SHAPE służy do określania struktury RNA. Odczynnik ten zawiera wysoce czystą formę imidazolidu kwasu 2-metylonikotynowego (NAI). Związek ten tworzy 2'-O-addukty na jednoniciowych regionach RNA, które można wykryć za pomocą selektywnej 2'-hydroksylowej acylacji i wydłużania primera (SHAPE).

W przeciwieństwie do innych odczynników stosowanych w metodzie SHAPE, oparty na NAI odczynnik In Vivo SHAPE jest szybko wchłaniany przez komórki i ma niski poziom toksyczności, dzięki czemu idealnie nadaje się do stosowania z żywymi komórkami. W przeciwieństwie do innych odczynników stosowanych do analizy SHAPE, odczynnik In Vivo SHAPE reaguje w sposób bezstronny ze wszystkimi czterema nukleotydami RNA. To połączenie niskiej toksyczności, szybkiego wchłaniania i braku stronniczości nukleotydów umożliwia analizę struktury RNA w wysokiej rozdzielczości w różnych żywych systemach.

Fałdowanie do struktur wyższego rzędu pozwala RNA funkcjonować wewnątrz żywych komórek i tworzyć dynamiczne kompleksy z białkami efektorowymi. Przewidywanie tych struktur 3D jest wyzwaniem, dlatego opracowano szereg technik sondowania w celu zbadania fałdowania RNA.

Związki takie jak imidazolid kwasu 2-metylonikotynowego (NAI) zawarte w odczynniku In Vivo SHAPE powodują powstawanie 2-O-adduktów. Addukty te tworzą się szybko na jednoniciowym niesparowanym RNA i znacznie wolniej na sparowanym (dwuniciowym) RNA. Zmodyfikowany RNA może być następnie analizowany przez wydłużenie primera. Zmodyfikowane nukleotydy nie są wydłużane przez polimerazy DNA zależne od RNA, co pozwala na wykrycie miejsc modyfikacji.

Physical form

2M NAI w DMSO

Fiolka 0,5 ml zawierająca 2M NAI (>97% czystości) w roztworze DMSO

Preparation Note

NAI należy przechowywać w temperaturze -20°C w zamrażarce chronionej przed światłem. Przy prawidłowym przechowywaniu (ochrona przed światłem i unikanie nadmiernych cykli zamrażania-rozmrażania) produkt jest stabilny przez okres do 6 miesięcy od daty otrzymania.

Analysis Note

Purity of NAI compound is tested by HPLC.

Other Notes

2-methylnicotinic acid imidazolide (NAI) in DMSO

Legal Information

UPSTATE is a registered trademark of Merck KGaA, Darmstadt, Germany

Disclaimer

O ile nie określono inaczej w naszym katalogu lub innej dokumentacji firmy dołączonej do produktu(-ów), nasze produkty są przeznaczone wyłącznie do użytku badawczego i nie mogą być wykorzystywane do żadnych innych celów, w tym między innymi do nieautoryzowanych zastosowań komercyjnych, zastosowań diagnostycznych in vitro, zastosowań terapeutycznych ex vivo lub in vivo lub jakiegokolwiek rodzaju konsumpcji lub zastosowania u ludzi lub zwierząt.

Ta strona może zawierać tekst przetłumaczony maszynowo.

Informacja o środkach bezpieczeństwa

• Klasa składowania: 10 - Combustible liquids
• wgk: WGK 3