代謝組學研究

代謝組學是對細胞、生物液體、組織或生物體內的代謝物,或新陳代謝的小分子底物、中間物和產物進行的綜合研究。這些獨特的化學指紋是細胞過程留下的。代謝組學研究提供生物系統的生化概要,以及疾病、營養、治療或基因改造對生物體的生理影響。
特色類別
新陳代謝組的應用
新陳代謝組的應用範圍廣泛,透過鑑定疾病生物標誌物及評估個人化藥物的毒性,對製藥研究產生重大影響。在功能基因組學整合方面,它透過研究基因組、轉錄組、蛋白質組和代謝組之間的互動關係,在預測基因功能方面扮演著舉足輕重的角色。微生物挖掘可受益於代謝組學的洞察力,以加強菌株優化,而 植物代謝組學透過植物代謝物的研究,促進農業生物科技的發展。環境研究利用代謝組學來測試污染物的影響和優化生物燃料的生產,而營養研究則利用代謝組學來評估營養水平和確保食品安全。
瞭解代謝物和代謝體
生物系統內代謝物之間的相互作用稱為代謝體。代謝體是生物體或生物樣本中代謝物的完整集合。代謝物是低分子量的化合物,一般小於 1.5 KDa,是生物合成/新陳代謝途徑的中間物或產物。範例包括 氨基酸、nucleotides, 脂類,在脂質組學研究中通常會將它們分開研究。一次代謝產物是 內源的,直接參與正常的生長、發育和繁殖。次生代謝物是外源性的,不參與這些過程,但具有重要的生態功能。
代謝體學通路和分析技術
代謝體學通路是利用代謝物、酵素、分離工具以及代謝物分析和標記來研究的。兩種常見的代謝分析技術是靶向和非靶向代謝分析。靶向分析可量化特定的已知代謝物,而非靶向分析則可提供已知和未知代謝物的全局代謝譜。
代謝組學工作流程和分析方法
代謝組學工作流程包括樣品製備、標準化、校正、分離方法、檢測代謝物和數據分析的整合方法。常見的樣品類型包括血漿、尿液、唾液、組織和細胞。氣相層析 (GC)、高效液相層析 (HPLC) 或毛細管電泳 (CE) 等分離方法會搭配質譜法 (MS) 等檢測方法。常用於檢測代謝物的分析技術包括 MS、核磁共振 (NMR)、傅立葉轉換紅外線 (FT-IR) 光譜和拉曼光譜。代謝組學資料分析需要精密的工具和軟體,以確保嚴格的化合物鑑別和定量,以及準確的資料詮釋。
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