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  • Urine proteome analysis in Dent's disease shows high selective changes potentially involved in chronic renal damage.

Urine proteome analysis in Dent's disease shows high selective changes potentially involved in chronic renal damage.

Journal of proteomics (2015-09-16)
Laura Santucci, Giovanni Candiano, Franca Anglani, Maurizio Bruschi, Enrica Tosetto, Daniela Cremasco, Luisa Murer, Chiara D'Ambrosio, Andrea Scaloni, Andrea Petretto, Gianluca Caridi, Roberta Rossi, Alice Bonanni, Gian Marco Ghiggeri
ABSTRACT

Definition of the urinary protein composition would represent a potential tool for diagnosis in many clinical conditions. The use of new proteomic technologies allows detection of genetic and post-trasductional variants that increase sensitivity of the approach but complicates comparison within a heterogeneous patient population. Overall, this limits research of urinary biomarkers. Studying monogenic diseases are useful models to address this issue since genetic variability is reduced among first- and second-degree relatives of the same family. We applied this concept to Dent's disease, a monogenic condition characterised by low-molecular-weight proteinuria that is inherited following an X-linked trait. Results are presented here on a combined proteomic approach (LC-mass spectrometry, Western blot and zymograms for proteases and inhibitors) to characterise urine proteins in a large family (18 members, 6 hemizygous patients, 6 carrier females, and 6 normals) with Dent's diseases due to the 1070G>T mutation of the CLCN5. Gene ontology analysis on more than 1000 proteins showed that several clusters of proteins characterised urine of affected patients compared to carrier females and normal subjects: proteins involved in extracellular matrix remodelling were the major group. Specific analysis on metalloproteases and their inhibitors underscored unexpected mechanisms potentially involved in renal fibrosis. Studying with new-generation techniques for proteomic analysis of the members of a large family with Dent's disease sharing the same molecular defect allowed highly repetitive results that justify conclusions. Identification in urine of proteins actively involved in interstitial matrix remodelling poses the question of active anti-fibrotic drugs in Dent's patients.

MATERIALI
Numero di prodotto
Marchio
Descrizione del prodotto

Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, BioReagent, suitable for electrophoresis, Molecular Biology, ≥98.5% (GC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ammonium persulfate, ACS reagent, ≥98.0%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, ≥99.0% (GC), dust-free pellets
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
N,N,N′,N′-tetrametil-etilendiammina, BioReagent, suitable for electrophoresis, ≥99.0%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ammonium persulfate, Molecular Biology, suitable for electrophoresis, ≥98%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, ACS reagent, ≥99.0%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, BioUltra, Molecular Biology, 10% in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ammonium persulfate, reagent grade, 98%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acrylamide, suitable for electrophoresis, ≥99%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, ReagentPlus®, ≥98.5% (GC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
N,N,N′,N′-tetrametil-etilendiammina, BioReagent, Molecular Biology, ≥99% (GC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acrylamide, Molecular Biology, ≥99% (HPLC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, BioUltra, Molecular Biology, ≥99.0% (GC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, BioUltra, 20% in H2O
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
N,N,N′,N′-tetrametil-etilendiammina, ≥99.5%, purified by redistillation
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Supelco
Sodio dodecil solfato, dust-free pellets, suitable for electrophoresis, Molecular Biology, ≥99.0% (GC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
N,N,N′,N′-tetrametil-etilendiammina, ReagentPlus®, 99%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acrylamide, suitable for electrophoresis, ≥99% (HPLC), powder
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Acrylamide solution, 40%, suitable for electrophoresis, sterile-filtered
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, BioXtra, ≥99.0% (GC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, ≥98.0% (GC)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ammonium persulfate, BioUltra, ≥98.0% (RT)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, 92.5-100.5% based on total alkyl sulfate content basis
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Ammonium persulfate, BioXtra, ≥98.0%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, ≥90% ((Assay))
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, mixture of sodium alkyl sulfates consisting mainly of sodium dodecyl sulfate
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Adenosine 5′-phosphosulfate sodium salt, ≥85%
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Piperazine diacrylamide, For acrylamide gel electrophoresis
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
3-(Benzyldimethylammonio)propanesulfonate, BioXtra, ≥99.0% (HPCE)
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili
Sigma-Aldrich
Sodio dodecil solfato, BioReagent, suitable for electrophoresis, Molecular Biology, ≥98.5% (GC), free-flowing, Redi-Dri
Prezzi e disponibilità al momento non sono disponibili