Epigenetik

Modifikasi Histone

Kromatin adalah kompleks DNA genom dan protein yang terkait di dalam nukleus. Modifikasi struktur kromatin dan interaksi protein kromatin berperan langsung dalam regulasi epigenetik. Struktur kromatin difasilitasi oleh histon, kelas utama protein kromatin. Histon membentuk nukleosom, sebuah kompleks yang mengandung 2 subunit masing-masing dari histon H2A, H2B, H3 dan H4. Di bagian luar kompleks inti, histon penghubung H1 menempati DNA internukleosom. Kompleks nukleosom ini mempertahankan struktur kromatin yang dipadatkan. Modifikasi histon spesifik lokasi, seperti metilasi, asetilasi, fosforilasi, fosforilasi, ubiquitinasi, dan sitrullinasi, dapat mengubah struktur kromatin lokal dan mengatur transkripsi, perbaikan, rekombinasi, dan replikasi. Protein non-histon yang terkait dengan kromatin adalah kelompok yang beragam dengan ribuan jenis protein yang berbeda, termasuk faktor transkripsi, polimerase, reseptor hormon, dan enzim nuklir lainnya.

Metilasi DNA

Metilasi DNA adalah mekanisme epigenetik penting yang mengatur pembungkaman gen, pencetakan, perkembangan embrionik, dan stabilitas kromosom. Metilasi DNA terjadi pada posisi 5-karbon residu sitosin terutama di dalam dinukleotida CpG untuk membentuk 5-metil sitosin (5-mC). Reaksi ini dikatalisis oleh DNA metiltransferase (DNMT). Residu 5-metilsitosin juga dapat dihidroksilasi oleh enzim TET untuk membentuk 5-hidroksimetilsitosin (5-hmC), yang memiliki peran yang berbeda dari 5-mC. Kami menyediakan alat yang tangguh yang memungkinkan Anda untuk tidak hanya mendeteksi dan mengukur 5-mC dan 5-hmC, tetapi juga untuk secara akurat membedakan antara modifikasi ini.

Kit Imunopresipitasi Kromatin (ChIP)

Deteksi kuantitatif modifikasi histon penting untuk pemahaman yang lebih baik tentang regulasi epigenetik proses seluler dalam jaringan normal atau kanker. Teknik yang paling banyak digunakan untuk mempelajari bagaimana modifikasi histon dan protein pengikat DNA lainnya, seperti faktor transkripsi, memengaruhi ekspresi gen disebut chromatin immunoprecipitation (ChIP) yang dikombinasikan dengan reaksi berantai polimerase kualitatif (qPCR). ChIP melibatkan pengikatan silang protein secara kimiawi dengan sekuens DNA, yang diikuti dengan imunopresipitasi kompleks ikatan silang dengan menggunakan antibodi dan manik-manik untuk menarik histon yang telah dimodifikasi atau protein lain yang diinginkan. Modifikasi histon yang paling sering dipelajari dan paling dipahami adalah asetilasi, fosforilasi, metilasi, dan ubiquitinasi. Modifikasi histone mengatur transkripsi, perbaikan, rekombinasi, dan replikasi DNA, dan dapat mengubah arsitektur kromatin lokal. Jelajahi berbagai macam kit kami untuk menganalisis pola modifikasi histon yang kompleks.

Kontrol Transkripsi dan Pascatranskripsi: Regulasi RNA

Secara tradisional, penelitian ekspresi gen berfokus pada regulasi transkripsi melalui interaksi faktor transkripsi dengan tempat pengikatan spesifik, modifikasi histon di dalam kromatin, dan mengkoordinasikan dinamika kromatin yang terkait dengan perubahan transkripsi gen. Penelitian ekspresi gen saat ini berusaha untuk memahami dinamika regulasi RNA, dengan tujuan akhir menjembatani kesenjangan antara kontrol transkripsi dan ekspresi protein. Protein pengikat RNA (RBP) memainkan peran kunci dalam regulasi pasca-transkripsi ekspresi gen.

Regulasi RNA: Kit Imunopresipitasi Protein Pengikat RNA (RIP)

RIP dapat dilihat sebagai analog RNA dari aplikasi ChIP yang lebih terkenal. RIP dapat digunakan untuk mengidentifikasi molekul RNA spesifik yang terkait dengan protein pengikat nuklir atau sitoplasma tertentu. RIP dimulai dengan imunopresipitasi kompleks endogen protein pengikat RNA dan isolasi bersama spesies RNA yang terkait dengan kompleks imunopresipitasi. Setelah pemurnian spesies RNA ini, mereka dapat diinterogasi dan diidentifikasi sebagai mRNA atau RNA yang tidak dikodekan dengan berbagai aplikasi termasuk RT-PCR kuantitatif, analisis microarray (RIP-Chip), dan sekuensing throughput tinggi (RIP-Seq).