用於藥物發現的 DNA 編碼庫技術

DNA編碼文庫(DEL)技術可以高效地篩選和鑒定潛在的候選藥物,為藥物發現帶來了革命性的變化。與傳統的小分子文庫相比,DEL 具有多項優勢,例如能夠在單次實驗中篩選大量化合物、化學品多樣性高、篩選數據資訊豐富等。
現在可以透過 DyNAbind®使用創新的 DEL 技術進行誘導物識別、誘導物優化和靶點解決。 DEL 套件提供預組合的化合物庫和必要的材料、方案和試劑,以實現高通量篩選,從而最大限度地縮短了啟動成本和交付時間。
我們的 DEL 產品:
DYNA001 DNA 編碼片段庫可提高目標篩選的精確度。以片段為基礎的藥物發現採用小分子、低分子量的化合物或片段,作為藥物設計的起點。
DYNA0021,000萬化合物DNA編碼文庫試劑盒包含至少1,000萬個與特定靶點結合的小分子化合物。提供 2 瓶或 5 瓶試劑盒,濃度經過最佳化,因此每瓶只測試單一條件。資料庫的成本包括產生 50 個命中物清單,如果有關聯,則最多可產生 60 個命中物。 所有命中物結構的揭示都不收取額外費用,而且在研發或製造過程中使用命中物也不會產生額外的授權費用。
DELDATA提供從 DYNA002 篩選中獲得的所有命中物的廣泛而詳細的資訊。此資料包可作為開發先進預測模型、最佳化演算法和機器學習策略的催化劑,以進行 AI 驅動的先導藥物發現。
| 1,000 萬 DNA 編碼片段庫 | ||
|---|---|---|
| Library Size | 370,000 片段對 | 1,000萬 小分子化合物 |
| 化合物類型 | 尋找成對片段 | 尋找由三個片段組成的命中 |
| 連結狀態 | 已連結的片段 | |
| 命中方法 | 小尺寸片段增加找到命中的機會& | 大規模的文庫增加找到命中的機會 |
| 研究階段 | 需要更多的開發工作來形成一個化合物 | 化合物的開發進程較遠 |
| 所需的開發 | 開發的彈性較高 | 開發中較具彈性 |
| 包裝 | 5小瓶 | 2小瓶或5小瓶 |
| 結構資訊 | 僅提供命中結構 | 所有結構可與資料共享協議 |
DELs如何運作?
在DNA編碼圖庫中,每個化學結構都附有一個獨特的DNA序列,作為條碼。這個 DNA 標籤會編碼所附化學結構的相關資訊,因此每個結構都是唯一可識別的。這項技術可創造出大量不同結構的資料庫。在篩選過程中,庫會接觸到目標蛋白質,例如與疾病有關的酵素或受體。與目標蛋白質結合的化學結構會連同其 DNA 標籤附著在目標蛋白質上。在結合步驟之後,非結合者會被洗掉,只留下成功結合到目標蛋白質的結構。 接著會對成功結合到目標蛋白質的結構的 DNA 標籤進行次世代測序,找出與目標蛋白質互動的結構,並揭示潛在的候選藥物。
主要優點
- 增強化學多樣性:由於可以同時編碼和篩選大量的化合物,DELs 提供了存取巨大化學多樣性的機會。這種多樣性可以探索廣泛的化學空間,增加鑑定新穎且有效化合物的機會。
- 高通量篩選:DEL 可以在單次實驗中篩選數百萬到數十億種化合物,從而快速識別出新的化合物。這種高通量篩選能力可加速先導藥物的發現過程,並縮短識別潛在候選藥物所需的時間。
- 成本和時間效率:DNA 編碼庫的使用減少了篩選所需的材料量,也省去了個別化合物的純化和處理,簡化了工作流程並將成本降至最低。
DEL 的應用
DEL 對於靶點驗證研究很有價值,讓研究人員能夠鑑定和驗證潛在的藥物靶點。此外,DEL 可用於以片段為基礎的先導藥物生成,即針對感興趣的靶點篩選小分子片段,以識別先導藥物進行後續優化。此外,DNA 編碼庫在化學生物學研究中也被證實非常有用,可以用來了解目標互作、識別蛋白質與蛋白質之間的互作,以及探索新的化學空間。
相關資源
- 片段式 DNA 編碼資料庫
藥物發現中的動態庫技術提供可靠的結果,具有高度的化學多樣性,適用於各種靶點。
- Future of Drug Discovery with DNA Encoded Libraries
DNA encoded libraries (DELs) offer a paradigm shift in drug discovery by leveraging molecular biology and high-throughput screening. DELs offer a full high-throughput screening library in one vial. Along with our DEL data package, machine learning and AI can be utilized to determine even more information on targets.
- Shaping the Future of Drug Discovery with DNA-Encoded Libraries
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