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Merck

Mechanism of Crosstalk between the LSD1 Demethylase and HDAC1 Deacetylase in the CoREST Complex.

Cell reports (2020-02-27)
Yun Song, Lisbeth Dagil, Louise Fairall, Naomi Robertson, Mingxuan Wu, T J Ragan, Christos G Savva, Almutasem Saleh, Nobuhiro Morone, Micha B A Kunze, Andrew G Jamieson, Philip A Cole, D Flemming Hansen, John W R Schwabe
ABSTRACT

The transcriptional corepressor complex CoREST is one of seven histone deacetylase complexes that regulate the genome through controlling chromatin acetylation. The CoREST complex is unique in containing both histone demethylase and deacetylase enzymes, LSD1 and HDAC1, held together by the RCOR1 scaffold protein. To date, it has been assumed that the enzymes function independently within the complex. Now, we report the assembly of the ternary complex. Using both structural and functional studies, we show that the activity of the two enzymes is closely coupled and that the complex can exist in at least two distinct states with different kinetics. Electron microscopy of the complex reveals a bi-lobed structure with LSD1 and HDAC1 enzymes at opposite ends of the complex. The structure of CoREST in complex with a nucleosome reveals a mode of chromatin engagement that contrasts with previous models.

MATERIALI
Numero di prodotto
Marchio
Descrizione del prodotto

Sigma-Aldrich
Acido trifluoroacetico, ReagentPlus®, 99%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Millipore
Gel d′affinità ANTI-FLAG® M2, purified immunoglobulin, buffered aqueous glycerol solution
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
N,N-diisopropiletilammina, ReagentPlus®, ≥99%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Polietilenimina, ramificata, average Mw ~25,000 by LS, average Mn ~10,000 by GPC, branched
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
N,N-diisopropiletilammina, 99.5%, biotech. grade
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Trichostatin A, ≥98% (HPLC), from Streptomyces sp.
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Arg(Pbf)-OH, Novabiochem®
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
SAHA, ≥98% (HPLC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Gly-OH, ≥98.0% (T)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Ala-OH, 95%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Lys(Boc)-OH, ≥98.0% (HPLC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Leu-OH, ≥97.0%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
2-(Methylamino)ethanol, ≥98%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Gln(Trt)-OH, ≥98.0% (HPLC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Pro-OH, ≥90% (HPLC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Trichostatin A, Ready Made Solution, 5 mM in DMSO, from Streptomyces sp.
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Lys(Boc)-OH, Novabiochem®
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Gly-OH, Novabiochem®
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Ser(tBu)-OH, Novabiochem®
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Thr(tBu)-OH, Novabiochem®
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Leu-OH, Novabiochem®
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Gln(Trt)-OH, Novabiochem®
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Ala-OH, Novabiochem®
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Pro-OH, Novabiochem®
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Suberic acid bis(3-sulfo-N-hydroxysuccinimide ester) sodium salt, ≥95% (H-NMR), powder
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
trans-2-Phenylcyclopropylamine hydrochloride
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Fmoc-Lys(Me,Boc)-OH, Novabiochem®
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili