A6013

Agarose

Type I, low EEO

• Synonym(e): 3,6-Anhydro-α-L-galacto-β-D-galactan, Agarose LE
• CAS-Nummer: 9012-36-6
• EG-Nummer: 232-731-8
• MDL-Nummer: MFCD00081294
• UNSPSC-Code: 41105317
• PubChem Substanz-ID: 24891047
• NACRES: NA.25

Eigenschaften

• Biologische Quelle: algae (Gelidium & Gracilaria)
• Qualitätsniveau: 200
• Typ: Type I
• Form: powder
• Methode(n): electrophoresis: suitable
• Verunreinigungen: ≤10% water
• EEO: 0.09-0.13
• Übergangstemp.: gel point 36 °C ±1.5 °C (1.5% gel)
• Gelstärke: ≥1200 g/cm² (1% gel)
• Anionenspuren: sulfate (SO₄^2-): ≤0.15%
• Eignung: suitable for electrophoresis
• SMILES String: O1[C@H]([C@@H]([C@H]([C@H]([C@H]1CO)O)O[C@@H]4O[C@@H]5[C@H]([C@@H](OC5)[C@@H]4O)O[C@@H]6O[C@@H]([C@@H]([C@@H]([C@H]6O)O)O)CO)O)O[C@H]2[C@H]3OC[C@@H]2O[C@H]([C@H]3O)O
• InChI: 1S/C24H38O19/c25-1-5-9(27)11(29)12(30)22(38-5)41-17-8-4-36-20(17)15(33)24(40-8)43-18-10(28)6(2-26)39-23(14(18)32)42-16-7-3-35-19(16)13(31)21(34)37-7/h5-34H,1-4H2/t5-,6-,7+,8+,9+,10+,11+,12-,13+,14-,15+,16-,17-,18+,19+,20+,21-,22+,23+,24+/m1/s1
• InChIKey: MJQHZNBUODTQTK-WKGBVCLCSA-N

Beschreibung

Allgemeine Beschreibung

Agarose ist ein aus rotem Seetang der Spezies Gelidium und Gracilaria isoliertes Polymer und wird häufig für die Trennung von Nukleinsäuren verwendet. Typ-I-Agarose wird häufig in der Molekularbiologie zur Herstellung von Agarosegelen für die Elektrophorese verwendet. Dabei handelt es sich um ein Verfahren zur Trennung und Analyse von DNA- oder RNA-Fragmenten oder Proteinen auf Basis ihrer Größe. Agarose kann auch in Pflanzenzellkulturen zur Herstellung von Hydrogelen verwendet werden. Dabei handelt es sich um ein gelartiges Material, das eine dreidimensionale Matrix bietet. Dies bietet eine günstige und biokompatible Umgebung für Pflanzenzellen und imitiert die physiologischen Bedingungen für Experimente in vivo. Sie ist vielseitig einsetzbar für verschiedene Anwendungen in der Pflanzenbiologie, wie z. B. zur Untersuchung von Zellwachstum, Gewebekulturen und Analyse von Pflanzenreaktionen auf verschiedene Stimuli.

Anwendung

Die Typ-1-Agarose wird häufig wie folgt in der Molekularbiologie eingesetzt:

• für die Gelelektrophorese von DNA- und RNA-Molekülen[1][2]
• zur Agarose-Überlagerung in Zellkulturen zur Messung der antibakteriellen Aktivität durch Radialdiffusion[3]
• zur Agarose-Überlagerung in Zellkulturen für Radialimmundiffusions-Assays zur Quantifizierung von Antigenen[4]
• zur Agarose-Überlagerung in Plaque-Assays zur Bestimmung des Virustiters
• zur Vorbereitung von Agarose-Hydrogel zur Verkapselung eines viskosen Mediums für 3D-Zellkulturen[5]
• als Bestandteil von humanen gewebeähnlichen MRT-Phantomen[6]
• zur diagnostischen Analyse von Patientenproben auf das MRSA-Genom mittels Pulsed-Field-Gelelektrophorese[2]

Leistungsmerkmale und Vorteile

• Agarose mit niedrigem EEO-Wert für die routinemäßige Analyse von Nukleinsäuren
• Geeignet für die Elektrophorese: DNase- & RNase-frei
• Geeignet für Pflanzenzellkulturen
• Geeignet für Säugetierzellkulturen

Hinweis zur Analyse

Nachfolgend finden Sie eine Liste der Eigenschaften unserer Agarosen:
Sulfatgehalt - dient als Indikator für die Reinheit, da Sulfat die hauptsächlich vorhandene Ionengruppe ist.
Gelstärke - die Kraft, die aufgewendet werden muss, damit ein Gel zerbricht.
Gelierpunkt - die Temperatur, bei der die wässrige Agaroselösung beim Abkühlen geliert. Agaroselösungen zeigen beim Übergang von der Flüssigkeit zum Gel Hysterese - das bedeutet, dass die Temperatur des Gelierpunkts nicht dieselbe ist wie die Schmelztemperatur.
Elektroendosmose (EEO) - Bewegung einer Flüssigkeit durch das Gel. Anionische Gruppen sind in einem Agarosegel an die Matrix gebunden und können sich nicht bewegen, aber dissoziierbare Gegenkationen können in der Matrix in Richtung der Kathode wandern und führen zu EEO. Da die elektrophoretische Bewegung der Biopolymere normalerweise in Richtung der Anode stattfindet, kann EEO die Auftrennung aufgrund von interner Konvektion stören.

Sonstige Hinweise

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Sicherheitshinweise

• Lagerklassenschlüssel: 11 - Combustible Solids
• WGK: WGK 1
• Flammpunkt (°F): Not applicable
• Flammpunkt (°C): Not applicable
• Persönliche Schutzausrüstung: Eyeshields, Gloves, type N95 (US)